RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425753.6

TSTA3-201, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSTA3, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-201ENST00000425753 STRCQ7RTU9 1775 aa29.66■■■□□ 2.34
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TSTA3-201ENST00000425753 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
TSTA3-201ENST00000425753 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.64■■■□□ 2.34
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TSTA3-201ENST00000425753 EID1Q9Y6B2 187 aa29.64■■■□□ 2.33
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TSTA3-201ENST00000425753 RGL3Q3MIN7 710 aa29.61■■■□□ 2.33
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TSTA3-201ENST00000425753 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.55■■■□□ 2.32
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TSTA3-201ENST00000425753 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.5■■■□□ 2.31
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TSTA3-201ENST00000425753 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.48■■■□□ 2.31
TSTA3-201ENST00000425753 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.48■■■□□ 2.31
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TSTA3-201ENST00000425753 TBX22Q9Y458 520 aa29.4■■■□□ 2.3
TSTA3-201ENST00000425753 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.4■■■□□ 2.3
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TSTA3-201ENST00000425753 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.38■■■□□ 2.29
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TSTA3-201ENST00000425753 PIK3R4Q99570 1358 aa29.36■■■□□ 2.29
TSTA3-201ENST00000425753 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.36■■■□□ 2.29
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TSTA3-201ENST00000425753 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
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TSTA3-201ENST00000425753 NWD1Q149M9 1564 aa29.3■■■□□ 2.28
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TSTA3-201ENST00000425753 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
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TSTA3-201ENST00000425753 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.16■■■□□ 2.26
TSTA3-201ENST00000425753 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.15■■■□□ 2.26
TSTA3-201ENST00000425753 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.15■■■□□ 2.26
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TSTA3-201ENST00000425753 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
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TSTA3-201ENST00000425753 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.08■■■□□ 2.25
TSTA3-201ENST00000425753 SIRT1Q96EB6 747 aa29.08■■■□□ 2.25
TSTA3-201ENST00000425753 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.07■■■□□ 2.24
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TSTA3-201ENST00000425753 STK26Q9P289 416 aa29.03■■■□□ 2.24
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TSTA3-201ENST00000425753 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
TSTA3-201ENST00000425753 CARD11Q9BXL7 1154 aa29■■■□□ 2.23
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TSTA3-201ENST00000425753 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.94■■■□□ 2.22
TSTA3-201ENST00000425753 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
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TSTA3-201ENST00000425753 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.93■■■□□ 2.22
TSTA3-201ENST00000425753 CERKQ8TCT0 537 aa28.91■■■□□ 2.22
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TSTA3-201ENST00000425753 DCCP43146 1447 aa28.9■■■□□ 2.22
TSTA3-201ENST00000425753 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
TSTA3-201ENST00000425753 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
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