RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.27■■□□□ 1.16
CSAG1-201ENST00000361211 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG1-201ENST00000361211 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CSAG1-201ENST00000361211 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CSAG1-201ENST00000361211 CPS1P31327 1500 aa22.25■■□□□ 1.15
CSAG1-201ENST00000361211 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG1-201ENST00000361211 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.23■■□□□ 1.15
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CSAG1-201ENST00000361211 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG1-201ENST00000361211 KIF1BO60333 1816 aa22.2■■□□□ 1.14
CSAG1-201ENST00000361211 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CSAG1-201ENST00000361211 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.18■■□□□ 1.14
CSAG1-201ENST00000361211 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CSAG1-201ENST00000361211 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CSAG1-201ENST00000361211 BCANQ96GW7 911 aa22.18■■□□□ 1.14
CSAG1-201ENST00000361211 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.16■■□□□ 1.14
CSAG1-201ENST00000361211 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.16■■□□□ 1.14
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.14■■□□□ 1.14
CSAG1-201ENST00000361211 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.13■■□□□ 1.13
CSAG1-201ENST00000361211 NWD1Q149M9 1564 aa22.13■■□□□ 1.13
CSAG1-201ENST00000361211 HRCP23327 699 aa22.12■■□□□ 1.13
CSAG1-201ENST00000361211 DIP2AQ14689 1571 aa22.11■■□□□ 1.13
CSAG1-201ENST00000361211 KCNA6P17658 529 aa22.1■■□□□ 1.13
CSAG1-201ENST00000361211 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.1■■□□□ 1.13
CSAG1-201ENST00000361211 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.09■■□□□ 1.13
CSAG1-201ENST00000361211 TBX22Q9Y458 520 aa22.09■■□□□ 1.13
CSAG1-201ENST00000361211 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CSAG1-201ENST00000361211 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.08■■□□□ 1.13
CSAG1-201ENST00000361211 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
CSAG1-201ENST00000361211 PPLO60437 1756 aa22.07■■□□□ 1.12
CSAG1-201ENST00000361211 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CSAG1-201ENST00000361211 ALKQ9UM73 1620 aa22.06■■□□□ 1.12
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM94Q12767 1356 aa22.04■■□□□ 1.12
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.04■■□□□ 1.12
CSAG1-201ENST00000361211 PTPRUQ92729 1446 aa22.04■■□□□ 1.12
CSAG1-201ENST00000361211 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.04■■□□□ 1.12
CSAG1-201ENST00000361211 RGL3Q3MIN7 710 aa22.03■■□□□ 1.12
CSAG1-201ENST00000361211 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CSAG1-201ENST00000361211 PIK3R4Q99570 1358 aa22.01■■□□□ 1.11
CSAG1-201ENST00000361211 IFT172Q9UG01 1749 aa22.01■■□□□ 1.11
CSAG1-201ENST00000361211 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CSAG1-201ENST00000361211 METP08581 1390 aa22■■□□□ 1.11
CSAG1-201ENST00000361211 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CSAG1-201ENST00000361211 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CSAG1-201ENST00000361211 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CSAG1-201ENST00000361211 TOM1O60784 492 aa21.98■■□□□ 1.11
CSAG1-201ENST00000361211 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.98■■□□□ 1.11
CSAG1-201ENST00000361211 PIP4K2BP78356 416 aa21.97■■□□□ 1.11
CSAG1-201ENST00000361211 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.96■■□□□ 1.11
CSAG1-201ENST00000361211 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CSAG1-201ENST00000361211 PIK3C2GO75747 1445 aa21.9■■□□□ 1.1
CSAG1-201ENST00000361211 MYOM2P54296 1465 aa21.89■■□□□ 1.09
CSAG1-201ENST00000361211 MSH6P52701 1360 aa21.88■■□□□ 1.09
CSAG1-201ENST00000361211 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.88■■□□□ 1.09
CSAG1-201ENST00000361211 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.88■■□□□ 1.09
CSAG1-201ENST00000361211 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.88■■□□□ 1.09
CSAG1-201ENST00000361211 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CSAG1-201ENST00000361211 PTCH1Q13635 1447 aa21.84■■□□□ 1.09
CSAG1-201ENST00000361211 HSPA1LP34931 641 aa21.84■■□□□ 1.09
CSAG1-201ENST00000361211 C14orf37Q86TY3 774 aa21.84■■□□□ 1.09
CSAG1-201ENST00000361211 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.83■■□□□ 1.09
CSAG1-201ENST00000361211 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
CSAG1-201ENST00000361211 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.83■■□□□ 1.08
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.8■■□□□ 1.08
CSAG1-201ENST00000361211 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.8■■□□□ 1.08
CSAG1-201ENST00000361211 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.79■■□□□ 1.08
CSAG1-201ENST00000361211 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.79■■□□□ 1.08
CSAG1-201ENST00000361211 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.79■■□□□ 1.08
CSAG1-201ENST00000361211 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.79■■□□□ 1.08
CSAG1-201ENST00000361211 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.79■■□□□ 1.08
CSAG1-201ENST00000361211 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.79■■□□□ 1.08
CSAG1-201ENST00000361211 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CSAG1-201ENST00000361211 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.78■■□□□ 1.08
CSAG1-201ENST00000361211 LAMC1P11047 1609 aa21.77■■□□□ 1.08
CSAG1-201ENST00000361211 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CSAG1-201ENST00000361211 TECPR2O15040 1411 aa21.76■■□□□ 1.07
CSAG1-201ENST00000361211 DCCP43146 1447 aa21.76■■□□□ 1.07
CSAG1-201ENST00000361211 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.76■■□□□ 1.07
CSAG1-201ENST00000361211 SLAIN2Q9P270 581 aa21.76■■□□□ 1.07
CSAG1-201ENST00000361211 STK26Q9P289 416 aa21.76■■□□□ 1.07
CSAG1-201ENST00000361211 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CSAG1-201ENST00000361211 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.75■■□□□ 1.07
CSAG1-201ENST00000361211 ATF3P18847 181 aa21.74■■□□□ 1.07
CSAG1-201ENST00000361211 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.74■■□□□ 1.07
CSAG1-201ENST00000361211 ABCC11Q96J66 1382 aa21.73■■□□□ 1.07
CSAG1-201ENST00000361211 ADGRB1O14514 1584 aa21.72■■□□□ 1.07
CSAG1-201ENST00000361211 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.72■■□□□ 1.07
CSAG1-201ENST00000361211 MST1RQ04912 1400 aa21.72■■□□□ 1.07
CSAG1-201ENST00000361211 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.7■■□□□ 1.06
CSAG1-201ENST00000361211 STAC3Q96MF2 364 aa21.69■■□□□ 1.06
CSAG1-201ENST00000361211 NEUROD1Q13562 356 aa21.66■■□□□ 1.06
CSAG1-201ENST00000361211 BRINP3Q76B58 766 aa21.65■■□□□ 1.06
CSAG1-201ENST00000361211 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.65■■□□□ 1.06
CSAG1-201ENST00000361211 PHLPP1O60346 1717 aa21.64■■□□□ 1.06
CSAG1-201ENST00000361211 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.64■■□□□ 1.05
CSAG1-201ENST00000361211 DLC1Q96QB1 1528 aa21.64■■□□□ 1.05
CSAG1-201ENST00000361211 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.64■■□□□ 1.05
CSAG1-201ENST00000361211 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms