RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501011.6

RAB30-AS1-201, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAB30-AS1, Length 607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.07■□□□□ 0.48
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 CLTCL1P53675 1640 aa18.06■□□□□ 0.48
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.06■□□□□ 0.48
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 CCDC144AA2RUR9 1427 aa17.91■□□□□ 0.46
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa17.9■□□□□ 0.46
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa17.88■□□□□ 0.45
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 METP08581 1390 aa17.84■□□□□ 0.45
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa17.84■□□□□ 0.45
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HSPA1LP34931 641 aa17.84■□□□□ 0.45
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa17.83■□□□□ 0.45
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PIK3R4Q99570 1358 aa17.83■□□□□ 0.45
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C14orf37Q86TY3 774 aa17.83■□□□□ 0.44
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MSH6P52701 1360 aa17.81■□□□□ 0.44
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa17.8■□□□□ 0.44
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 IFT172Q9UG01 1749 aa17.79■□□□□ 0.44
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa17.78■□□□□ 0.44
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa17.74■□□□□ 0.43
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ATF3P18847 181 aa17.73■□□□□ 0.43
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C19orf44Q9H6X5 657 aa17.73■□□□□ 0.43
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLAIN2Q9P270 581 aa17.73■□□□□ 0.43
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa17.72■□□□□ 0.43
RAB30-AS1-201ENST00000501011 STK26Q9P289 416 aa17.71■□□□□ 0.43
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM135BQ49AJ0 1406 aa17.71■□□□□ 0.43
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ROBO2Q9HCK4 1378 aa17.7■□□□□ 0.42
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DISP3Q9P2K9 1392 aa17.7■□□□□ 0.42
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM132EQ6IEE7 984 aa17.7■□□□□ 0.42
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CADPS2Q86UW7 1296 aa17.69■□□□□ 0.42
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa17.69■□□□□ 0.42
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 PTCH1Q13635 1447 aa17.66■□□□□ 0.42
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 MYOM2P54296 1465 aa17.66■□□□□ 0.42
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa17.65■□□□□ 0.42
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PHLPP1O60346 1717 aa17.64■□□□□ 0.41
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DCCP43146 1447 aa17.64■□□□□ 0.41
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NRXN1Q9ULB1 1477 aa17.63■□□□□ 0.41
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
RAB30-AS1-201ENST00000501011 WAPLQ7Z5K2 1190 aa17.62■□□□□ 0.41
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MST1RQ04912 1400 aa17.61■□□□□ 0.41
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PRAG1Q86YV5 1406 aa17.61■□□□□ 0.41
RAB30-AS1-201ENST00000501011 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LAMC1P11047 1609 aa17.61■□□□□ 0.41
RAB30-AS1-201ENST00000501011 BRINP3Q76B58 766 aa17.6■□□□□ 0.41
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KNDC1Q76NI1 1749 aa17.6■□□□□ 0.41
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ABCC11Q96J66 1382 aa17.59■□□□□ 0.41
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa17.59■□□□□ 0.41
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MSH5O43196 834 aa17.59■□□□□ 0.41
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PCGF6Q9BYE7 350 aa17.59■□□□□ 0.41
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TECPR2O15040 1411 aa17.57■□□□□ 0.4
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP17.56■□□□□ 0.4
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
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