RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.82■■■■□ 3.32
SMKR1-201ENST00000462322 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.82■■■■□ 3.32
SMKR1-201ENST00000462322 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.81■■■■□ 3.32
SMKR1-201ENST00000462322 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.8■■■■□ 3.32
SMKR1-201ENST00000462322 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
SMKR1-201ENST00000462322 TRPM2O94759 1503 aa35.78■■■■□ 3.32
SMKR1-201ENST00000462322 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.77■■■■□ 3.32
SMKR1-201ENST00000462322 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
SMKR1-201ENST00000462322 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.76■■■■□ 3.32
SMKR1-201ENST00000462322 CLTCL1P53675 1640 aa35.74■■■■□ 3.31
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.73■■■■□ 3.31
SMKR1-201ENST00000462322 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
SMKR1-201ENST00000462322 KCNA6P17658 529 aa35.69■■■■□ 3.3
SMKR1-201ENST00000462322 FOXD1Q16676 465 aa35.69■■■■□ 3.3
SMKR1-201ENST00000462322 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.69■■■■□ 3.3
SMKR1-201ENST00000462322 TOM1O60784 492 aa35.66■■■■□ 3.3
SMKR1-201ENST00000462322 KIF1BO60333 1816 aa35.64■■■■□ 3.3
SMKR1-201ENST00000462322 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.64■■■■□ 3.3
SMKR1-201ENST00000462322 TBX22Q9Y458 520 aa35.63■■■■□ 3.29
SMKR1-201ENST00000462322 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
SMKR1-201ENST00000462322 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.58■■■■□ 3.29
SMKR1-201ENST00000462322 PIP4K2BP78356 416 aa35.58■■■■□ 3.29
SMKR1-201ENST00000462322 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
SMKR1-201ENST00000462322 NWD1Q149M9 1564 aa35.55■■■■□ 3.28
SMKR1-201ENST00000462322 DIP2AQ14689 1571 aa35.55■■■■□ 3.28
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM94Q12767 1356 aa35.54■■■■□ 3.28
SMKR1-201ENST00000462322 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
SMKR1-201ENST00000462322 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.53■■■■□ 3.28
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.52■■■■□ 3.28
SMKR1-201ENST00000462322 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
SMKR1-201ENST00000462322 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
SMKR1-201ENST00000462322 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
SMKR1-201ENST00000462322 PIK3R4Q99570 1358 aa35.49■■■■□ 3.27
SMKR1-201ENST00000462322 ALKQ9UM73 1620 aa35.48■■■■□ 3.27
SMKR1-201ENST00000462322 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.47■■■■□ 3.27
SMKR1-201ENST00000462322 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.47■■■■□ 3.27
SMKR1-201ENST00000462322 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
SMKR1-201ENST00000462322 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.45■■■■□ 3.27
SMKR1-201ENST00000462322 HRCP23327 699 aa35.42■■■■□ 3.26
SMKR1-201ENST00000462322 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.4■■■■□ 3.26
SMKR1-201ENST00000462322 RGL3Q3MIN7 710 aa35.39■■■■□ 3.26
SMKR1-201ENST00000462322 PTPRUQ92729 1446 aa35.38■■■■□ 3.25
SMKR1-201ENST00000462322 HSPA1LP34931 641 aa35.37■■■■□ 3.25
SMKR1-201ENST00000462322 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.36■■■■□ 3.25
SMKR1-201ENST00000462322 METP08581 1390 aa35.36■■■■□ 3.25
SMKR1-201ENST00000462322 MSH6P52701 1360 aa35.36■■■■□ 3.25
SMKR1-201ENST00000462322 PPLO60437 1756 aa35.35■■■■□ 3.25
SMKR1-201ENST00000462322 C14orf37Q86TY3 774 aa35.33■■■■□ 3.25
SMKR1-201ENST00000462322 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.31■■■■□ 3.24
SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.26■■■■□ 3.24
