RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412307.3

C10orf55-202, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene C10orf55, Length 2,360 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-202ENST00000412307 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
C10orf55-202ENST00000412307 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.93■■■□□ 2.22
C10orf55-202ENST00000412307 ADGRB3O60242 1522 aa28.93■■■□□ 2.22
C10orf55-202ENST00000412307 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.92■■■□□ 2.22
C10orf55-202ENST00000412307 LAMC1P11047 1609 aa28.92■■■□□ 2.22
C10orf55-202ENST00000412307 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.91■■■□□ 2.22
C10orf55-202ENST00000412307 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.21
C10orf55-202ENST00000412307 MYOM2P54296 1465 aa28.87■■■□□ 2.21
C10orf55-202ENST00000412307 IFT172Q9UG01 1749 aa28.87■■■□□ 2.21
C10orf55-202ENST00000412307 AGLP35573 1532 aa28.85■■■□□ 2.21
C10orf55-202ENST00000412307 REREQ9P2R6 1566 aa28.85■■■□□ 2.21
C10orf55-202ENST00000412307 TMF1P82094 1093 aa28.83■■■□□ 2.21
C10orf55-202ENST00000412307 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.83■■■□□ 2.21
C10orf55-202ENST00000412307 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.83■■■□□ 2.21
C10orf55-202ENST00000412307 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.83■■■□□ 2.21
C10orf55-202ENST00000412307 PIK3C2BO00750 1634 aa28.83■■■□□ 2.21
C10orf55-202ENST00000412307 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
C10orf55-202ENST00000412307 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
C10orf55-202ENST00000412307 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.81■■■□□ 2.2
C10orf55-202ENST00000412307 IQGAP1P46940 1657 aa28.81■■■□□ 2.2
C10orf55-202ENST00000412307 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.8■■■□□ 2.2
C10orf55-202ENST00000412307 PPLO60437 1756 aa28.79■■■□□ 2.2
C10orf55-202ENST00000412307 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.78■■■□□ 2.2
C10orf55-202ENST00000412307 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
C10orf55-202ENST00000412307 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.77■■■□□ 2.2
C10orf55-202ENST00000412307 MRS2Q9HD23 443 aa28.76■■■□□ 2.2
C10orf55-202ENST00000412307 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.76■■■□□ 2.2
C10orf55-202ENST00000412307 PIK3C2GO75747 1445 aa28.76■■■□□ 2.19
C10orf55-202ENST00000412307 ERVK-7P63135 1459 aa28.75■■■□□ 2.19
C10orf55-202ENST00000412307 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
C10orf55-202ENST00000412307 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.75■■■□□ 2.19
C10orf55-202ENST00000412307 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.75■■■□□ 2.19
C10orf55-202ENST00000412307 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
C10orf55-202ENST00000412307 PANK3Q9H999 370 aa28.74■■■□□ 2.19
C10orf55-202ENST00000412307 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.74■■■□□ 2.19
C10orf55-202ENST00000412307 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.74■■■□□ 2.19
C10orf55-202ENST00000412307 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.73■■■□□ 2.19
C10orf55-202ENST00000412307 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.72■■■□□ 2.19
C10orf55-202ENST00000412307 BCANQ96GW7 911 aa28.71■■■□□ 2.19
C10orf55-202ENST00000412307 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
C10orf55-202ENST00000412307 ZMYM3Q14202 1370 aa28.7■■■□□ 2.18
C10orf55-202ENST00000412307 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.69■■■□□ 2.18
C10orf55-202ENST00000412307 FKBP8Q14318 412 aa28.68■■■□□ 2.18
C10orf55-202ENST00000412307 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
C10orf55-202ENST00000412307 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.65■■■□□ 2.18
C10orf55-202ENST00000412307 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
C10orf55-202ENST00000412307 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.63■■■□□ 2.17
