RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 ATP10AO60312 1499 aa28.92■■■□□ 2.22
PITX1-201ENST00000265340 USP47Q96K76 1375 aa28.92■■■□□ 2.22
PITX1-201ENST00000265340 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.91■■■□□ 2.22
PITX1-201ENST00000265340 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.89■■■□□ 2.22
PITX1-201ENST00000265340 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
PITX1-201ENST00000265340 RGL3Q3MIN7 710 aa28.89■■■□□ 2.21
PITX1-201ENST00000265340 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
PITX1-201ENST00000265340 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.88■■■□□ 2.21
PITX1-201ENST00000265340 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.88■■■□□ 2.21
PITX1-201ENST00000265340 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.87■■■□□ 2.21
PITX1-201ENST00000265340 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
PITX1-201ENST00000265340 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.86■■■□□ 2.21
PITX1-201ENST00000265340 DEPDC5O75140 1603 aa28.86■■■□□ 2.21
PITX1-201ENST00000265340 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
PITX1-201ENST00000265340 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.85■■■□□ 2.21
PITX1-201ENST00000265340 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.84■■■□□ 2.21
PITX1-201ENST00000265340 E9PCH4 1651 aa28.84■■■□□ 2.21
PITX1-201ENST00000265340 MLECQ14165 292 aa28.84■■■□□ 2.21
PITX1-201ENST00000265340 PDE4AP27815 886 aa28.83■■■□□ 2.21
PITX1-201ENST00000265340 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.83■■■□□ 2.21
PITX1-201ENST00000265340 BACH2Q9BYV9 841 aa28.82■■■□□ 2.2
PITX1-201ENST00000265340 KANK1Q14678 1352 aa28.8■■■□□ 2.2
PITX1-201ENST00000265340 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.8■■■□□ 2.2
PITX1-201ENST00000265340 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
PITX1-201ENST00000265340 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
PITX1-201ENST00000265340 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
PITX1-201ENST00000265340 MS4A1P11836 297 aa28.79■■■□□ 2.2
PITX1-201ENST00000265340 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
PITX1-201ENST00000265340 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
PITX1-201ENST00000265340 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.76■■■□□ 2.2
PITX1-201ENST00000265340 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.75■■■□□ 2.19
PITX1-201ENST00000265340 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
PITX1-201ENST00000265340 REREQ9P2R6 1566 aa28.73■■■□□ 2.19
PITX1-201ENST00000265340 CEP152O94986 1710 aa28.73■■■□□ 2.19
PITX1-201ENST00000265340 TET3O43151 1660 aa28.73■■■□□ 2.19
PITX1-201ENST00000265340 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.72■■■□□ 2.19
PITX1-201ENST00000265340 CCDC184Q52MB2 194 aa28.72■■■□□ 2.19
PITX1-201ENST00000265340 RBM10P98175 930 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
PITX1-201ENST00000265340 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.71■■■□□ 2.19
PITX1-201ENST00000265340 AAMPQ13685 434 aa28.71■■■□□ 2.19
PITX1-201ENST00000265340 PTPRTO14522 1441 aa28.7■■■□□ 2.19
PITX1-201ENST00000265340 TRPM2O94759 1503 aa28.7■■■□□ 2.18
PITX1-201ENST00000265340 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.7■■■□□ 2.18
PITX1-201ENST00000265340 AGLP35573 1532 aa28.69■■■□□ 2.18
PITX1-201ENST00000265340 NUDCQ9Y266 331 aa28.69■■■□□ 2.18
PITX1-201ENST00000265340 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.69■■■□□ 2.18
PITX1-201ENST00000265340 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.69■■■□□ 2.18
PITX1-201ENST00000265340 FGD1P98174 961 aa28.68■■■□□ 2.18
PITX1-201ENST00000265340 ABCC3O15438 1527 aa28.66■■■□□ 2.18
PITX1-201ENST00000265340 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
PITX1-201ENST00000265340 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
PITX1-201ENST00000265340 CLTCL1P53675 1640 aa28.66■■■□□ 2.18
PITX1-201ENST00000265340 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
PITX1-201ENST00000265340 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.62■■■□□ 2.17
PITX1-201ENST00000265340 MRS2Q9HD23 443 aa28.61■■■□□ 2.17
PITX1-201ENST00000265340 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.61■■■□□ 2.17
PITX1-201ENST00000265340 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
PITX1-201ENST00000265340 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
PITX1-201ENST00000265340 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.59■■■□□ 2.17
PITX1-201ENST00000265340 NPATQ14207 1427 aa28.58■■■□□ 2.17
PITX1-201ENST00000265340 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.57■■■□□ 2.16
PITX1-201ENST00000265340 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
PITX1-201ENST00000265340 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.56■■■□□ 2.16
PITX1-201ENST00000265340 CLCN1P35523 988 aa28.56■■■□□ 2.16
PITX1-201ENST00000265340 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
PITX1-201ENST00000265340 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
PITX1-201ENST00000265340 LAMC1P11047 1609 aa28.54■■■□□ 2.16
PITX1-201ENST00000265340 MADDQ8WXG6 1647 aa28.53■■■□□ 2.16
PITX1-201ENST00000265340 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
PITX1-201ENST00000265340 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
PITX1-201ENST00000265340 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
PITX1-201ENST00000265340 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
PITX1-201ENST00000265340 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
PITX1-201ENST00000265340 PDE4CQ08493 712 aa28.5■■■□□ 2.15
PITX1-201ENST00000265340 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
PITX1-201ENST00000265340 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.49■■■□□ 2.15
PITX1-201ENST00000265340 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.49■■■□□ 2.15
PITX1-201ENST00000265340 TESK2Q96S53 571 aa28.47■■■□□ 2.15
PITX1-201ENST00000265340 PRDM4Q9UKN5 801 aa28.46■■■□□ 2.15
PITX1-201ENST00000265340 ZMYM3Q14202 1370 aa28.43■■■□□ 2.14
PITX1-201ENST00000265340 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.43■■■□□ 2.14
PITX1-201ENST00000265340 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.42■■■□□ 2.14
PITX1-201ENST00000265340 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
PITX1-201ENST00000265340 PDCL3Q9H2J4 239 aa28.41■■■□□ 2.14
PITX1-201ENST00000265340 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.4■■■□□ 2.14
PITX1-201ENST00000265340 SLC4A3P48751 1232 aa28.4■■■□□ 2.14
PITX1-201ENST00000265340 MROH2AA6NES4 1674 aa28.4■■■□□ 2.14
PITX1-201ENST00000265340 KIF1BO60333 1816 aa28.39■■■□□ 2.14
PITX1-201ENST00000265340 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
PITX1-201ENST00000265340 NOS1P29475 1434 aa28.38■■■□□ 2.13
PITX1-201ENST00000265340 STAC3Q96MF2 364 aa28.37■■■□□ 2.13
PITX1-201ENST00000265340 SYNMO15061 1565 aa28.36■■■□□ 2.13
PITX1-201ENST00000265340 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.36■■■□□ 2.13
PITX1-201ENST00000265340 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.36■■■□□ 2.13
PITX1-201ENST00000265340 IQGAP1P46940 1657 aa28.36■■■□□ 2.13
PITX1-201ENST00000265340 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.34■■■□□ 2.13
PITX1-201ENST00000265340 ERVK-7P63135 1459 aa28.34■■■□□ 2.13
PITX1-201ENST00000265340 IDI1Q13907 227 aa28.33■■■□□ 2.13
PITX1-201ENST00000265340 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.33■■■□□ 2.13
PITX1-201ENST00000265340 IFT172Q9UG01 1749 aa28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms