RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 ZMYM3Q14202 1370 aa22.84■■□□□ 1.25
CNGA3-205ENST00000436404 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CNGA3-205ENST00000436404 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CNGA3-205ENST00000436404 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.82■■□□□ 1.24
CNGA3-205ENST00000436404 ADGRB3O60242 1522 aa22.81■■□□□ 1.24
CNGA3-205ENST00000436404 C3P01024 1663 aa22.8■■□□□ 1.24
CNGA3-205ENST00000436404 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.8■■□□□ 1.24
CNGA3-205ENST00000436404 MADDQ8WXG6 1647 aa22.8■■□□□ 1.24
CNGA3-205ENST00000436404 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CNGA3-205ENST00000436404 RGL3Q3MIN7 710 aa22.79■■□□□ 1.24
CNGA3-205ENST00000436404 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.78■■□□□ 1.24
CNGA3-205ENST00000436404 IFT172Q9UG01 1749 aa22.77■■□□□ 1.24
CNGA3-205ENST00000436404 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.76■■□□□ 1.23
CNGA3-205ENST00000436404 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CNGA3-205ENST00000436404 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.76■■□□□ 1.23
CNGA3-205ENST00000436404 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CNGA3-205ENST00000436404 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.75■■□□□ 1.23
CNGA3-205ENST00000436404 IDI1Q13907 227 aa22.74■■□□□ 1.23
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.74■■□□□ 1.23
CNGA3-205ENST00000436404 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CNGA3-205ENST00000436404 IL27Q8NEV9 243 aa22.73■■□□□ 1.23
CNGA3-205ENST00000436404 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.73■■□□□ 1.23
CNGA3-205ENST00000436404 PPLO60437 1756 aa22.71■■□□□ 1.23
CNGA3-205ENST00000436404 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.71■■□□□ 1.23
CNGA3-205ENST00000436404 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CNGA3-205ENST00000436404 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.7■■□□□ 1.22
CNGA3-205ENST00000436404 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CNGA3-205ENST00000436404 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.67■■□□□ 1.22
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.67■■□□□ 1.22
CNGA3-205ENST00000436404 TNRQ92752 1358 aa22.67■■□□□ 1.22
CNGA3-205ENST00000436404 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CNGA3-205ENST00000436404 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.66■■□□□ 1.22
CNGA3-205ENST00000436404 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.65■■□□□ 1.22
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CNGA3-205ENST00000436404 MYOM2P54296 1465 aa22.65■■□□□ 1.22
CNGA3-205ENST00000436404 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.64■■□□□ 1.22
CNGA3-205ENST00000436404 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.64■■□□□ 1.21
CNGA3-205ENST00000436404 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.63■■□□□ 1.21
CNGA3-205ENST00000436404 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.62■■□□□ 1.21
CNGA3-205ENST00000436404 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.62■■□□□ 1.21
CNGA3-205ENST00000436404 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CNGA3-205ENST00000436404 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.62■■□□□ 1.21
CNGA3-205ENST00000436404 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CNGA3-205ENST00000436404 STAC3Q96MF2 364 aa22.59■■□□□ 1.21
CNGA3-205ENST00000436404 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.59■■□□□ 1.21
CNGA3-205ENST00000436404 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.59■■□□□ 1.21
CNGA3-205ENST00000436404 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.59■■□□□ 1.21
CNGA3-205ENST00000436404 NLRP1Q9C000 1473 aa22.58■■□□□ 1.21
CNGA3-205ENST00000436404 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.58■■□□□ 1.2
CNGA3-205ENST00000436404 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.57■■□□□ 1.2
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC184Q52MB2 194 aa22.56■■□□□ 1.2
CNGA3-205ENST00000436404 USP35Q9P2H5 1018 aa22.55■■□□□ 1.2
CNGA3-205ENST00000436404 PTPRMP28827 1452 aa22.54■■□□□ 1.2
CNGA3-205ENST00000436404 PIK3C2GO75747 1445 aa22.54■■□□□ 1.2
CNGA3-205ENST00000436404 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CNGA3-205ENST00000436404 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.54■■□□□ 1.2
CNGA3-205ENST00000436404 LAMC1P11047 1609 aa22.54■■□□□ 1.2
CNGA3-205ENST00000436404 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.53■■□□□ 1.2
CNGA3-205ENST00000436404 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CNGA3-205ENST00000436404 ZFYVE9O95405 1425 aa22.53■■□□□ 1.2
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CNGA3-205ENST00000436404 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.52■■□□□ 1.19
CNGA3-205ENST00000436404 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CNGA3-205ENST00000436404 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.51■■□□□ 1.19
CNGA3-205ENST00000436404 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.49■■□□□ 1.19
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CNGA3-205ENST00000436404 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CNGA3-205ENST00000436404 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CNGA3-205ENST00000436404 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CNGA3-205ENST00000436404 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CNGA3-205ENST00000436404 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.47■■□□□ 1.19
CNGA3-205ENST00000436404 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CNGA3-205ENST00000436404 MRS2Q9HD23 443 aa22.47■■□□□ 1.19
CNGA3-205ENST00000436404 IQGAP1P46940 1657 aa22.46■■□□□ 1.19
CNGA3-205ENST00000436404 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
CNGA3-205ENST00000436404 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.46■■□□□ 1.19
CNGA3-205ENST00000436404 USP47Q96K76 1375 aa22.46■■□□□ 1.19
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.45■■□□□ 1.18
CNGA3-205ENST00000436404 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CNGA3-205ENST00000436404 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.44■■□□□ 1.18
CNGA3-205ENST00000436404 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.44■■□□□ 1.18
CNGA3-205ENST00000436404 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.43■■□□□ 1.18
CNGA3-205ENST00000436404 NEFMP07197 916 aa22.43■■□□□ 1.18
CNGA3-205ENST00000436404 SLIT1O75093 1534 aa22.43■■□□□ 1.18
CNGA3-205ENST00000436404 ADGRB1O14514 1584 aa22.43■■□□□ 1.18
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.43■■□□□ 1.18
CNGA3-205ENST00000436404 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CNGA3-205ENST00000436404 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.43■■□□□ 1.18
CNGA3-205ENST00000436404 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CNGA3-205ENST00000436404 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.4■■□□□ 1.18
CNGA3-205ENST00000436404 ALKQ9UM73 1620 aa22.39■■□□□ 1.17
CNGA3-205ENST00000436404 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CNGA3-205ENST00000436404 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CNGA3-205ENST00000436404 LTKP29376 864 aa22.36■■□□□ 1.17
CNGA3-205ENST00000436404 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
CNGA3-205ENST00000436404 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CNGA3-205ENST00000436404 NUDCQ9Y266 331 aa22.36■■□□□ 1.17
CNGA3-205ENST00000436404 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CNGA3-205ENST00000436404 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CNGA3-205ENST00000436404 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
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