RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491163.1

C7orf50-208, Transcript of chromosome 7 open reading frame 50, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene C7orf50, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf50-208ENST00000491163 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
C7orf50-208ENST00000491163 FBXO41Q8TF61 875 aa29.85■■■□□ 2.37
C7orf50-208ENST00000491163 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.85■■■□□ 2.37
C7orf50-208ENST00000491163 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.82■■■□□ 2.36
C7orf50-208ENST00000491163 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
C7orf50-208ENST00000491163 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.78■■■□□ 2.36
C7orf50-208ENST00000491163 KIF1BO60333 1816 aa29.78■■■□□ 2.36
C7orf50-208ENST00000491163 CPS1P31327 1500 aa29.77■■■□□ 2.36
C7orf50-208ENST00000491163 BCANQ96GW7 911 aa29.77■■■□□ 2.36
C7orf50-208ENST00000491163 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
C7orf50-208ENST00000491163 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.75■■■□□ 2.35
C7orf50-208ENST00000491163 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.73■■■□□ 2.35
C7orf50-208ENST00000491163 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.71■■■□□ 2.35
C7orf50-208ENST00000491163 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.7■■■□□ 2.34
C7orf50-208ENST00000491163 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
C7orf50-208ENST00000491163 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.67■■■□□ 2.34
C7orf50-208ENST00000491163 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.67■■■□□ 2.34
C7orf50-208ENST00000491163 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.66■■■□□ 2.34
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C7orf50-208ENST00000491163 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.64■■■□□ 2.34
C7orf50-208ENST00000491163 NWD1Q149M9 1564 aa29.61■■■□□ 2.33
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C7orf50-208ENST00000491163 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.59■■■□□ 2.33
C7orf50-208ENST00000491163 DIP2AQ14689 1571 aa29.59■■■□□ 2.33
C7orf50-208ENST00000491163 PPLO60437 1756 aa29.58■■■□□ 2.33
C7orf50-208ENST00000491163 KCNA6P17658 529 aa29.58■■■□□ 2.33
C7orf50-208ENST00000491163 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.58■■■□□ 2.33
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C7orf50-208ENST00000491163 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
C7orf50-208ENST00000491163 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.56■■■□□ 2.32
C7orf50-208ENST00000491163 HRCP23327 699 aa29.56■■■□□ 2.32
C7orf50-208ENST00000491163 TBX22Q9Y458 520 aa29.55■■■□□ 2.32
C7orf50-208ENST00000491163 RGL3Q3MIN7 710 aa29.54■■■□□ 2.32
C7orf50-208ENST00000491163 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
C7orf50-208ENST00000491163 ALKQ9UM73 1620 aa29.53■■■□□ 2.32
C7orf50-208ENST00000491163 TMEM94Q12767 1356 aa29.52■■■□□ 2.32
C7orf50-208ENST00000491163 PTPRUQ92729 1446 aa29.5■■■□□ 2.31
C7orf50-208ENST00000491163 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.5■■■□□ 2.31
C7orf50-208ENST00000491163 IFT172Q9UG01 1749 aa29.49■■■□□ 2.31
C7orf50-208ENST00000491163 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
C7orf50-208ENST00000491163 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.48■■■□□ 2.31
C7orf50-208ENST00000491163 METP08581 1390 aa29.48■■■□□ 2.31
C7orf50-208ENST00000491163 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
C7orf50-208ENST00000491163 PIP4K2BP78356 416 aa29.47■■■□□ 2.31
C7orf50-208ENST00000491163 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
C7orf50-208ENST00000491163 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
C7orf50-208ENST00000491163 PIK3R4Q99570 1358 aa29.44■■■□□ 2.3
C7orf50-208ENST00000491163 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
C7orf50-208ENST00000491163 TOM1O60784 492 aa29.43■■■□□ 2.3
C7orf50-208ENST00000491163 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.43■■■□□ 2.3
