RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362091.8

FBXO18-201, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXO18, Length 3,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-201ENST00000362091 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.84■■□□□ 1.09
FBXO18-201ENST00000362091 COG6Q9Y2V7 657 aa21.84■■□□□ 1.09
FBXO18-201ENST00000362091 BECN1Q14457 450 aa21.83■■□□□ 1.09
FBXO18-201ENST00000362091 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
FBXO18-201ENST00000362091 PANK1Q8TE04 598 aa21.83■■□□□ 1.09
FBXO18-201ENST00000362091 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.83■■□□□ 1.09
FBXO18-201ENST00000362091 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
FBXO18-201ENST00000362091 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
FBXO18-201ENST00000362091 JPH4Q96JJ6 628 aa21.83■■□□□ 1.08
FBXO18-201ENST00000362091 ATP10BO94823 1461 aa21.82■■□□□ 1.08
FBXO18-201ENST00000362091 LAMC1P11047 1609 aa21.81■■□□□ 1.08
FBXO18-201ENST00000362091 IFT140Q96RY7 1462 aa21.81■■□□□ 1.08
FBXO18-201ENST00000362091 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.8■■□□□ 1.08
FBXO18-201ENST00000362091 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.8■■□□□ 1.08
FBXO18-201ENST00000362091 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.8■■□□□ 1.08
FBXO18-201ENST00000362091 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.79■■□□□ 1.08
FBXO18-201ENST00000362091 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
FBXO18-201ENST00000362091 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.77■■□□□ 1.08
FBXO18-201ENST00000362091 E9PSI1 815 aa21.77■■□□□ 1.08
FBXO18-201ENST00000362091 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
FBXO18-201ENST00000362091 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.76■■□□□ 1.07
FBXO18-201ENST00000362091 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.76■■□□□ 1.07
FBXO18-201ENST00000362091 ABCA8O94911 1581 aa21.75■■□□□ 1.07
FBXO18-201ENST00000362091 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
FBXO18-201ENST00000362091 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.75■■□□□ 1.07
FBXO18-201ENST00000362091 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.75■■□□□ 1.07
FBXO18-201ENST00000362091 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
FBXO18-201ENST00000362091 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.74■■□□□ 1.07
FBXO18-201ENST00000362091 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
FBXO18-201ENST00000362091 SYNJ2O15056 1496 aa21.74■■□□□ 1.07
FBXO18-201ENST00000362091 NLRP1Q9C000 1473 aa21.73■■□□□ 1.07
FBXO18-201ENST00000362091 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.73■■□□□ 1.07
FBXO18-201ENST00000362091 PIK3C2GO75747 1445 aa21.72■■□□□ 1.07
FBXO18-201ENST00000362091 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.72■■□□□ 1.07
FBXO18-201ENST00000362091 NEUROD2Q15784 382 aa21.72■■□□□ 1.07
FBXO18-201ENST00000362091 PDE3AQ14432 1141 aa21.72■■□□□ 1.07
FBXO18-201ENST00000362091 NUP160Q12769 1436 aa21.71■■□□□ 1.07
FBXO18-201ENST00000362091 TNNQ9UQP3 1299 aa21.71■■□□□ 1.07
FBXO18-201ENST00000362091 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
FBXO18-201ENST00000362091 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
FBXO18-201ENST00000362091 PANK2Q9BZ23 570 aa21.69■■□□□ 1.06
FBXO18-201ENST00000362091 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.69■■□□□ 1.06
FBXO18-201ENST00000362091 CDCA8Q53HL2 280 aa21.68■■□□□ 1.06
FBXO18-201ENST00000362091 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.68■■□□□ 1.06
FBXO18-201ENST00000362091 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.68■■□□□ 1.06
FBXO18-201ENST00000362091 UNC13BO14795 1591 aa21.68■■□□□ 1.06
FBXO18-201ENST00000362091 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.68■■□□□ 1.06
FBXO18-201ENST00000362091 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.67■■□□□ 1.06
