RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa27.68■■■□□ 2.02
OPN3-201ENST00000366554 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
OPN3-201ENST00000366554 PTPRGP23470 1445 aa27.67■■■□□ 2.02
OPN3-201ENST00000366554 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
OPN3-201ENST00000366554 LAMC1P11047 1609 aa27.66■■■□□ 2.02
OPN3-201ENST00000366554 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.65■■■□□ 2.02
OPN3-201ENST00000366554 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.64■■■□□ 2.02
OPN3-201ENST00000366554 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
OPN3-201ENST00000366554 PODXL2Q9NZ53 605 aa27.64■■■□□ 2.02
OPN3-201ENST00000366554 DDX11L8A8MPP1 907 aa27.64■■■□□ 2.01
OPN3-201ENST00000366554 TMF1P82094 1093 aa27.64■■■□□ 2.01
OPN3-201ENST00000366554 E9PSI1 815 aa27.63■■■□□ 2.01
OPN3-201ENST00000366554 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
OPN3-201ENST00000366554 COG6Q9Y2V7 657 aa27.63■■■□□ 2.01
OPN3-201ENST00000366554 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
OPN3-201ENST00000366554 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
OPN3-201ENST00000366554 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
OPN3-201ENST00000366554 PANK1Q8TE04 598 aa27.61■■■□□ 2.01
OPN3-201ENST00000366554 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.61■■■□□ 2.01
OPN3-201ENST00000366554 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
OPN3-201ENST00000366554 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.6■■■□□ 2.01
OPN3-201ENST00000366554 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
OPN3-201ENST00000366554 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-201ENST00000366554 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-201ENST00000366554 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.58■■■□□ 2.01
OPN3-201ENST00000366554 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.58■■■□□ 2.01
OPN3-201ENST00000366554 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.58■■■□□ 2.01
OPN3-201ENST00000366554 PIK3C2GO75747 1445 aa27.57■■■□□ 2
OPN3-201ENST00000366554 APAF1O14727 1248 aa27.57■■■□□ 2
OPN3-201ENST00000366554 PRDM4Q9UKN5 801 aa27.57■■■□□ 2
OPN3-201ENST00000366554 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa27.57■■■□□ 2
OPN3-201ENST00000366554 GAS2L3Q86XJ1 694 aa27.57■■■□□ 2
OPN3-201ENST00000366554 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.56■■■□□ 2
OPN3-201ENST00000366554 ABCC2Q92887 1545 aa27.56■■■□□ 2
OPN3-201ENST00000366554 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.56■■■□□ 2
OPN3-201ENST00000366554 AAMPQ13685 434 aa27.55■■■□□ 2
OPN3-201ENST00000366554 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.55■■■□□ 2
OPN3-201ENST00000366554 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.54■■■□□ 2
OPN3-201ENST00000366554 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.54■■■□□ 2
OPN3-201ENST00000366554 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.53■■■□□ 2
OPN3-201ENST00000366554 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.53■■■□□ 2
OPN3-201ENST00000366554 DDIT3P35638 169 aa27.53■■■□□ 2
OPN3-201ENST00000366554 C22orf23Q9BZE7 217 aa27.53■■■□□ 2
OPN3-201ENST00000366554 A2MP01023 1474 aa27.53■■■□□ 2
OPN3-201ENST00000366554 PLXNC1O60486 1568 aa27.52■■■□□ 2
OPN3-201ENST00000366554 RGL3Q3MIN7 710 aa27.51■■□□□ 1.99
OPN3-201ENST00000366554 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.51■■□□□ 1.99
OPN3-201ENST00000366554 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
OPN3-201ENST00000366554 OFD1O75665 1012 aa27.48■■□□□ 1.99
OPN3-201ENST00000366554 NGEFQ8N5V2 710 aa27.48■■□□□ 1.99
OPN3-201ENST00000366554 DISP1Q96F81 1524 aa27.48■■□□□ 1.99
OPN3-201ENST00000366554 TERF1P54274 439 aa27.48■■□□□ 1.99
OPN3-201ENST00000366554 KIAA0556O60303 1618 aa27.47■■□□□ 1.99
OPN3-201ENST00000366554 RIPK4P57078 832 aa27.47■■□□□ 1.99
OPN3-201ENST00000366554 PPP1R9BQ96SB3 815 aa27.47■■□□□ 1.99
OPN3-201ENST00000366554 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.47■■□□□ 1.99
OPN3-201ENST00000366554 ZSCAN30Q86W11 494 aa27.45■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.45■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 CCDC173Q0VFZ6 552 aa27.44■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 PLEKHG5O94827 1062 aa27.44■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 HSCBQ8IWL3 235 aa27.44■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.44■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.43■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 ADAMTS12P58397 1594 aa27.43■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 PLA2R1Q13018 1463 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 NUP160Q12769 1436 aa27.42■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 RLBP1P12271 317 aa27.41■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.41■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 MAP7D2Q96T17 732 aa27.4■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.4■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 RARSP54136 660 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 PBRM1Q86U86 1689 aa27.39■■□□□ 1.98
OPN3-201ENST00000366554 TSPY4P0CV99 314 aa27.38■■□□□ 1.97
OPN3-201ENST00000366554 TSPY10P0CW01 314 aa27.38■■□□□ 1.97
OPN3-201ENST00000366554 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
OPN3-201ENST00000366554 WWC1Q8IX03 1113 aa27.38■■□□□ 1.97
OPN3-201ENST00000366554 SMC5Q8IY18 1101 aa27.37■■□□□ 1.97
OPN3-201ENST00000366554 GBP4Q96PP9 640 aa27.37■■□□□ 1.97
OPN3-201ENST00000366554 RBM10P98175 930 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
OPN3-201ENST00000366554 SYNMO15061 1565 aa27.37■■□□□ 1.97
OPN3-201ENST00000366554 RAB3GAP1Q15042 981 aa27.36■■□□□ 1.97
OPN3-201ENST00000366554 SNX21Q969T3 373 aa27.36■■□□□ 1.97
OPN3-201ENST00000366554 SYNJ2O15056 1496 aa27.36■■□□□ 1.97
OPN3-201ENST00000366554 TNNQ9UQP3 1299 aa27.36■■□□□ 1.97
OPN3-201ENST00000366554 PTMSP20962 102 aa27.35■■□□□ 1.97
OPN3-201ENST00000366554 NASPP49321 788 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
OPN3-201ENST00000366554 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
OPN3-201ENST00000366554 MSNP26038 577 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
OPN3-201ENST00000366554 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.31■■□□□ 1.96
OPN3-201ENST00000366554 RBM25P49756 843 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
OPN3-201ENST00000366554 FAM13BQ9NYF5 915 aa27.29■■□□□ 1.96
OPN3-201ENST00000366554 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms