RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470658.1

WDR4-204, Transcript of WD repeat domain 4, humanhuman

TSL 5

Gene WDR4, Length 901 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR4-204ENST00000470658 FOXD1Q16676 465 aa30.91■■■□□ 2.54
WDR4-204ENST00000470658 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.91■■■□□ 2.54
WDR4-204ENST00000470658 FBXO41Q8TF61 875 aa30.89■■■□□ 2.54
WDR4-204ENST00000470658 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
WDR4-204ENST00000470658 CPS1P31327 1500 aa30.88■■■□□ 2.53
WDR4-204ENST00000470658 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.86■■■□□ 2.53
WDR4-204ENST00000470658 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.84■■■□□ 2.53
WDR4-204ENST00000470658 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
WDR4-204ENST00000470658 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
WDR4-204ENST00000470658 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
WDR4-204ENST00000470658 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.81■■■□□ 2.52
WDR4-204ENST00000470658 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.8■■■□□ 2.52
WDR4-204ENST00000470658 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
WDR4-204ENST00000470658 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.79■■■□□ 2.52
WDR4-204ENST00000470658 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
WDR4-204ENST00000470658 HRCP23327 699 aa30.75■■■□□ 2.51
WDR4-204ENST00000470658 BCANQ96GW7 911 aa30.75■■■□□ 2.51
WDR4-204ENST00000470658 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.74■■■□□ 2.51
WDR4-204ENST00000470658 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.73■■■□□ 2.51
WDR4-204ENST00000470658 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.73■■■□□ 2.51
WDR4-204ENST00000470658 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.73■■■□□ 2.51
WDR4-204ENST00000470658 NWD1Q149M9 1564 aa30.72■■■□□ 2.51
WDR4-204ENST00000470658 DIP2AQ14689 1571 aa30.71■■■□□ 2.51
WDR4-204ENST00000470658 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
WDR4-204ENST00000470658 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
WDR4-204ENST00000470658 PPLO60437 1756 aa30.7■■■□□ 2.51
WDR4-204ENST00000470658 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa30.7■■■□□ 2.5
WDR4-204ENST00000470658 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.66■■■□□ 2.5
WDR4-204ENST00000470658 TBX22Q9Y458 520 aa30.66■■■□□ 2.5
WDR4-204ENST00000470658 KCNA6P17658 529 aa30.65■■■□□ 2.5
WDR4-204ENST00000470658 IFT172Q9UG01 1749 aa30.63■■■□□ 2.49
WDR4-204ENST00000470658 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
WDR4-204ENST00000470658 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.61■■■□□ 2.49
WDR4-204ENST00000470658 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.6■■■□□ 2.49
WDR4-204ENST00000470658 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.59■■■□□ 2.49
WDR4-204ENST00000470658 ALKQ9UM73 1620 aa30.58■■■□□ 2.49
WDR4-204ENST00000470658 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
WDR4-204ENST00000470658 PIK3R4Q99570 1358 aa30.56■■■□□ 2.48
WDR4-204ENST00000470658 RGL3Q3MIN7 710 aa30.56■■■□□ 2.48
WDR4-204ENST00000470658 PTPRUQ92729 1446 aa30.55■■■□□ 2.48
WDR4-204ENST00000470658 TMEM94Q12767 1356 aa30.54■■■□□ 2.48
WDR4-204ENST00000470658 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
WDR4-204ENST00000470658 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
WDR4-204ENST00000470658 METP08581 1390 aa30.52■■■□□ 2.48
WDR4-204ENST00000470658 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
WDR4-204ENST00000470658 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
WDR4-204ENST00000470658 TOM1O60784 492 aa30.47■■■□□ 2.47
WDR4-204ENST00000470658 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
WDR4-204ENST00000470658 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.47■■■□□ 2.47
