RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380277.6

PXDC1-201, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene PXDC1, Length 1,538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-201ENST00000380277 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.85■■□□□ 1.09
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PXDC1-201ENST00000380277 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PXDC1-201ENST00000380277 IQGAP1P46940 1657 aa21.81■■□□□ 1.08
PXDC1-201ENST00000380277 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.81■■□□□ 1.08
PXDC1-201ENST00000380277 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
PXDC1-201ENST00000380277 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PXDC1-201ENST00000380277 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PXDC1-201ENST00000380277 KIF1BO60333 1816 aa21.78■■□□□ 1.08
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PXDC1-201ENST00000380277 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PXDC1-201ENST00000380277 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.75■■□□□ 1.07
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PXDC1-201ENST00000380277 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.73■■□□□ 1.07
PXDC1-201ENST00000380277 BCANQ96GW7 911 aa21.72■■□□□ 1.07
PXDC1-201ENST00000380277 RGL3Q3MIN7 710 aa21.71■■□□□ 1.07
PXDC1-201ENST00000380277 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.71■■□□□ 1.07
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PXDC1-201ENST00000380277 TBX22Q9Y458 520 aa21.65■■□□□ 1.06
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PXDC1-201ENST00000380277 NEUROD1Q13562 356 aa21.5■■□□□ 1.03
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PXDC1-201ENST00000380277 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.28■■□□□ 1
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PXDC1-201ENST00000380277 ATF3P18847 181 aa21.27■■□□□ 1
PXDC1-201ENST00000380277 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.27■■□□□ 1
PXDC1-201ENST00000380277 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.27■■□□□ 1
PXDC1-201ENST00000380277 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.27■■□□□ 1
PXDC1-201ENST00000380277 DCCP43146 1447 aa21.27■■□□□ 1
PXDC1-201ENST00000380277 DLC1Q96QB1 1528 aa21.26■□□□□ 0.99
PXDC1-201ENST00000380277 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
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