RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS3-201ENST00000503362 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SPCS3-201ENST00000503362 C20orf194Q5TEA3 1177 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS3-201ENST00000503362 TCP11L2Q8N4U5 519 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS3-201ENST00000503362 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SPCS3-201ENST00000503362 MTHFSP49914 203 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS3-201ENST00000503362 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SPCS3-201ENST00000503362 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
SPCS3-201ENST00000503362 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa16.71■□□□□ 0.27
SPCS3-201ENST00000503362 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
SPCS3-201ENST00000503362 TPRNQ4KMQ1 711 aa16.71■□□□□ 0.27
SPCS3-201ENST00000503362 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SPCS3-201ENST00000503362 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa16.69■□□□□ 0.26
SPCS3-201ENST00000503362 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.68■□□□□ 0.26
SPCS3-201ENST00000503362 GGNBP2Q9H3C7 697 aa16.68■□□□□ 0.26
SPCS3-201ENST00000503362 CABP2Q9NPB3 220 aa16.68■□□□□ 0.26
SPCS3-201ENST00000503362 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.67■□□□□ 0.26
SPCS3-201ENST00000503362 KIF14Q15058 1648 aa16.67■□□□□ 0.26
SPCS3-201ENST00000503362 DISP3Q9P2K9 1392 aa16.67■□□□□ 0.26
SPCS3-201ENST00000503362 WDR62O43379 1518 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS3-201ENST00000503362 RIPK4P57078 832 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS3-201ENST00000503362 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS3-201ENST00000503362 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SPCS3-201ENST00000503362 SLFN5Q08AF3 891 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS3-201ENST00000503362 GBP4Q96PP9 640 aa16.65■□□□□ 0.26
SPCS3-201ENST00000503362 SCAPERQ9BY12 1400 aa16.65■□□□□ 0.26
SPCS3-201ENST00000503362 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa16.65■□□□□ 0.26
SPCS3-201ENST00000503362 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SPCS3-201ENST00000503362 PDE3AQ14432 1141 aa16.65■□□□□ 0.26
SPCS3-201ENST00000503362 DDX19BQ9UMR2 479 aa16.65■□□□□ 0.26
SPCS3-201ENST00000503362 RALGAPBQ86X10 1494 aa16.64■□□□□ 0.25
SPCS3-201ENST00000503362 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.64■□□□□ 0.25
SPCS3-201ENST00000503362 ANKRD45Q5TZF3 282 aa16.64■□□□□ 0.25
SPCS3-201ENST00000503362 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SPCS3-201ENST00000503362 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SPCS3-201ENST00000503362 HDGFP51858 240 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SPCS3-201ENST00000503362 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SPCS3-201ENST00000503362 PZPP20742 1482 aa16.62■□□□□ 0.25
SPCS3-201ENST00000503362 NUTM2FA1L443 756 aa16.62■□□□□ 0.25
SPCS3-201ENST00000503362 TEX14Q8IWB6 1497 aa16.61■□□□□ 0.25
SPCS3-201ENST00000503362 SAMD9Q5K651 1589 aa16.61■□□□□ 0.25
SPCS3-201ENST00000503362 PTMAP06454 111 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SPCS3-201ENST00000503362 ATP10BO94823 1461 aa16.61■□□□□ 0.25
SPCS3-201ENST00000503362 DUSP27Q5VZP5 1158 aa16.6■□□□□ 0.25
SPCS3-201ENST00000503362 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa16.6■□□□□ 0.25
SPCS3-201ENST00000503362 LNPKQ9C0E8 428 aa16.59■□□□□ 0.25
SPCS3-201ENST00000503362 IL27Q8NEV9 243 aa16.59■□□□□ 0.25
SPCS3-201ENST00000503362 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SPCS3-201ENST00000503362 ADAMTS12P58397 1594 aa16.59■□□□□ 0.25
SPCS3-201ENST00000503362 WWC1Q8IX03 1113 aa16.58■□□□□ 0.25
SPCS3-201ENST00000503362 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 SLC4A10Q6U841 1118 aa16.58■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 CFAP44Q96MT7 982 aa16.58■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 KIAA0556O60303 1618 aa16.58■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.58■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 AAMPQ13685 434 aa16.57■□□□□ 0.24
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SPCS3-201ENST00000503362 C22orf23Q9BZE7 217 aa16.57■□□□□ 0.24
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SPCS3-201ENST00000503362 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.56■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 BRPF3Q9ULD4 1205 aa16.56■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 TESK2Q96S53 571 aa16.55■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 PRAG1Q86YV5 1406 aa16.55■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 KIF16BQ96L93 1317 aa16.54■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 DISP1Q96F81 1524 aa16.54■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.54■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa16.54■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 KDM6BO15054 1643 aa16.54■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 COG3Q96JB2 828 aa16.53■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa16.53■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 MCCP23508 829 aa16.53■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 PLCB2Q00722 1185 aa16.53■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 CHMP5Q9NZZ3 219 aa16.53■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 DDX11L8A8MPP1 907 aa16.52■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 WDR63Q8IWG1 891 aa16.52■□□□□ 0.24
SPCS3-201ENST00000503362 STK31Q9BXU1 1019 aa16.52■□□□□ 0.23
SPCS3-201ENST00000503362 NSD3Q9BZ95 1437 aa16.52■□□□□ 0.23
SPCS3-201ENST00000503362 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
SPCS3-201ENST00000503362 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SPCS3-201ENST00000503362 HMMRO75330 724 aa16.51■□□□□ 0.23
SPCS3-201ENST00000503362 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.5■□□□□ 0.23
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SPCS3-201ENST00000503362 FAM135AQ9P2D6 1515 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS3-201ENST00000503362 PTMSP20962 102 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS3-201ENST00000503362 KCNJ4P48050 445 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS3-201ENST00000503362 PRAM1Q96QH2 718 aa16.49■□□□□ 0.23
SPCS3-201ENST00000503362 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16.49■□□□□ 0.23
SPCS3-201ENST00000503362 OSCARQ8IYS5 282 aa16.49■□□□□ 0.23
SPCS3-201ENST00000503362 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SPCS3-201ENST00000503362 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SPCS3-201ENST00000503362 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa16.48■□□□□ 0.23
SPCS3-201ENST00000503362 PRKAR2BP31323 418 aa16.48■□□□□ 0.23
SPCS3-201ENST00000503362 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SPCS3-201ENST00000503362 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SPCS3-201ENST00000503362 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SPCS3-201ENST00000503362 MVPQ14764 893 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
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