RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303230.5

HCN1-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN1, Length 9,885 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN1-201ENST00000303230 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.52■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HCN1-201ENST00000303230 MIA2Q96PC5 1412 aa20.52■□□□□ 0.87
HCN1-201ENST00000303230 PDCP20941 246 aa20.51■□□□□ 0.87
HCN1-201ENST00000303230 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HCN1-201ENST00000303230 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HCN1-201ENST00000303230 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HCN1-201ENST00000303230 CAGE1Q8TC20 777 aa20.5■□□□□ 0.87
HCN1-201ENST00000303230 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.49■□□□□ 0.87
HCN1-201ENST00000303230 WWC1Q8IX03 1113 aa20.49■□□□□ 0.87
HCN1-201ENST00000303230 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.49■□□□□ 0.87
HCN1-201ENST00000303230 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HCN1-201ENST00000303230 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.48■□□□□ 0.87
HCN1-201ENST00000303230 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
HCN1-201ENST00000303230 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.48■□□□□ 0.87
HCN1-201ENST00000303230 TRIM29Q14134 588 aa20.47■□□□□ 0.87
HCN1-201ENST00000303230 TXLNBQ8N3L3 684 aa20.47■□□□□ 0.87
HCN1-201ENST00000303230 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.46■□□□□ 0.87
HCN1-201ENST00000303230 INCENPQ9NQS7 918 aa20.46■□□□□ 0.87
HCN1-201ENST00000303230 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.44■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.44■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 IQCEQ6IPM2 695 aa20.44■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.44■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 BICD2Q8TD16 824 aa20.44■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.43■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.43■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.43■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.42■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.42■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 MCTP1Q6DN14 999 aa20.41■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 KIAA0754O94854 1291 aa20.41■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 OLFM4Q6UX06 510 aa20.41■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.4■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 RABEP1Q15276 862 aa20.4■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 CRBNQ96SW2 442 aa20.4■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 TSPY26PQ9H489 355 aa20.4■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 ERLIN1O75477 346 aa20.39■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 DEF6Q9H4E7 631 aa20.39■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 STAC3Q96MF2 364 aa20.39■□□□□ 0.86
HCN1-201ENST00000303230 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 GOLGA6L10A6NI86 522 aa20.39■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.39■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 CPLX1O14810 134 aa20.39■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 ERC2O15083 957 aa20.39■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.38■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.37■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 TRAK2O60296 914 aa20.37■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 CDC45O75419 566 aa20.37■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 PSMA5P28066 241 aa20.37■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.36■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 SMARCE1Q969G3 411 aa20.36■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 KINO60870 393 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.35■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.35■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 RILPL2Q969X0 211 aa20.34■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 FAM107BQ9H098 131 aa20.34■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.34■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.33■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 EVC2Q86UK5 1308 aa20.33■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.33■□□□□ 0.85
HCN1-201ENST00000303230 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.33■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.33■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 CCDC192P0DO97 292 aa20.33■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 MARCH6O60337 910 aa20.32■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 ERLIN2O94905 339 aa20.32■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.32■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 TRIM5Q9C035 493 aa20.32■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 CCDC7Q96M83 1385 aa20.32■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.31■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.31■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 TRDNQ13061 729 aa20.31■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.3■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.3■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.3■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 CCDC112Q8NEF3 446 aa20.3■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.3■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 HIP1O00291 1037 aa20.3■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.29■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HCN1-201ENST00000303230 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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