RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323482.8

ACSS1-201, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACSS1, Length 3,680 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1-201ENST00000323482 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.76■□□□□ 0.91
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ACSS1-201ENST00000323482 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.75■□□□□ 0.91
ACSS1-201ENST00000323482 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
ACSS1-201ENST00000323482 PPP2R1AP30153 589 aa20.74■□□□□ 0.91
ACSS1-201ENST00000323482 PLCB2Q00722 1185 aa20.74■□□□□ 0.91
ACSS1-201ENST00000323482 ESPNB1AK53 854 aa20.74■□□□□ 0.91
ACSS1-201ENST00000323482 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.91
ACSS1-201ENST00000323482 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.73■□□□□ 0.91
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ACSS1-201ENST00000323482 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.71■□□□□ 0.91
ACSS1-201ENST00000323482 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.71■□□□□ 0.91
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ACSS1-201ENST00000323482 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.7■□□□□ 0.9
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ACSS1-201ENST00000323482 KDM5CP41229 1560 aa20.66■□□□□ 0.9
ACSS1-201ENST00000323482 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.66■□□□□ 0.9
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ACSS1-201ENST00000323482 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
ACSS1-201ENST00000323482 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
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ACSS1-201ENST00000323482 MORC1Q86VD1 984 aa20.64■□□□□ 0.89
ACSS1-201ENST00000323482 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.64■□□□□ 0.89
ACSS1-201ENST00000323482 ERCC6Q03468 1493 aa20.63■□□□□ 0.89
ACSS1-201ENST00000323482 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.63■□□□□ 0.89
ACSS1-201ENST00000323482 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.63■□□□□ 0.89
ACSS1-201ENST00000323482 E9PSI1 815 aa20.63■□□□□ 0.89
ACSS1-201ENST00000323482 RNF214Q8ND24 703 aa20.62■□□□□ 0.89
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ACSS1-201ENST00000323482 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.58■□□□□ 0.88
ACSS1-201ENST00000323482 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.57■□□□□ 0.88
ACSS1-201ENST00000323482 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.57■□□□□ 0.88
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ACSS1-201ENST00000323482 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.56■□□□□ 0.88
ACSS1-201ENST00000323482 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ACSS1-201ENST00000323482 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.56■□□□□ 0.88
ACSS1-201ENST00000323482 MCTP1Q6DN14 999 aa20.56■□□□□ 0.88
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ACSS1-201ENST00000323482 ADGRL2O95490 1459 aa20.53■□□□□ 0.88
ACSS1-201ENST00000323482 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
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ACSS1-201ENST00000323482 CDCA8Q53HL2 280 aa20.49■□□□□ 0.87
ACSS1-201ENST00000323482 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.49■□□□□ 0.87
ACSS1-201ENST00000323482 SSFA2P28290 1259 aa20.48■□□□□ 0.87
ACSS1-201ENST00000323482 WWC1Q8IX03 1113 aa20.48■□□□□ 0.87
ACSS1-201ENST00000323482 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ACSS1-201ENST00000323482 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ACSS1-201ENST00000323482 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.46■□□□□ 0.87
ACSS1-201ENST00000323482 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ACSS1-201ENST00000323482 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.46■□□□□ 0.87
ACSS1-201ENST00000323482 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.45■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.45■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 FAM177BA6PVY3 158 aa20.45■□□□□ 0.86
ACSS1-201ENST00000323482 CEP170Q5SW79 1584 aa20.45■□□□□ 0.86
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