RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406506.3

HOXD12-202, Transcript of homeobox D12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD12, Length 1,318 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-202ENST00000406506 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXD12-202ENST00000406506 PPLO60437 1756 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXD12-202ENST00000406506 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXD12-202ENST00000406506 EID1Q9Y6B2 187 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXD12-202ENST00000406506 IFT172Q9UG01 1749 aa28.39■■■□□ 2.13
HOXD12-202ENST00000406506 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.37■■■□□ 2.13
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
HOXD12-202ENST00000406506 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXD12-202ENST00000406506 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.12
HOXD12-202ENST00000406506 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD12-202ENST00000406506 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.31■■■□□ 2.12
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HOXD12-202ENST00000406506 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
HOXD12-202ENST00000406506 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
HOXD12-202ENST00000406506 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXD12-202ENST00000406506 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD12-202ENST00000406506 DIP2AQ14689 1571 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD12-202ENST00000406506 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD12-202ENST00000406506 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
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HOXD12-202ENST00000406506 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
HOXD12-202ENST00000406506 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXD12-202ENST00000406506 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
HOXD12-202ENST00000406506 RGL3Q3MIN7 710 aa28.2■■■□□ 2.11
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HOXD12-202ENST00000406506 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
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HOXD12-202ENST00000406506 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXD12-202ENST00000406506 BCANQ96GW7 911 aa28.18■■■□□ 2.1
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HOXD12-202ENST00000406506 MYOM2P54296 1465 aa28.16■■■□□ 2.1
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HOXD12-202ENST00000406506 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD12-202ENST00000406506 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
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HOXD12-202ENST00000406506 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.07■■■□□ 2.08
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HOXD12-202ENST00000406506 KCNA6P17658 529 aa28.03■■■□□ 2.08
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HOXD12-202ENST00000406506 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.99■■■□□ 2.07
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HOXD12-202ENST00000406506 ABCC11Q96J66 1382 aa27.79■■■□□ 2.04
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HOXD12-202ENST00000406506 DCCP43146 1447 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXD12-202ENST00000406506 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.71■■■□□ 2.03
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HOXD12-202ENST00000406506 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD12-202ENST00000406506 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD12-202ENST00000406506 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD12-202ENST00000406506 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD12-202ENST00000406506 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD12-202ENST00000406506 SIRT1Q96EB6 747 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD12-202ENST00000406506 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD12-202ENST00000406506 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.64■■■□□ 2.01
HOXD12-202ENST00000406506 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
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