RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261917.3

HCN4-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN4, Length 7,228 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4-201ENST00000261917 ATF3P18847 181 aa22.25■■□□□ 1.15
HCN4-201ENST00000261917 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.25■■□□□ 1.15
HCN4-201ENST00000261917 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.25■■□□□ 1.15
HCN4-201ENST00000261917 HMOX1P09601 288 aa22.24■■□□□ 1.15
HCN4-201ENST00000261917 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HCN4-201ENST00000261917 EVC2Q86UK5 1308 aa22.23■■□□□ 1.15
HCN4-201ENST00000261917 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.23■■□□□ 1.15
HCN4-201ENST00000261917 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HCN4-201ENST00000261917 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HCN4-201ENST00000261917 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.21■■□□□ 1.15
HCN4-201ENST00000261917 TRIM29Q14134 588 aa22.21■■□□□ 1.15
HCN4-201ENST00000261917 TPM2P07951 284 aa22.21■■□□□ 1.15
HCN4-201ENST00000261917 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.21■■□□□ 1.15
HCN4-201ENST00000261917 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.2■■□□□ 1.15
HCN4-201ENST00000261917 WIZO95785 1651 aa22.2■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.2■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 COG6Q9Y2V7 657 aa22.19■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 KIF3AQ9Y496 699 aa22.18■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.18■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 NLRP13Q86W25 1043 aa22.17■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.17■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 ZNF592Q92610 1267 aa22.17■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 PHF14O94880 888 aa22.16■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 RIPK4P57078 832 aa22.16■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 CRBNQ96SW2 442 aa22.16■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.15■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.15■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.15■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 STRN4Q9NRL3 753 aa22.15■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 KIF15Q9NS87 1388 aa22.14■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
HCN4-201ENST00000261917 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.14■■□□□ 1.13
HCN4-201ENST00000261917 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.14■■□□□ 1.13
HCN4-201ENST00000261917 BECN2A8MW95 431 aa22.13■■□□□ 1.13
HCN4-201ENST00000261917 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.13■■□□□ 1.13
HCN4-201ENST00000261917 ERICH2A1L162 156 aa22.13■■□□□ 1.13
HCN4-201ENST00000261917 CPLX1O14810 134 aa22.13■■□□□ 1.13
HCN4-201ENST00000261917 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.12■■□□□ 1.13
HCN4-201ENST00000261917 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
HCN4-201ENST00000261917 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HCN4-201ENST00000261917 APAF1O14727 1248 aa22.11■■□□□ 1.13
HCN4-201ENST00000261917 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.11■■□□□ 1.13
HCN4-201ENST00000261917 TRDNQ13061 729 aa22.1■■□□□ 1.13
HCN4-201ENST00000261917 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.1■■□□□ 1.13
HCN4-201ENST00000261917 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HCN4-201ENST00000261917 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HCN4-201ENST00000261917 WASHC4Q2M389 1173 aa22.1■■□□□ 1.13
HCN4-201ENST00000261917 PIP4K2BP78356 416 aa22.09■■□□□ 1.13
HCN4-201ENST00000261917 OSCARQ8IYS5 282 aa22.09■■□□□ 1.13
HCN4-201ENST00000261917 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HCN4-201ENST00000261917 CABP2Q9NPB3 220 aa22.09■■□□□ 1.13
HCN4-201ENST00000261917 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.08■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 TPM1P09493 284 aa22.07■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 UACAQ9BZF9 1416 aa22.06■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.05■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.05■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 BICD2Q8TD16 824 aa22.04■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.04■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.04■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.04■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 FAM161AQ3B820 660 aa22.03■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.03■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 PTPRGP23470 1445 aa22.02■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.02■■□□□ 1.12
HCN4-201ENST00000261917 E9PSI1 815 aa22.01■■□□□ 1.11
HCN4-201ENST00000261917 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.01■■□□□ 1.11
HCN4-201ENST00000261917 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
HCN4-201ENST00000261917 ATP2B2Q01814 1243 aa22■■□□□ 1.11
HCN4-201ENST00000261917 ABTB2Q8N961 1025 aa22■■□□□ 1.11
HCN4-201ENST00000261917 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
HCN4-201ENST00000261917 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HCN4-201ENST00000261917 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HCN4-201ENST00000261917 NLRP6P59044 892 aa21.97■■□□□ 1.11
HCN4-201ENST00000261917 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HCN4-201ENST00000261917 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HCN4-201ENST00000261917 USP47Q96K76 1375 aa21.97■■□□□ 1.11
HCN4-201ENST00000261917 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HCN4-201ENST00000261917 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.96■■□□□ 1.11
HCN4-201ENST00000261917 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.96■■□□□ 1.11
HCN4-201ENST00000261917 ODF2Q5BJF6 829 aa21.96■■□□□ 1.11
HCN4-201ENST00000261917 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.95■■□□□ 1.11
HCN4-201ENST00000261917 EPS15P42566 896 aa21.95■■□□□ 1.1
HCN4-201ENST00000261917 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.95■■□□□ 1.1
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