RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439208.1

RNF144A-AS1-205, RNF144A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RNF144A-AS1, Length 757 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.41■■□□□ 1.82
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.4■■□□□ 1.82
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.4■■□□□ 1.82
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ZFYVE9O95405 1425 aa26.39■■□□□ 1.82
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 SLIT1O75093 1534 aa26.39■■□□□ 1.82
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.38■■□□□ 1.81
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 MYOM2P54296 1465 aa26.37■■□□□ 1.81
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.37■■□□□ 1.81
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.34■■□□□ 1.81
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.34■■□□□ 1.81
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.33■■□□□ 1.81
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 EID1Q9Y6B2 187 aa26.31■■□□□ 1.8
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 LTKP29376 864 aa26.3■■□□□ 1.8
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.3■■□□□ 1.8
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.29■■□□□ 1.8
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.29■■□□□ 1.8
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.28■■□□□ 1.8
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.26■■□□□ 1.79
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PIK3C2GO75747 1445 aa26.25■■□□□ 1.79
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.23■■□□□ 1.79
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.2■■□□□ 1.79
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 HSPA2P54652 639 aa26.2■■□□□ 1.78
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.2■■□□□ 1.78
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 MED14O60244 1454 aa26.19■■□□□ 1.78
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.17■■□□□ 1.78
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.16■■□□□ 1.78
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.15■■□□□ 1.78
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 LAMC1P11047 1609 aa26.15■■□□□ 1.78
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.15■■□□□ 1.78
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.14■■□□□ 1.78
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ALKQ9UM73 1620 aa26.14■■□□□ 1.77
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.14■■□□□ 1.77
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 STRCQ7RTU9 1775 aa26.12■■□□□ 1.77
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 TBX22Q9Y458 520 aa26.12■■□□□ 1.77
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 IQGAP1P46940 1657 aa26.12■■□□□ 1.77
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.1■■□□□ 1.77
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.1■■□□□ 1.77
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 BCANQ96GW7 911 aa26.1■■□□□ 1.77
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 DIP2AQ14689 1571 aa26.09■■□□□ 1.77
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ADGRB1O14514 1584 aa26.07■■□□□ 1.76
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.05■■□□□ 1.76
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PIK3R4Q99570 1358 aa26.03■■□□□ 1.76
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.03■■□□□ 1.76
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.02■■□□□ 1.76
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 METP08581 1390 aa26.02■■□□□ 1.76
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.01■■□□□ 1.75
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.01■■□□□ 1.75
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ABCC11Q96J66 1382 aa25.96■■□□□ 1.75
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PTPRUQ92729 1446 aa25.94■■□□□ 1.74
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 SIRT1Q96EB6 747 aa25.93■■□□□ 1.74
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 TECPR2O15040 1411 aa25.93■■□□□ 1.74
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.91■■□□□ 1.74
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 DLC1Q96QB1 1528 aa25.91■■□□□ 1.74
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 USP47Q96K76 1375 aa25.91■■□□□ 1.74
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 KCNA6P17658 529 aa25.9■■□□□ 1.74
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.9■■□□□ 1.74
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 STK26Q9P289 416 aa25.89■■□□□ 1.74
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.89■■□□□ 1.74
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 NWD1Q149M9 1564 aa25.86■■□□□ 1.73
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.86■■□□□ 1.73
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 CPS1P31327 1500 aa25.85■■□□□ 1.73
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PTCH1Q13635 1447 aa25.84■■□□□ 1.73
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.82■■□□□ 1.72
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.82■■□□□ 1.72
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PRAM1Q96QH2 718 aa25.8■■□□□ 1.72
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.79■■□□□ 1.72
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 SLC24A1O60721 1099 aa25.78■■□□□ 1.72
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 TESK2Q96S53 571 aa25.78■■□□□ 1.72
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 POGKQ9P215 609 aa25.78■■□□□ 1.72
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.78■■□□□ 1.72
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.77■■□□□ 1.72
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.75■■□□□ 1.71
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.74■■□□□ 1.71
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.71■■□□□ 1.71
RNF144A-AS1-205ENST00000439208 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms