RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257468.11

UBQLN1-201, Transcript of ubiquilin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN1, Length 2,299 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN1-201ENST00000257468 STAC3Q96MF2 364 aa22.15■■□□□ 1.14
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UBQLN1-201ENST00000257468 SYNMO15061 1565 aa22.14■■□□□ 1.13
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UBQLN1-201ENST00000257468 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.13■■□□□ 1.13
UBQLN1-201ENST00000257468 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.13■■□□□ 1.13
UBQLN1-201ENST00000257468 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.13■■□□□ 1.13
UBQLN1-201ENST00000257468 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.12■■□□□ 1.13
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UBQLN1-201ENST00000257468 FANCIQ9NVI1 1328 aa22■■□□□ 1.11
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UBQLN1-201ENST00000257468 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.96■■□□□ 1.11
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UBQLN1-201ENST00000257468 DIP2BQ9P265 1576 aa21.91■■□□□ 1.1
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UBQLN1-201ENST00000257468 ZNF521Q96K83 1311 aa21.86■■□□□ 1.09
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UBQLN1-201ENST00000257468 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.85■■□□□ 1.09
UBQLN1-201ENST00000257468 PIK3C2BO00750 1634 aa21.85■■□□□ 1.09
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UBQLN1-201ENST00000257468 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.83■■□□□ 1.08
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UBQLN1-201ENST00000257468 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
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UBQLN1-201ENST00000257468 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
UBQLN1-201ENST00000257468 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
UBQLN1-201ENST00000257468 SLFN5Q08AF3 891 aa21.76■■□□□ 1.07
UBQLN1-201ENST00000257468 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
UBQLN1-201ENST00000257468 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.76■■□□□ 1.07
UBQLN1-201ENST00000257468 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.76■■□□□ 1.07
UBQLN1-201ENST00000257468 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
UBQLN1-201ENST00000257468 MORC1Q86VD1 984 aa21.75■■□□□ 1.07
UBQLN1-201ENST00000257468 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.75■■□□□ 1.07
UBQLN1-201ENST00000257468 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.75■■□□□ 1.07
UBQLN1-201ENST00000257468 SKAP1Q86WV1 359 aa21.75■■□□□ 1.07
UBQLN1-201ENST00000257468 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.75■■□□□ 1.07
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