RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429707.1

AC004980.1-204, humanhuman

BASIC

Gene AC004980.1, Length 299 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004980.1-204ENST00000429707 KIF1BO60333 1816 aa28.46■■■□□ 2.15
AC004980.1-204ENST00000429707 IQGAP1P46940 1657 aa28.45■■■□□ 2.14
AC004980.1-204ENST00000429707 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.44■■■□□ 2.14
AC004980.1-204ENST00000429707 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
AC004980.1-204ENST00000429707 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
AC004980.1-204ENST00000429707 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.42■■■□□ 2.14
AC004980.1-204ENST00000429707 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.42■■■□□ 2.14
AC004980.1-204ENST00000429707 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.41■■■□□ 2.14
AC004980.1-204ENST00000429707 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
AC004980.1-204ENST00000429707 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
AC004980.1-204ENST00000429707 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.38■■■□□ 2.13
AC004980.1-204ENST00000429707 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
AC004980.1-204ENST00000429707 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.35■■■□□ 2.13
AC004980.1-204ENST00000429707 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
AC004980.1-204ENST00000429707 RGL3Q3MIN7 710 aa28.32■■■□□ 2.12
AC004980.1-204ENST00000429707 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.3■■■□□ 2.12
AC004980.1-204ENST00000429707 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.29■■■□□ 2.12
AC004980.1-204ENST00000429707 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
AC004980.1-204ENST00000429707 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.28■■■□□ 2.12
AC004980.1-204ENST00000429707 BCANQ96GW7 911 aa28.28■■■□□ 2.12
AC004980.1-204ENST00000429707 PPLO60437 1756 aa28.28■■■□□ 2.12
AC004980.1-204ENST00000429707 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.26■■■□□ 2.11
AC004980.1-204ENST00000429707 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
AC004980.1-204ENST00000429707 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.25■■■□□ 2.11
AC004980.1-204ENST00000429707 IFT172Q9UG01 1749 aa28.25■■■□□ 2.11
AC004980.1-204ENST00000429707 TBX22Q9Y458 520 aa28.23■■■□□ 2.11
AC004980.1-204ENST00000429707 DIP2AQ14689 1571 aa28.23■■■□□ 2.11
AC004980.1-204ENST00000429707 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.19■■■□□ 2.1
AC004980.1-204ENST00000429707 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.18■■■□□ 2.1
AC004980.1-204ENST00000429707 CPS1P31327 1500 aa28.18■■■□□ 2.1
AC004980.1-204ENST00000429707 MYOM2P54296 1465 aa28.17■■■□□ 2.1
AC004980.1-204ENST00000429707 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.17■■■□□ 2.1
AC004980.1-204ENST00000429707 CERKQ8TCT0 537 aa28.16■■■□□ 2.1
AC004980.1-204ENST00000429707 KCNA6P17658 529 aa28.15■■■□□ 2.1
AC004980.1-204ENST00000429707 NWD1Q149M9 1564 aa28.15■■■□□ 2.1
AC004980.1-204ENST00000429707 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.15■■■□□ 2.1
AC004980.1-204ENST00000429707 PIK3R4Q99570 1358 aa28.14■■■□□ 2.1
AC004980.1-204ENST00000429707 PIK3C2GO75747 1445 aa28.13■■■□□ 2.09
AC004980.1-204ENST00000429707 ALKQ9UM73 1620 aa28.12■■■□□ 2.09
AC004980.1-204ENST00000429707 METP08581 1390 aa28.11■■■□□ 2.09
AC004980.1-204ENST00000429707 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
AC004980.1-204ENST00000429707 PTPRUQ92729 1446 aa28.1■■■□□ 2.09
AC004980.1-204ENST00000429707 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.1■■■□□ 2.09
AC004980.1-204ENST00000429707 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
AC004980.1-204ENST00000429707 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.09■■■□□ 2.09
AC004980.1-204ENST00000429707 NEUROD1Q13562 356 aa28.08■■■□□ 2.09
AC004980.1-204ENST00000429707 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.08■■■□□ 2.09
AC004980.1-204ENST00000429707 STAC3Q96MF2 364 aa28.07■■■□□ 2.08
AC004980.1-204ENST00000429707 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
AC004980.1-204ENST00000429707 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.06■■■□□ 2.08
