RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 CPS1P31327 1500 aa30.97■■■□□ 2.55
NELFE-208ENST00000481121 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.96■■■□□ 2.55
NELFE-208ENST00000481121 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
NELFE-208ENST00000481121 FBXO41Q8TF61 875 aa30.93■■■□□ 2.54
NELFE-208ENST00000481121 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.93■■■□□ 2.54
NELFE-208ENST00000481121 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
NELFE-208ENST00000481121 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
NELFE-208ENST00000481121 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.89■■■□□ 2.54
NELFE-208ENST00000481121 FOXD1Q16676 465 aa30.89■■■□□ 2.54
NELFE-208ENST00000481121 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.88■■■□□ 2.53
NELFE-208ENST00000481121 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.85■■■□□ 2.53
NELFE-208ENST00000481121 BCANQ96GW7 911 aa30.85■■■□□ 2.53
NELFE-208ENST00000481121 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
NELFE-208ENST00000481121 DIP2AQ14689 1571 aa30.84■■■□□ 2.53
NELFE-208ENST00000481121 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.84■■■□□ 2.53
NELFE-208ENST00000481121 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
NELFE-208ENST00000481121 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.81■■■□□ 2.52
NELFE-208ENST00000481121 PPLO60437 1756 aa30.81■■■□□ 2.52
NELFE-208ENST00000481121 NWD1Q149M9 1564 aa30.8■■■□□ 2.52
NELFE-208ENST00000481121 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
NELFE-208ENST00000481121 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
NELFE-208ENST00000481121 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.79■■■□□ 2.52
NELFE-208ENST00000481121 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
NELFE-208ENST00000481121 HRCP23327 699 aa30.78■■■□□ 2.52
NELFE-208ENST00000481121 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.77■■■□□ 2.52
NELFE-208ENST00000481121 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa30.77■■■□□ 2.52
NELFE-208ENST00000481121 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.75■■■□□ 2.51
NELFE-208ENST00000481121 IFT172Q9UG01 1749 aa30.74■■■□□ 2.51
NELFE-208ENST00000481121 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
NELFE-208ENST00000481121 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.68■■■□□ 2.5
NELFE-208ENST00000481121 KCNA6P17658 529 aa30.68■■■□□ 2.5
NELFE-208ENST00000481121 TBX22Q9Y458 520 aa30.68■■■□□ 2.5
NELFE-208ENST00000481121 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.66■■■□□ 2.5
NELFE-208ENST00000481121 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
NELFE-208ENST00000481121 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.64■■■□□ 2.5
NELFE-208ENST00000481121 PIK3R4Q99570 1358 aa30.64■■■□□ 2.5
NELFE-208ENST00000481121 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
NELFE-208ENST00000481121 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.6■■■□□ 2.49
NELFE-208ENST00000481121 RGL3Q3MIN7 710 aa30.58■■■□□ 2.49
NELFE-208ENST00000481121 TMEM94Q12767 1356 aa30.58■■■□□ 2.49
NELFE-208ENST00000481121 ALKQ9UM73 1620 aa30.58■■■□□ 2.49
NELFE-208ENST00000481121 TOM1O60784 492 aa30.55■■■□□ 2.48
NELFE-208ENST00000481121 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
NELFE-208ENST00000481121 PTPRUQ92729 1446 aa30.54■■■□□ 2.48
NELFE-208ENST00000481121 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
NELFE-208ENST00000481121 METP08581 1390 aa30.51■■■□□ 2.48
NELFE-208ENST00000481121 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
NELFE-208ENST00000481121 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
NELFE-208ENST00000481121 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.48■■■□□ 2.47
NELFE-208ENST00000481121 MYOM2P54296 1465 aa30.48■■■□□ 2.47
