RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252936.7

TUBGCP2-201, Transcript of tubulin gamma complex associated protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TUBGCP2, Length 3,885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2-201ENST00000252936 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.78□□□□□ -0.04
TUBGCP2-201ENST00000252936 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TUBGCP2-201ENST00000252936 IFT140Q96RY7 1462 aa14.77□□□□□ -0.04
TUBGCP2-201ENST00000252936 GRIN2BQ13224 1484 aa14.77□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.77□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 MIA2Q96PC5 1412 aa14.77□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 TBC1D2Q9BYX2 928 aa14.76□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 MPNDQ8N594 471 aa14.76□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 OFD1O75665 1012 aa14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 PBRM1Q86U86 1689 aa14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 GOLGA2Q08379 1002 aa14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 APAF1O14727 1248 aa14.73□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.73□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 SEC24BO95487 1268 aa14.73□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.73□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.73□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.72□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 KDM6BO15054 1643 aa14.72□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.72□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.72□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.72□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.71□□□□□ -0.05
TUBGCP2-201ENST00000252936 STAC3Q96MF2 364 aa14.7□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 COG6Q9Y2V7 657 aa14.7□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 FSD2A1L4K1 749 aa14.7□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 RIPK4P57078 832 aa14.69□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 DYNC1I1O14576 645 aa14.68□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.68□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 ADAMTS12P58397 1594 aa14.68□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 RNF214Q8ND24 703 aa14.68□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.67□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 ROCK1Q13464 1354 aa14.67□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 BCAR3O75815 825 aa14.67□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 PTMSP20962 102 aa14.66□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.66□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 HECW1Q76N89 1606 aa14.66□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 FAM177BA6PVY3 158 aa14.66□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 KCNJ4P48050 445 aa14.66□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.66□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 CDCA8Q53HL2 280 aa14.66□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.66□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 TSC1Q92574 1164 aa14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 DMTNQ08495 405 aa14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP2-201ENST00000252936 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 GAS2L3Q86XJ1 694 aa14.63□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 PANK1Q8TE04 598 aa14.63□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 MCTP1Q6DN14 999 aa14.62□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 PPP2R1AP30153 589 aa14.62□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 IQGAP2Q13576 1575 aa14.62□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.62□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.62□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 APPP05067 770 aa14.61□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 MORC1Q86VD1 984 aa14.61□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 KIF20AO95235 890 aa14.61□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.61□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.61□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 ZBTB22O15209 634 aa14.61□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 SAMD9Q5K651 1589 aa14.6□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 CERS3Q8IU89 383 aa14.6□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.6□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 ERICH4A6NGS2 130 aa14.6□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 CCDC39Q9UFE4 941 aa14.6□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.59□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 TAF3Q5VWG9 929 aa14.59□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa14.59□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 IGHDP01880 384 aa14.58□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 TRAK1Q9UPV9 953 aa14.58□□□□□ -0.07
TUBGCP2-201ENST00000252936 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TUBGCP2-201ENST00000252936 KIF3BO15066 747 aa14.58□□□□□ -0.08
TUBGCP2-201ENST00000252936 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TUBGCP2-201ENST00000252936 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.3 ms