RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487163.5

USP21-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP21, Length 2,514 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-208ENST00000487163 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.48■■□□□ 1.19
USP21-208ENST00000487163 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.48■■□□□ 1.19
USP21-208ENST00000487163 CDCA8Q53HL2 280 aa22.47■■□□□ 1.19
USP21-208ENST00000487163 GGT6Q6P531 493 aa22.47■■□□□ 1.19
USP21-208ENST00000487163 MROH2AA6NES4 1674 aa22.47■■□□□ 1.19
USP21-208ENST00000487163 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
USP21-208ENST00000487163 ABCA6Q8N139 1617 aa22.46■■□□□ 1.19
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USP21-208ENST00000487163 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
USP21-208ENST00000487163 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.45■■□□□ 1.18
USP21-208ENST00000487163 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.45■■□□□ 1.18
USP21-208ENST00000487163 SYNMO15061 1565 aa22.45■■□□□ 1.18
USP21-208ENST00000487163 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.45■■□□□ 1.18
USP21-208ENST00000487163 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.44■■□□□ 1.18
USP21-208ENST00000487163 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
USP21-208ENST00000487163 PPP2R1AP30153 589 aa22.44■■□□□ 1.18
USP21-208ENST00000487163 MYOM1P52179 1685 aa22.44■■□□□ 1.18
USP21-208ENST00000487163 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.44■■□□□ 1.18
USP21-208ENST00000487163 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.43■■□□□ 1.18
USP21-208ENST00000487163 MYOM2P54296 1465 aa22.43■■□□□ 1.18
USP21-208ENST00000487163 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
USP21-208ENST00000487163 PDE3BQ13370 1112 aa22.42■■□□□ 1.18
USP21-208ENST00000487163 IFT172Q9UG01 1749 aa22.42■■□□□ 1.18
USP21-208ENST00000487163 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.41■■□□□ 1.18
USP21-208ENST00000487163 MSH5O43196 834 aa22.4■■□□□ 1.18
USP21-208ENST00000487163 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.4■■□□□ 1.18
USP21-208ENST00000487163 NPATQ14207 1427 aa22.4■■□□□ 1.18
USP21-208ENST00000487163 NOS1P29475 1434 aa22.4■■□□□ 1.18
USP21-208ENST00000487163 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
USP21-208ENST00000487163 RAPGEF3O95398 923 aa22.39■■□□□ 1.17
USP21-208ENST00000487163 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.39■■□□□ 1.17
USP21-208ENST00000487163 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.38■■□□□ 1.17
USP21-208ENST00000487163 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.38■■□□□ 1.17
USP21-208ENST00000487163 ERVK-7P63135 1459 aa22.37■■□□□ 1.17
USP21-208ENST00000487163 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.37■■□□□ 1.17
USP21-208ENST00000487163 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.37■■□□□ 1.17
USP21-208ENST00000487163 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.36■■□□□ 1.17
USP21-208ENST00000487163 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.36■■□□□ 1.17
USP21-208ENST00000487163 INSRP06213 1382 aa22.36■■□□□ 1.17
USP21-208ENST00000487163 ADGRB3O60242 1522 aa22.35■■□□□ 1.17
USP21-208ENST00000487163 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
USP21-208ENST00000487163 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.34■■□□□ 1.17
USP21-208ENST00000487163 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.34■■□□□ 1.17
USP21-208ENST00000487163 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.32■■□□□ 1.16
USP21-208ENST00000487163 PLIN1O60240 522 aa22.31■■□□□ 1.16
USP21-208ENST00000487163 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.31■■□□□ 1.16
USP21-208ENST00000487163 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.3■■□□□ 1.16
USP21-208ENST00000487163 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
USP21-208ENST00000487163 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.29■■□□□ 1.16
USP21-208ENST00000487163 ABCC3O15438 1527 aa22.29■■□□□ 1.16
USP21-208ENST00000487163 PPLO60437 1756 aa22.29■■□□□ 1.16
USP21-208ENST00000487163 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
USP21-208ENST00000487163 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.28■■□□□ 1.16
USP21-208ENST00000487163 PIK3C2GO75747 1445 aa22.28■■□□□ 1.16
USP21-208ENST00000487163 SLC24A1O60721 1099 aa22.27■■□□□ 1.16
USP21-208ENST00000487163 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.26■■□□□ 1.15
USP21-208ENST00000487163 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
USP21-208ENST00000487163 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.26■■□□□ 1.15
USP21-208ENST00000487163 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.25■■□□□ 1.15
USP21-208ENST00000487163 NEO1Q92859 1461 aa22.24■■□□□ 1.15
USP21-208ENST00000487163 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.24■■□□□ 1.15
USP21-208ENST00000487163 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.24■■□□□ 1.15
USP21-208ENST00000487163 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.24■■□□□ 1.15
USP21-208ENST00000487163 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
USP21-208ENST00000487163 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.22■■□□□ 1.15
USP21-208ENST00000487163 ADGRB1O14514 1584 aa22.22■■□□□ 1.15
USP21-208ENST00000487163 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.21■■□□□ 1.15
USP21-208ENST00000487163 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.2■■□□□ 1.14
USP21-208ENST00000487163 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.2■■□□□ 1.14
USP21-208ENST00000487163 ZNF521Q96K83 1311 aa22.2■■□□□ 1.14
USP21-208ENST00000487163 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.18■■□□□ 1.14
USP21-208ENST00000487163 GOLGA2Q08379 1002 aa22.18■■□□□ 1.14
USP21-208ENST00000487163 CRBNQ96SW2 442 aa22.18■■□□□ 1.14
USP21-208ENST00000487163 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.18■■□□□ 1.14
USP21-208ENST00000487163 APAF1O14727 1248 aa22.18■■□□□ 1.14
USP21-208ENST00000487163 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.17■■□□□ 1.14
USP21-208ENST00000487163 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
USP21-208ENST00000487163 RICTORQ6R327 1708 aa22.17■■□□□ 1.14
USP21-208ENST00000487163 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
USP21-208ENST00000487163 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.16■■□□□ 1.14
USP21-208ENST00000487163 IDI1Q13907 227 aa22.16■■□□□ 1.14
USP21-208ENST00000487163 PIK3C2BO00750 1634 aa22.15■■□□□ 1.14
USP21-208ENST00000487163 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.13■■□□□ 1.13
USP21-208ENST00000487163 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
USP21-208ENST00000487163 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
USP21-208ENST00000487163 GLI2P10070 1586 aa22.13■■□□□ 1.13
USP21-208ENST00000487163 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.13■■□□□ 1.13
USP21-208ENST00000487163 SLFN5Q08AF3 891 aa22.12■■□□□ 1.13
USP21-208ENST00000487163 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
USP21-208ENST00000487163 MORC1Q86VD1 984 aa22.11■■□□□ 1.13
USP21-208ENST00000487163 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.09■■□□□ 1.13
USP21-208ENST00000487163 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-208ENST00000487163 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-208ENST00000487163 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-208ENST00000487163 SKAP1Q86WV1 359 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-208ENST00000487163 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
USP21-208ENST00000487163 STK26Q9P289 416 aa22.07■■□□□ 1.12
USP21-208ENST00000487163 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
USP21-208ENST00000487163 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
USP21-208ENST00000487163 CABP2Q9NPB3 220 aa22.06■■□□□ 1.12
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