WDR4-204ENST00000470658 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.45■■■□□ 2.47
WDR4-204ENST00000470658 PIP4K2BP78356 416 aa30.42■■■□□ 2.46
WDR4-204ENST00000470658 PIK3C2GO75747 1445 aa30.4■■■□□ 2.46
WDR4-204ENST00000470658 MYOM2P54296 1465 aa30.4■■■□□ 2.46
WDR4-204ENST00000470658 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
WDR4-204ENST00000470658 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.38■■■□□ 2.45
WDR4-204ENST00000470658 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.37■■■□□ 2.45
WDR4-204ENST00000470658 MSH6P52701 1360 aa30.36■■■□□ 2.45
WDR4-204ENST00000470658 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.35■■■□□ 2.45
WDR4-204ENST00000470658 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
WDR4-204ENST00000470658 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.31■■■□□ 2.44
WDR4-204ENST00000470658 PTCH1Q13635 1447 aa30.3■■■□□ 2.44
WDR4-204ENST00000470658 LAMC1P11047 1609 aa30.29■■■□□ 2.44
WDR4-204ENST00000470658 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.29■■■□□ 2.44
WDR4-204ENST00000470658 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
WDR4-204ENST00000470658 C14orf37Q86TY3 774 aa30.28■■■□□ 2.44
WDR4-204ENST00000470658 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.27■■■□□ 2.44
WDR4-204ENST00000470658 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.25■■■□□ 2.43
WDR4-204ENST00000470658 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.25■■■□□ 2.43
WDR4-204ENST00000470658 HSPA1LP34931 641 aa30.24■■■□□ 2.43
WDR4-204ENST00000470658 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.24■■■□□ 2.43
WDR4-204ENST00000470658 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.24■■■□□ 2.43
WDR4-204ENST00000470658 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
WDR4-204ENST00000470658 TMEM132EQ6IEE7 984 aa30.23■■■□□ 2.43
WDR4-204ENST00000470658 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.22■■■□□ 2.43
WDR4-204ENST00000470658 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.22■■■□□ 2.43
WDR4-204ENST00000470658 TECPR2O15040 1411 aa30.22■■■□□ 2.43
WDR4-204ENST00000470658 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.22■■■□□ 2.43
WDR4-204ENST00000470658 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
WDR4-204ENST00000470658 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.21■■■□□ 2.43
WDR4-204ENST00000470658 DCCP43146 1447 aa30.21■■■□□ 2.43
WDR4-204ENST00000470658 SLAIN2Q9P270 581 aa30.18■■■□□ 2.42
WDR4-204ENST00000470658 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
WDR4-204ENST00000470658 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.17■■■□□ 2.42
WDR4-204ENST00000470658 STK26Q9P289 416 aa30.17■■■□□ 2.42
WDR4-204ENST00000470658 ABCC11Q96J66 1382 aa30.16■■■□□ 2.42
WDR4-204ENST00000470658 ATF3P18847 181 aa30.16■■■□□ 2.42
WDR4-204ENST00000470658 ADGRB1O14514 1584 aa30.15■■■□□ 2.42
WDR4-204ENST00000470658 STAC3Q96MF2 364 aa30.15■■■□□ 2.42
WDR4-204ENST00000470658 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.15■■■□□ 2.42
WDR4-204ENST00000470658 MST1RQ04912 1400 aa30.12■■■□□ 2.41
WDR4-204ENST00000470658 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.1■■■□□ 2.41
WDR4-204ENST00000470658 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.08■■■□□ 2.41
WDR4-204ENST00000470658 PHLPP1O60346 1717 aa30.06■■■□□ 2.4
WDR4-204ENST00000470658 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa30.06■■■□□ 2.4
WDR4-204ENST00000470658 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.06■■■□□ 2.4
WDR4-204ENST00000470658 NEUROD1Q13562 356 aa30.05■■■□□ 2.4
WDR4-204ENST00000470658 DLC1Q96QB1 1528 aa30.05■■■□□ 2.4
WDR4-204ENST00000470658 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.03■■■□□ 2.4
WDR4-204ENST00000470658 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
WDR4-204ENST00000470658 BRINP3Q76B58 766 aa30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.4 ms