AC004980.1-204ENST00000429707 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.03■■■□□ 2.08
AC004980.1-204ENST00000429707 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
AC004980.1-204ENST00000429707 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
AC004980.1-204ENST00000429707 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.01■■■□□ 2.07
AC004980.1-204ENST00000429707 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.01■■■□□ 2.07
AC004980.1-204ENST00000429707 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.99■■■□□ 2.07
AC004980.1-204ENST00000429707 TMEM94Q12767 1356 aa27.99■■■□□ 2.07
AC004980.1-204ENST00000429707 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
AC004980.1-204ENST00000429707 LAMC1P11047 1609 aa27.98■■■□□ 2.07
AC004980.1-204ENST00000429707 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.96■■■□□ 2.07
AC004980.1-204ENST00000429707 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.95■■■□□ 2.07
AC004980.1-204ENST00000429707 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
AC004980.1-204ENST00000429707 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
AC004980.1-204ENST00000429707 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.94■■■□□ 2.06
AC004980.1-204ENST00000429707 PTCH1Q13635 1447 aa27.92■■■□□ 2.06
AC004980.1-204ENST00000429707 ADGRB1O14514 1584 aa27.91■■■□□ 2.06
AC004980.1-204ENST00000429707 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
AC004980.1-204ENST00000429707 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.91■■■□□ 2.06
AC004980.1-204ENST00000429707 TONSLQ96HA7 1378 aa27.9■■■□□ 2.06
AC004980.1-204ENST00000429707 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.89■■■□□ 2.06
AC004980.1-204ENST00000429707 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
AC004980.1-204ENST00000429707 TECPR2O15040 1411 aa27.89■■■□□ 2.06
AC004980.1-204ENST00000429707 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
AC004980.1-204ENST00000429707 FBXO41Q8TF61 875 aa27.88■■■□□ 2.05
AC004980.1-204ENST00000429707 ABCC11Q96J66 1382 aa27.87■■■□□ 2.05
AC004980.1-204ENST00000429707 STK26Q9P289 416 aa27.86■■■□□ 2.05
AC004980.1-204ENST00000429707 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.85■■■□□ 2.05
AC004980.1-204ENST00000429707 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.84■■■□□ 2.05
AC004980.1-204ENST00000429707 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.83■■■□□ 2.05
AC004980.1-204ENST00000429707 MSH6P52701 1360 aa27.82■■■□□ 2.04
AC004980.1-204ENST00000429707 TOM1O60784 492 aa27.8■■■□□ 2.04
AC004980.1-204ENST00000429707 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.79■■■□□ 2.04
AC004980.1-204ENST00000429707 C14orf37Q86TY3 774 aa27.79■■■□□ 2.04
AC004980.1-204ENST00000429707 SIRT1Q96EB6 747 aa27.79■■■□□ 2.04
AC004980.1-204ENST00000429707 DLC1Q96QB1 1528 aa27.78■■■□□ 2.04
AC004980.1-204ENST00000429707 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.78■■■□□ 2.04
AC004980.1-204ENST00000429707 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.78■■■□□ 2.04
AC004980.1-204ENST00000429707 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.78■■■□□ 2.04
AC004980.1-204ENST00000429707 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.77■■■□□ 2.04
AC004980.1-204ENST00000429707 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.76■■■□□ 2.03
AC004980.1-204ENST00000429707 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.76■■■□□ 2.03
AC004980.1-204ENST00000429707 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.76■■■□□ 2.03
AC004980.1-204ENST00000429707 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.75■■■□□ 2.03
AC004980.1-204ENST00000429707 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
AC004980.1-204ENST00000429707 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
AC004980.1-204ENST00000429707 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.74■■■□□ 2.03
AC004980.1-204ENST00000429707 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.74■■■□□ 2.03
AC004980.1-204ENST00000429707 DCCP43146 1447 aa27.74■■■□□ 2.03
AC004980.1-204ENST00000429707 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.7■■■□□ 2.02
AC004980.1-204ENST00000429707 PRAM1Q96QH2 718 aa27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms