RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.53■■□□□ 1.52
ATG4B-216ENST00000475195 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
ATG4B-216ENST00000475195 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.52■■□□□ 1.52
ATG4B-216ENST00000475195 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.52
ATG4B-216ENST00000475195 CLTCL1P53675 1640 aa24.5■■□□□ 1.51
ATG4B-216ENST00000475195 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.49■■□□□ 1.51
ATG4B-216ENST00000475195 CPS1P31327 1500 aa24.48■■□□□ 1.51
ATG4B-216ENST00000475195 FOXD1Q16676 465 aa24.48■■□□□ 1.51
ATG4B-216ENST00000475195 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.44■■□□□ 1.5
ATG4B-216ENST00000475195 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.44■■□□□ 1.5
ATG4B-216ENST00000475195 KIF1BO60333 1816 aa24.43■■□□□ 1.5
ATG4B-216ENST00000475195 TBX22Q9Y458 520 aa24.43■■□□□ 1.5
ATG4B-216ENST00000475195 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
ATG4B-216ENST00000475195 KCNA6P17658 529 aa24.4■■□□□ 1.5
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
ATG4B-216ENST00000475195 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
ATG4B-216ENST00000475195 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.38■■□□□ 1.49
ATG4B-216ENST00000475195 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.37■■□□□ 1.49
ATG4B-216ENST00000475195 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.37■■□□□ 1.49
ATG4B-216ENST00000475195 BCANQ96GW7 911 aa24.37■■□□□ 1.49
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.36■■□□□ 1.49
ATG4B-216ENST00000475195 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.36■■□□□ 1.49
ATG4B-216ENST00000475195 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.33■■□□□ 1.49
ATG4B-216ENST00000475195 PIK3R4Q99570 1358 aa24.32■■□□□ 1.48
ATG4B-216ENST00000475195 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
ATG4B-216ENST00000475195 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
ATG4B-216ENST00000475195 DIP2AQ14689 1571 aa24.32■■□□□ 1.48
ATG4B-216ENST00000475195 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.31■■□□□ 1.48
ATG4B-216ENST00000475195 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.3■■□□□ 1.48
ATG4B-216ENST00000475195 NWD1Q149M9 1564 aa24.3■■□□□ 1.48
ATG4B-216ENST00000475195 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.29■■□□□ 1.48
ATG4B-216ENST00000475195 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
ATG4B-216ENST00000475195 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.28■■□□□ 1.48
ATG4B-216ENST00000475195 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
ATG4B-216ENST00000475195 PPLO60437 1756 aa24.26■■□□□ 1.47
ATG4B-216ENST00000475195 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
ATG4B-216ENST00000475195 TOM1O60784 492 aa24.25■■□□□ 1.47
ATG4B-216ENST00000475195 RGL3Q3MIN7 710 aa24.24■■□□□ 1.47
ATG4B-216ENST00000475195 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM94Q12767 1356 aa24.22■■□□□ 1.47
ATG4B-216ENST00000475195 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
ATG4B-216ENST00000475195 PTPRUQ92729 1446 aa24.21■■□□□ 1.47
ATG4B-216ENST00000475195 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.21■■□□□ 1.47
ATG4B-216ENST00000475195 ALKQ9UM73 1620 aa24.21■■□□□ 1.47
ATG4B-216ENST00000475195 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.2■■□□□ 1.46
ATG4B-216ENST00000475195 METP08581 1390 aa24.2■■□□□ 1.46
ATG4B-216ENST00000475195 IFT172Q9UG01 1749 aa24.19■■□□□ 1.46
ATG4B-216ENST00000475195 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.18■■□□□ 1.46
ATG4B-216ENST00000475195 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
ATG4B-216ENST00000475195 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
ATG4B-216ENST00000475195 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
ATG4B-216ENST00000475195 STAC3Q96MF2 364 aa24.11■■□□□ 1.45
ATG4B-216ENST00000475195 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.11■■□□□ 1.45
ATG4B-216ENST00000475195 PIK3C2GO75747 1445 aa24.1■■□□□ 1.45
ATG4B-216ENST00000475195 MYOM2P54296 1465 aa24.09■■□□□ 1.45
ATG4B-216ENST00000475195 PIP4K2BP78356 416 aa24.09■■□□□ 1.45
ATG4B-216ENST00000475195 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.09■■□□□ 1.45
ATG4B-216ENST00000475195 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.08■■□□□ 1.45
ATG4B-216ENST00000475195 MSH6P52701 1360 aa24.07■■□□□ 1.44
ATG4B-216ENST00000475195 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
ATG4B-216ENST00000475195 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
ATG4B-216ENST00000475195 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.04■■□□□ 1.44
ATG4B-216ENST00000475195 PTCH1Q13635 1447 aa24.02■■□□□ 1.44
ATG4B-216ENST00000475195 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.02■■□□□ 1.44
ATG4B-216ENST00000475195 SLAIN2Q9P270 581 aa24.02■■□□□ 1.44
ATG4B-216ENST00000475195 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
ATG4B-216ENST00000475195 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
ATG4B-216ENST00000475195 HSPA1LP34931 641 aa24■■□□□ 1.43
ATG4B-216ENST00000475195 CADPS2Q86UW7 1296 aa24■■□□□ 1.43
ATG4B-216ENST00000475195 ABCC11Q96J66 1382 aa24■■□□□ 1.43
ATG4B-216ENST00000475195 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24■■□□□ 1.43
ATG4B-216ENST00000475195 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.99■■□□□ 1.43
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.99■■□□□ 1.43
ATG4B-216ENST00000475195 C14orf37Q86TY3 774 aa23.98■■□□□ 1.43
ATG4B-216ENST00000475195 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
ATG4B-216ENST00000475195 TECPR2O15040 1411 aa23.98■■□□□ 1.43
ATG4B-216ENST00000475195 DCCP43146 1447 aa23.98■■□□□ 1.43
ATG4B-216ENST00000475195 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.98■■□□□ 1.43
ATG4B-216ENST00000475195 SIRT1Q96EB6 747 aa23.97■■□□□ 1.43
ATG4B-216ENST00000475195 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.97■■□□□ 1.43
ATG4B-216ENST00000475195 ATF3P18847 181 aa23.96■■□□□ 1.43
ATG4B-216ENST00000475195 LAMC1P11047 1609 aa23.95■■□□□ 1.43
ATG4B-216ENST00000475195 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.94■■□□□ 1.42
ATG4B-216ENST00000475195 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
ATG4B-216ENST00000475195 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.92■■□□□ 1.42
ATG4B-216ENST00000475195 STK26Q9P289 416 aa23.91■■□□□ 1.42
ATG4B-216ENST00000475195 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.91■■□□□ 1.42
ATG4B-216ENST00000475195 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.9■■□□□ 1.42
ATG4B-216ENST00000475195 ADGRB1O14514 1584 aa23.89■■□□□ 1.41
ATG4B-216ENST00000475195 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.89■■□□□ 1.41
ATG4B-216ENST00000475195 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.88■■□□□ 1.41
ATG4B-216ENST00000475195 MST1RQ04912 1400 aa23.87■■□□□ 1.41
ATG4B-216ENST00000475195 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.86■■□□□ 1.41
ATG4B-216ENST00000475195 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.83■■□□□ 1.41
ATG4B-216ENST00000475195 BRINP3Q76B58 766 aa23.83■■□□□ 1.41
ATG4B-216ENST00000475195 DLC1Q96QB1 1528 aa23.83■■□□□ 1.41
ATG4B-216ENST00000475195 NEUROD1Q13562 356 aa23.82■■□□□ 1.4
ATG4B-216ENST00000475195 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.81■■□□□ 1.4
ATG4B-216ENST00000475195 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.79■■□□□ 1.4
ATG4B-216ENST00000475195 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.78■■□□□ 1.4
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