C10orf55-202ENST00000412307 ADGRB1O14514 1584 aa28.63■■■□□ 2.17
C10orf55-202ENST00000412307 STK26Q9P289 416 aa28.62■■■□□ 2.17
C10orf55-202ENST00000412307 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
C10orf55-202ENST00000412307 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
C10orf55-202ENST00000412307 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.59■■■□□ 2.17
C10orf55-202ENST00000412307 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.59■■■□□ 2.17
C10orf55-202ENST00000412307 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.58■■■□□ 2.17
C10orf55-202ENST00000412307 CDCA8Q53HL2 280 aa28.57■■■□□ 2.16
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C10orf55-202ENST00000412307 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.54■■■□□ 2.16
C10orf55-202ENST00000412307 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.54■■■□□ 2.16
C10orf55-202ENST00000412307 TMC1Q8TDI8 760 aa28.54■■■□□ 2.16
C10orf55-202ENST00000412307 ZFYVE9O95405 1425 aa28.54■■■□□ 2.16
C10orf55-202ENST00000412307 RALBP1Q15311 655 aa28.53■■■□□ 2.16
C10orf55-202ENST00000412307 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
C10orf55-202ENST00000412307 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
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C10orf55-202ENST00000412307 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.48■■■□□ 2.15
C10orf55-202ENST00000412307 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.47■■■□□ 2.15
C10orf55-202ENST00000412307 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.47■■■□□ 2.15
C10orf55-202ENST00000412307 TNRQ92752 1358 aa28.47■■■□□ 2.15
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C10orf55-202ENST00000412307 MYOM1P52179 1685 aa28.44■■■□□ 2.14
C10orf55-202ENST00000412307 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.44■■■□□ 2.14
C10orf55-202ENST00000412307 NEFLP07196 543 aa28.44■■■□□ 2.14
C10orf55-202ENST00000412307 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.43■■■□□ 2.14
C10orf55-202ENST00000412307 SLC24A1O60721 1099 aa28.43■■■□□ 2.14
C10orf55-202ENST00000412307 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.43■■■□□ 2.14
C10orf55-202ENST00000412307 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.43■■■□□ 2.14
C10orf55-202ENST00000412307 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
C10orf55-202ENST00000412307 ALKQ9UM73 1620 aa28.41■■■□□ 2.14
C10orf55-202ENST00000412307 PRAM1Q96QH2 718 aa28.41■■■□□ 2.14
C10orf55-202ENST00000412307 CABP2Q9NPB3 220 aa28.39■■■□□ 2.14
C10orf55-202ENST00000412307 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
C10orf55-202ENST00000412307 NLRP13Q86W25 1043 aa28.39■■■□□ 2.14
C10orf55-202ENST00000412307 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
C10orf55-202ENST00000412307 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
C10orf55-202ENST00000412307 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
C10orf55-202ENST00000412307 POGKQ9P215 609 aa28.37■■■□□ 2.13
C10orf55-202ENST00000412307 PTPRMP28827 1452 aa28.34■■■□□ 2.13
C10orf55-202ENST00000412307 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.34■■■□□ 2.13
C10orf55-202ENST00000412307 EVC2Q86UK5 1308 aa28.33■■■□□ 2.13
C10orf55-202ENST00000412307 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.31■■■□□ 2.12
C10orf55-202ENST00000412307 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.12
C10orf55-202ENST00000412307 ANP32EQ9BTT0 268 aa28.3■■■□□ 2.12
C10orf55-202ENST00000412307 LTKP29376 864 aa28.3■■■□□ 2.12
C10orf55-202ENST00000412307 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
C10orf55-202ENST00000412307 METP08581 1390 aa28.29■■■□□ 2.12
C10orf55-202ENST00000412307 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.29■■■□□ 2.12
C10orf55-202ENST00000412307 PPP2R1AP30153 589 aa28.29■■■□□ 2.12
C10orf55-202ENST00000412307 C3P01024 1663 aa28.28■■■□□ 2.12
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