RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296425.9

PGRMC2-201, Transcript of progesterone receptor membrane component 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGRMC2, Length 2,767 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC2-201ENST00000296425 PIK3C2BO00750 1634 aa29.43■■■□□ 2.3
PGRMC2-201ENST00000296425 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
PGRMC2-201ENST00000296425 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
PGRMC2-201ENST00000296425 SYNMO15061 1565 aa29.41■■■□□ 2.3
PGRMC2-201ENST00000296425 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.41■■■□□ 2.3
PGRMC2-201ENST00000296425 IQGAP1P46940 1657 aa29.41■■■□□ 2.3
PGRMC2-201ENST00000296425 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.4■■■□□ 2.3
PGRMC2-201ENST00000296425 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.4■■■□□ 2.3
PGRMC2-201ENST00000296425 TMF1P82094 1093 aa29.38■■■□□ 2.29
PGRMC2-201ENST00000296425 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
PGRMC2-201ENST00000296425 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.34■■■□□ 2.29
PGRMC2-201ENST00000296425 PPLO60437 1756 aa29.34■■■□□ 2.29
PGRMC2-201ENST00000296425 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.33■■■□□ 2.29
PGRMC2-201ENST00000296425 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.33■■■□□ 2.29
PGRMC2-201ENST00000296425 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.32■■■□□ 2.28
PGRMC2-201ENST00000296425 IDI1Q13907 227 aa29.32■■■□□ 2.28
PGRMC2-201ENST00000296425 PIK3C2GO75747 1445 aa29.31■■■□□ 2.28
PGRMC2-201ENST00000296425 SLC24A1O60721 1099 aa29.3■■■□□ 2.28
PGRMC2-201ENST00000296425 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.28■■■□□ 2.28
PGRMC2-201ENST00000296425 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
PGRMC2-201ENST00000296425 CDCA8Q53HL2 280 aa29.27■■■□□ 2.28
PGRMC2-201ENST00000296425 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
PGRMC2-201ENST00000296425 ERVK-7P63135 1459 aa29.26■■■□□ 2.28
PGRMC2-201ENST00000296425 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
PGRMC2-201ENST00000296425 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.24■■■□□ 2.27
PGRMC2-201ENST00000296425 MRS2Q9HD23 443 aa29.23■■■□□ 2.27
PGRMC2-201ENST00000296425 ZFYVE9O95405 1425 aa29.22■■■□□ 2.27
PGRMC2-201ENST00000296425 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
PGRMC2-201ENST00000296425 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
PGRMC2-201ENST00000296425 CCDC184Q52MB2 194 aa29.2■■■□□ 2.27
PGRMC2-201ENST00000296425 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.19■■■□□ 2.26
PGRMC2-201ENST00000296425 MLECQ14165 292 aa29.18■■■□□ 2.26
PGRMC2-201ENST00000296425 RALBP1Q15311 655 aa29.18■■■□□ 2.26
PGRMC2-201ENST00000296425 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
PGRMC2-201ENST00000296425 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.16■■■□□ 2.26
PGRMC2-201ENST00000296425 ADGRB1O14514 1584 aa29.16■■■□□ 2.26
PGRMC2-201ENST00000296425 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
PGRMC2-201ENST00000296425 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa29.15■■■□□ 2.26
PGRMC2-201ENST00000296425 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.14■■■□□ 2.26
PGRMC2-201ENST00000296425 PANK3Q9H999 370 aa29.13■■■□□ 2.25
PGRMC2-201ENST00000296425 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
PGRMC2-201ENST00000296425 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
PGRMC2-201ENST00000296425 ZMYM3Q14202 1370 aa29.09■■■□□ 2.25
PGRMC2-201ENST00000296425 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
PGRMC2-201ENST00000296425 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29.08■■■□□ 2.25
PGRMC2-201ENST00000296425 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
PGRMC2-201ENST00000296425 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.08■■■□□ 2.25
PGRMC2-201ENST00000296425 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.07■■■□□ 2.24
PGRMC2-201ENST00000296425 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.07■■■□□ 2.24
