RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 IQGAP3Q86VI3 1631 aa33■■■□□ 2.87
SENP3-201ENST00000321337 SLFN5Q08AF3 891 aa32.99■■■□□ 2.87
SENP3-201ENST00000321337 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.99■■■□□ 2.87
SENP3-201ENST00000321337 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
SENP3-201ENST00000321337 BCAR3O75815 825 aa32.97■■■□□ 2.87
SENP3-201ENST00000321337 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.87
SENP3-201ENST00000321337 DMRT2Q9Y5R5 561 aa32.93■■■□□ 2.86
SENP3-201ENST00000321337 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.93■■■□□ 2.86
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SENP3-201ENST00000321337 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP32.92■■■□□ 2.86
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SENP3-201ENST00000321337 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa32.84■■■□□ 2.85
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SENP3-201ENST00000321337 SYNMO15061 1565 aa32.79■■■□□ 2.84
SENP3-201ENST00000321337 USP19O94966 1318 aa32.79■■■□□ 2.84
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SENP3-201ENST00000321337 CARD14Q9BXL6 1004 aa32.71■■■□□ 2.83
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SENP3-201ENST00000321337 E9PSI1 815 aa32.7■■■□□ 2.83
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SENP3-201ENST00000321337 AFAP1Q8N556 730 aa32.62■■■□□ 2.81
SENP3-201ENST00000321337 NEUROD2Q15784 382 aa32.61■■■□□ 2.81
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SENP3-201ENST00000321337 PTPRTO14522 1441 aa32.55■■■□□ 2.8
SENP3-201ENST00000321337 CEP152O94986 1710 aa32.55■■■□□ 2.8
SENP3-201ENST00000321337 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa32.53■■■□□ 2.8
SENP3-201ENST00000321337 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
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SENP3-201ENST00000321337 BCL2L13Q9BXK5 485 aa32.52■■■□□ 2.8
SENP3-201ENST00000321337 NLRP1Q9C000 1473 aa32.52■■■□□ 2.8
SENP3-201ENST00000321337 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa32.52■■■□□ 2.8
SENP3-201ENST00000321337 ABCC1P33527 1531 aa32.51■■■□□ 2.8
SENP3-201ENST00000321337 UGGT1Q9NYU2 1555 aa32.49■■■□□ 2.79
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SENP3-201ENST00000321337 NINLQ9Y2I6 1382 aa32.38■■■□□ 2.77
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SENP3-201ENST00000321337 RUNDC1Q96C34 613 aa32.36■■■□□ 2.77
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SENP3-201ENST00000321337 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
SENP3-201ENST00000321337 TBC1D32Q96NH3 1257 aa32.35■■■□□ 2.77
SENP3-201ENST00000321337 SHROOM2Q13796 1616 aa32.35■■■□□ 2.77
SENP3-201ENST00000321337 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.34■■■□□ 2.77
SENP3-201ENST00000321337 TET3O43151 1660 aa32.34■■■□□ 2.77
SENP3-201ENST00000321337 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa32.34■■■□□ 2.77
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