FBXO18-201ENST00000362091 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
FBXO18-201ENST00000362091 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
FBXO18-201ENST00000362091 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.67■■□□□ 1.06
FBXO18-201ENST00000362091 ABCC2Q92887 1545 aa21.67■■□□□ 1.06
FBXO18-201ENST00000362091 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.66■■□□□ 1.06
FBXO18-201ENST00000362091 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.66■■□□□ 1.06
FBXO18-201ENST00000362091 WWC1Q8IX03 1113 aa21.66■■□□□ 1.06
FBXO18-201ENST00000362091 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
FBXO18-201ENST00000362091 SYNMO15061 1565 aa21.65■■□□□ 1.06
FBXO18-201ENST00000362091 RLBP1P12271 317 aa21.65■■□□□ 1.06
FBXO18-201ENST00000362091 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.63■■□□□ 1.05
FBXO18-201ENST00000362091 MCM4P33991 863 aa21.62■■□□□ 1.05
FBXO18-201ENST00000362091 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.62■■□□□ 1.05
FBXO18-201ENST00000362091 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
FBXO18-201ENST00000362091 IQGAP1P46940 1657 aa21.61■■□□□ 1.05
FBXO18-201ENST00000362091 PREX2Q70Z35 1606 aa21.61■■□□□ 1.05
FBXO18-201ENST00000362091 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
FBXO18-201ENST00000362091 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.6■■□□□ 1.05
FBXO18-201ENST00000362091 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
FBXO18-201ENST00000362091 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
FBXO18-201ENST00000362091 MYOM1P52179 1685 aa21.59■■□□□ 1.05
FBXO18-201ENST00000362091 MADDQ8WXG6 1647 aa21.59■■□□□ 1.05
FBXO18-201ENST00000362091 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.59■■□□□ 1.05
FBXO18-201ENST00000362091 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.59■■□□□ 1.05
FBXO18-201ENST00000362091 FSD2A1L4K1 749 aa21.58■■□□□ 1.05
FBXO18-201ENST00000362091 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
FBXO18-201ENST00000362091 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.57■■□□□ 1.04
FBXO18-201ENST00000362091 ATP10AO60312 1499 aa21.57■■□□□ 1.04
FBXO18-201ENST00000362091 TRAK2O60296 914 aa21.56■■□□□ 1.04
FBXO18-201ENST00000362091 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
FBXO18-201ENST00000362091 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.54■■□□□ 1.04
FBXO18-201ENST00000362091 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.53■■□□□ 1.04
FBXO18-201ENST00000362091 CLCN1P35523 988 aa21.52■■□□□ 1.04
FBXO18-201ENST00000362091 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.52■■□□□ 1.04
FBXO18-201ENST00000362091 PLXNC1O60486 1568 aa21.52■■□□□ 1.04
FBXO18-201ENST00000362091 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.52■■□□□ 1.03
FBXO18-201ENST00000362091 NGEFQ8N5V2 710 aa21.51■■□□□ 1.03
FBXO18-201ENST00000362091 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.51■■□□□ 1.03
FBXO18-201ENST00000362091 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
FBXO18-201ENST00000362091 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.5■■□□□ 1.03
FBXO18-201ENST00000362091 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.49■■□□□ 1.03
FBXO18-201ENST00000362091 RUNDC1Q96C34 613 aa21.47■■□□□ 1.03
FBXO18-201ENST00000362091 MRE11P49959 708 aa21.47■■□□□ 1.03
FBXO18-201ENST00000362091 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
FBXO18-201ENST00000362091 MORC1Q86VD1 984 aa21.46■■□□□ 1.03
FBXO18-201ENST00000362091 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.46■■□□□ 1.03
FBXO18-201ENST00000362091 CEP152O94986 1710 aa21.46■■□□□ 1.03
FBXO18-201ENST00000362091 ERCC6Q03468 1493 aa21.46■■□□□ 1.03
FBXO18-201ENST00000362091 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
FBXO18-201ENST00000362091 GRPEL1Q9HAV7 217 aa21.46■■□□□ 1.03
FBXO18-201ENST00000362091 ERVK-7P63135 1459 aa21.45■■□□□ 1.02
FBXO18-201ENST00000362091 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.4 ms