NELFE-208ENST00000481121 PIP4K2BP78356 416 aa30.47■■■□□ 2.47
NELFE-208ENST00000481121 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.46■■■□□ 2.47
NELFE-208ENST00000481121 LAMC1P11047 1609 aa30.46■■■□□ 2.47
NELFE-208ENST00000481121 PIK3C2GO75747 1445 aa30.45■■■□□ 2.47
NELFE-208ENST00000481121 MSH6P52701 1360 aa30.44■■■□□ 2.46
NELFE-208ENST00000481121 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.44■■■□□ 2.46
NELFE-208ENST00000481121 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
NELFE-208ENST00000481121 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.41■■■□□ 2.46
NELFE-208ENST00000481121 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.39■■■□□ 2.45
NELFE-208ENST00000481121 C14orf37Q86TY3 774 aa30.38■■■□□ 2.45
NELFE-208ENST00000481121 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.38■■■□□ 2.45
NELFE-208ENST00000481121 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.37■■■□□ 2.45
NELFE-208ENST00000481121 PTCH1Q13635 1447 aa30.37■■■□□ 2.45
NELFE-208ENST00000481121 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.36■■■□□ 2.45
NELFE-208ENST00000481121 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.35■■■□□ 2.45
NELFE-208ENST00000481121 DCCP43146 1447 aa30.29■■■□□ 2.44
NELFE-208ENST00000481121 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.29■■■□□ 2.44
NELFE-208ENST00000481121 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.28■■■□□ 2.44
NELFE-208ENST00000481121 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.28■■■□□ 2.44
NELFE-208ENST00000481121 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
NELFE-208ENST00000481121 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.28■■■□□ 2.44
NELFE-208ENST00000481121 TECPR2O15040 1411 aa30.25■■■□□ 2.43
NELFE-208ENST00000481121 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.25■■■□□ 2.43
NELFE-208ENST00000481121 HSPA1LP34931 641 aa30.25■■■□□ 2.43
NELFE-208ENST00000481121 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
NELFE-208ENST00000481121 ATF3P18847 181 aa30.24■■■□□ 2.43
NELFE-208ENST00000481121 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.24■■■□□ 2.43
NELFE-208ENST00000481121 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
NELFE-208ENST00000481121 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.24■■■□□ 2.43
NELFE-208ENST00000481121 STAC3Q96MF2 364 aa30.23■■■□□ 2.43
NELFE-208ENST00000481121 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
NELFE-208ENST00000481121 TMEM132EQ6IEE7 984 aa30.22■■■□□ 2.43
NELFE-208ENST00000481121 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.22■■■□□ 2.43
NELFE-208ENST00000481121 SLAIN2Q9P270 581 aa30.21■■■□□ 2.43
NELFE-208ENST00000481121 STK26Q9P289 416 aa30.2■■■□□ 2.42
NELFE-208ENST00000481121 ADGRB1O14514 1584 aa30.19■■■□□ 2.42
NELFE-208ENST00000481121 ABCC11Q96J66 1382 aa30.19■■■□□ 2.42
NELFE-208ENST00000481121 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa30.19■■■□□ 2.42
NELFE-208ENST00000481121 PHLPP1O60346 1717 aa30.18■■■□□ 2.42
NELFE-208ENST00000481121 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.16■■■□□ 2.42
NELFE-208ENST00000481121 MST1RQ04912 1400 aa30.15■■■□□ 2.42
NELFE-208ENST00000481121 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.12■■■□□ 2.41
NELFE-208ENST00000481121 DLC1Q96QB1 1528 aa30.12■■■□□ 2.41
NELFE-208ENST00000481121 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
NELFE-208ENST00000481121 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.09■■■□□ 2.41
NELFE-208ENST00000481121 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
NELFE-208ENST00000481121 NEUROD1Q13562 356 aa30.08■■■□□ 2.41
NELFE-208ENST00000481121 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.08■■■□□ 2.41
NELFE-208ENST00000481121 NHSL1Q5SYE7 1610 aa30.08■■■□□ 2.41
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