C7orf50-208ENST00000491163 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.42■■■□□ 2.3
C7orf50-208ENST00000491163 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
C7orf50-208ENST00000491163 PIK3C2GO75747 1445 aa29.32■■■□□ 2.28
C7orf50-208ENST00000491163 MSH6P52701 1360 aa29.31■■■□□ 2.28
C7orf50-208ENST00000491163 C14orf37Q86TY3 774 aa29.31■■■□□ 2.28
C7orf50-208ENST00000491163 MYOM2P54296 1465 aa29.29■■■□□ 2.28
C7orf50-208ENST00000491163 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.29■■■□□ 2.28
C7orf50-208ENST00000491163 HSPA1LP34931 641 aa29.27■■■□□ 2.28
C7orf50-208ENST00000491163 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
C7orf50-208ENST00000491163 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.27■■■□□ 2.28
C7orf50-208ENST00000491163 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.25■■■□□ 2.27
C7orf50-208ENST00000491163 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.24■■■□□ 2.27
C7orf50-208ENST00000491163 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.23■■■□□ 2.27
C7orf50-208ENST00000491163 PTCH1Q13635 1447 aa29.22■■■□□ 2.27
C7orf50-208ENST00000491163 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.22■■■□□ 2.27
C7orf50-208ENST00000491163 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.22■■■□□ 2.27
C7orf50-208ENST00000491163 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
C7orf50-208ENST00000491163 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.21■■■□□ 2.27
C7orf50-208ENST00000491163 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.21■■■□□ 2.27
C7orf50-208ENST00000491163 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.19■■■□□ 2.26
C7orf50-208ENST00000491163 STK26Q9P289 416 aa29.19■■■□□ 2.26
C7orf50-208ENST00000491163 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.18■■■□□ 2.26
C7orf50-208ENST00000491163 LAMC1P11047 1609 aa29.17■■■□□ 2.26
C7orf50-208ENST00000491163 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.17■■■□□ 2.26
C7orf50-208ENST00000491163 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.17■■■□□ 2.26
C7orf50-208ENST00000491163 ATF3P18847 181 aa29.15■■■□□ 2.26
C7orf50-208ENST00000491163 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
C7orf50-208ENST00000491163 SLAIN2Q9P270 581 aa29.15■■■□□ 2.26
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C7orf50-208ENST00000491163 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.14■■■□□ 2.26
C7orf50-208ENST00000491163 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.14■■■□□ 2.25
C7orf50-208ENST00000491163 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
C7orf50-208ENST00000491163 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.13■■■□□ 2.25
C7orf50-208ENST00000491163 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.12■■■□□ 2.25
C7orf50-208ENST00000491163 TECPR2O15040 1411 aa29.11■■■□□ 2.25
C7orf50-208ENST00000491163 DCCP43146 1447 aa29.11■■■□□ 2.25
C7orf50-208ENST00000491163 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.09■■■□□ 2.25
C7orf50-208ENST00000491163 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.08■■■□□ 2.25
C7orf50-208ENST00000491163 ADGRB1O14514 1584 aa29.08■■■□□ 2.25
C7orf50-208ENST00000491163 MST1RQ04912 1400 aa29.07■■■□□ 2.24
C7orf50-208ENST00000491163 ABCC11Q96J66 1382 aa29.07■■■□□ 2.24
C7orf50-208ENST00000491163 NEUROD1Q13562 356 aa29.06■■■□□ 2.24
C7orf50-208ENST00000491163 PHLPP1O60346 1717 aa29.02■■■□□ 2.24
C7orf50-208ENST00000491163 BRINP3Q76B58 766 aa28.99■■■□□ 2.23
C7orf50-208ENST00000491163 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.99■■■□□ 2.23
C7orf50-208ENST00000491163 STAC3Q96MF2 364 aa28.99■■■□□ 2.23
C7orf50-208ENST00000491163 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.98■■■□□ 2.23
C7orf50-208ENST00000491163 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.98■■■□□ 2.23
C7orf50-208ENST00000491163 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.97■■■□□ 2.23
C7orf50-208ENST00000491163 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.96■■■□□ 2.23
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