SMKR1-201ENST00000462322 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
SMKR1-201ENST00000462322 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.25■■■■□ 3.23
SMKR1-201ENST00000462322 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.22■■■■□ 3.23
SMKR1-201ENST00000462322 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.22■■■■□ 3.23
SMKR1-201ENST00000462322 SLAIN2Q9P270 581 aa35.2■■■■□ 3.23
SMKR1-201ENST00000462322 IFT172Q9UG01 1749 aa35.2■■■■□ 3.23
SMKR1-201ENST00000462322 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
SMKR1-201ENST00000462322 ATF3P18847 181 aa35.17■■■■□ 3.22
SMKR1-201ENST00000462322 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.16■■■■□ 3.22
SMKR1-201ENST00000462322 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
SMKR1-201ENST00000462322 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.13■■■■□ 3.21
SMKR1-201ENST00000462322 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.12■■■■□ 3.21
SMKR1-201ENST00000462322 PIK3C2GO75747 1445 aa35.09■■■■□ 3.21
SMKR1-201ENST00000462322 PTCH1Q13635 1447 aa35.08■■■■□ 3.21
SMKR1-201ENST00000462322 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.07■■■■□ 3.2
SMKR1-201ENST00000462322 DCCP43146 1447 aa35.06■■■■□ 3.2
SMKR1-201ENST00000462322 MYOM2P54296 1465 aa35.05■■■■□ 3.2
SMKR1-201ENST00000462322 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.05■■■■□ 3.2
SMKR1-201ENST00000462322 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.04■■■■□ 3.2
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.02■■■■□ 3.2
SMKR1-201ENST00000462322 STK26Q9P289 416 aa35.02■■■■□ 3.2
SMKR1-201ENST00000462322 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.02■■■■□ 3.2
SMKR1-201ENST00000462322 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
SMKR1-201ENST00000462322 NALCNQ8IZF0 1738 aa34.98■■■■□ 3.19
SMKR1-201ENST00000462322 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
SMKR1-201ENST00000462322 CFAP70Q5T0N1 1121 aa34.97■■■■□ 3.19
SMKR1-201ENST00000462322 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.97■■■■□ 3.19
SMKR1-201ENST00000462322 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa34.97■■■■□ 3.19
SMKR1-201ENST00000462322 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa34.96■■■■□ 3.19
SMKR1-201ENST00000462322 MST1RQ04912 1400 aa34.94■■■■□ 3.18
SMKR1-201ENST00000462322 ABCC11Q96J66 1382 aa34.93■■■■□ 3.18
SMKR1-201ENST00000462322 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
SMKR1-201ENST00000462322 TECPR2O15040 1411 aa34.92■■■■□ 3.18
SMKR1-201ENST00000462322 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
SMKR1-201ENST00000462322 BRINP3Q76B58 766 aa34.92■■■■□ 3.18
SMKR1-201ENST00000462322 PHLPP1O60346 1717 aa34.92■■■■□ 3.18
SMKR1-201ENST00000462322 LAMC1P11047 1609 aa34.92■■■■□ 3.18
SMKR1-201ENST00000462322 STAC3Q96MF2 364 aa34.9■■■■□ 3.18
SMKR1-201ENST00000462322 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
SMKR1-201ENST00000462322 WAPLQ7Z5K2 1190 aa34.89■■■■□ 3.18
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
SMKR1-201ENST00000462322 KNDC1Q76NI1 1749 aa34.86■■■■□ 3.17
SMKR1-201ENST00000462322 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
SMKR1-201ENST00000462322 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.82■■■■□ 3.16
SMKR1-201ENST00000462322 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.82■■■■□ 3.16
SMKR1-201ENST00000462322 SIRT1Q96EB6 747 aa34.81■■■■□ 3.16
SMKR1-201ENST00000462322 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
SMKR1-201ENST00000462322 JCADQ9P266 1359 aa34.79■■■■□ 3.16
SMKR1-201ENST00000462322 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
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