PGRMC2-201ENST00000296425 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.07■■■□□ 2.24
PGRMC2-201ENST00000296425 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.06■■■□□ 2.24
PGRMC2-201ENST00000296425 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.06■■■□□ 2.24
PGRMC2-201ENST00000296425 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
PGRMC2-201ENST00000296425 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
PGRMC2-201ENST00000296425 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
PGRMC2-201ENST00000296425 TMC1Q8TDI8 760 aa29.02■■■□□ 2.24
PGRMC2-201ENST00000296425 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.01■■■□□ 2.23
PGRMC2-201ENST00000296425 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.98■■■□□ 2.23
PGRMC2-201ENST00000296425 NLRP13Q86W25 1043 aa28.98■■■□□ 2.23
PGRMC2-201ENST00000296425 MYOM1P52179 1685 aa28.97■■■□□ 2.23
PGRMC2-201ENST00000296425 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
PGRMC2-201ENST00000296425 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.95■■■□□ 2.23
PGRMC2-201ENST00000296425 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
PGRMC2-201ENST00000296425 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.92■■■□□ 2.22
PGRMC2-201ENST00000296425 TNRQ92752 1358 aa28.92■■■□□ 2.22
PGRMC2-201ENST00000296425 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PGRMC2-201ENST00000296425 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.91■■■□□ 2.22
PGRMC2-201ENST00000296425 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
PGRMC2-201ENST00000296425 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.91■■■□□ 2.22
PGRMC2-201ENST00000296425 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.9■■■□□ 2.22
PGRMC2-201ENST00000296425 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
PGRMC2-201ENST00000296425 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.9■■■□□ 2.22
PGRMC2-201ENST00000296425 ALKQ9UM73 1620 aa28.89■■■□□ 2.22
PGRMC2-201ENST00000296425 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
PGRMC2-201ENST00000296425 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
PGRMC2-201ENST00000296425 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
PGRMC2-201ENST00000296425 EVC2Q86UK5 1308 aa28.86■■■□□ 2.21
PGRMC2-201ENST00000296425 STK26Q9P289 416 aa28.82■■■□□ 2.2
PGRMC2-201ENST00000296425 PTPRMP28827 1452 aa28.81■■■□□ 2.2
PGRMC2-201ENST00000296425 NLRP1Q9C000 1473 aa28.79■■■□□ 2.2
PGRMC2-201ENST00000296425 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.78■■■□□ 2.2
PGRMC2-201ENST00000296425 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
PGRMC2-201ENST00000296425 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.77■■■□□ 2.2
PGRMC2-201ENST00000296425 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.76■■■□□ 2.19
PGRMC2-201ENST00000296425 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.75■■■□□ 2.19
PGRMC2-201ENST00000296425 POGKQ9P215 609 aa28.75■■■□□ 2.19
PGRMC2-201ENST00000296425 PRAM1Q96QH2 718 aa28.75■■■□□ 2.19
PGRMC2-201ENST00000296425 DLC1Q96QB1 1528 aa28.74■■■□□ 2.19
PGRMC2-201ENST00000296425 INSRP06213 1382 aa28.74■■■□□ 2.19
PGRMC2-201ENST00000296425 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.74■■■□□ 2.19
PGRMC2-201ENST00000296425 PPP2R1AP30153 589 aa28.73■■■□□ 2.19
PGRMC2-201ENST00000296425 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.73■■■□□ 2.19
PGRMC2-201ENST00000296425 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
PGRMC2-201ENST00000296425 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.72■■■□□ 2.19
PGRMC2-201ENST00000296425 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.72■■■□□ 2.19
PGRMC2-201ENST00000296425 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
PGRMC2-201ENST00000296425 ABCC11Q96J66 1382 aa28.71■■■□□ 2.19
PGRMC2-201ENST00000296425 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.7■■■□□ 2.19
PGRMC2-201ENST00000296425 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.7■■■□□ 2.18
PGRMC2-201ENST00000296425 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms