RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413554.5

TNS1-204, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5

Gene TNS1, Length 1,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-204ENST00000413554 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
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TNS1-204ENST00000413554 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.6■□□□□ 0.89
TNS1-204ENST00000413554 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
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TNS1-204ENST00000413554 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.58■□□□□ 0.89
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TNS1-204ENST00000413554 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
TNS1-204ENST00000413554 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.52■□□□□ 0.88
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TNS1-204ENST00000413554 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.39■□□□□ 0.85
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TNS1-204ENST00000413554 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.33■□□□□ 0.85
TNS1-204ENST00000413554 PIK3R4Q99570 1358 aa20.33■□□□□ 0.84
TNS1-204ENST00000413554 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.32■□□□□ 0.84
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TNS1-204ENST00000413554 PTPRUQ92729 1446 aa20.29■□□□□ 0.84
TNS1-204ENST00000413554 LAMC1P11047 1609 aa20.29■□□□□ 0.84
TNS1-204ENST00000413554 ADGRB1O14514 1584 aa20.28■□□□□ 0.84
TNS1-204ENST00000413554 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.28■□□□□ 0.84
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TNS1-204ENST00000413554 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.27■□□□□ 0.83
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TNS1-204ENST00000413554 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TNS1-204ENST00000413554 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TNS1-204ENST00000413554 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TNS1-204ENST00000413554 ABCC11Q96J66 1382 aa20.25■□□□□ 0.83
TNS1-204ENST00000413554 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TNS1-204ENST00000413554 STK26Q9P289 416 aa20.24■□□□□ 0.83
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TNS1-204ENST00000413554 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.21■□□□□ 0.83
TNS1-204ENST00000413554 TECPR2O15040 1411 aa20.21■□□□□ 0.83
TNS1-204ENST00000413554 NWD1Q149M9 1564 aa20.2■□□□□ 0.82
TNS1-204ENST00000413554 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.2■□□□□ 0.82
TNS1-204ENST00000413554 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.2■□□□□ 0.82
TNS1-204ENST00000413554 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TNS1-204ENST00000413554 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.17■□□□□ 0.82
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TNS1-204ENST00000413554 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.16■□□□□ 0.82
TNS1-204ENST00000413554 PTCH1Q13635 1447 aa20.16■□□□□ 0.82
TNS1-204ENST00000413554 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
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TNS1-204ENST00000413554 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.15■□□□□ 0.82
TNS1-204ENST00000413554 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.14■□□□□ 0.81
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TNS1-204ENST00000413554 PRAM1Q96QH2 718 aa20.13■□□□□ 0.81
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TNS1-204ENST00000413554 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.1■□□□□ 0.81
TNS1-204ENST00000413554 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TNS1-204ENST00000413554 USP47Q96K76 1375 aa20.09■□□□□ 0.81
TNS1-204ENST00000413554 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
TNS1-204ENST00000413554 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.07■□□□□ 0.8
TNS1-204ENST00000413554 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
TNS1-204ENST00000413554 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TNS1-204ENST00000413554 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
TNS1-204ENST00000413554 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.05■□□□□ 0.8
TNS1-204ENST00000413554 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
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