RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 TERF2IPQ9NYB0 399 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF5Q12774 1597 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 ABCC1P33527 1531 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 SLAIN2Q9P270 581 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 ADGRL2O95490 1459 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 NEO1Q92859 1461 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 ARAP3Q8WWN8 1544 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 CFAP70Q5T0N1 1121 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 ATP10AO60312 1499 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 PRAM1Q96QH2 718 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 TMF1P82094 1093 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 CFAP53Q96M91 514 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 WAPLQ7Z5K2 1190 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 RXRBP28702 533 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 YEATS2Q9ULM3 1422 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 KCNA6P17658 529 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 HSPA1LP34931 641 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 KRT28Q7Z3Y7 464 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 DUOX2Q9NRD8 1548 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 CFAP74Q9C0B2 1584 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 NLRP13Q86W25 1043 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 ATP7AQ04656 1500 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 CNTLNQ9NXG0 1405 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 DIP2BQ9P265 1576 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 PHF8Q9UPP1 1060 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 ADGBQ8N7X0 1667 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 A2MP01023 1474 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 NBPF8Q3BBV2 869 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 NBPF14Q5TI25 921 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 L3MBTL2Q969R5 705 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 ERBINQ96RT1 1412 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 NUDCQ9Y266 331 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 GCC2Q8IWJ2 1684 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 GLI2P10070 1586 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 MORC1Q86VD1 984 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 COG3Q96JB2 828 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 USP21Q9UK80 565 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 NEUROD2Q15784 382 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 CROCC2H7BZ55 1655 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 EVC2Q86UK5 1308 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 CABLES1Q8TDN4 633 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 CABP2Q9NPB3 220 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 NPHP3Q7Z494 1330 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-201ENST00000348564 CHRNA2Q15822 529 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 MLH3Q9UHC1 1453 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 ZRANB1Q9UGI0 708 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 MAST1Q9Y2H9 1570 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 BAG6P46379 1132 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 PZPP20742 1482 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 CANXP27824 592 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 G3V3G9 751 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 DCAF8Q5TAQ9 597 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 ANP32CO43423 234 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 LTKP29376 864 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 PLXNC1O60486 1568 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 HECW2Q9P2P5 1572 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 TBX22Q9Y458 520 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 KAT6BQ8WYB5 2073 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM94Q12767 1356 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf141Q5JVX7 400 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 CDK19Q9BWU1 502 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 EXOC5O00471 708 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 ORAI2Q96SN7 254 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-201ENST00000348564 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 WWC3Q9ULE0 1092 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 CABP1Q9NZU7 370 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-201ENST00000348564 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
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