RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 MLECQ14165 292 aa27.28■■□□□ 1.96
VGF-201ENST00000249330 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
VGF-201ENST00000249330 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.27■■□□□ 1.96
VGF-201ENST00000249330 MADDQ8WXG6 1647 aa27.27■■□□□ 1.96
VGF-201ENST00000249330 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.27■■□□□ 1.96
VGF-201ENST00000249330 KIF1BO60333 1816 aa27.27■■□□□ 1.96
VGF-201ENST00000249330 MROH2AA6NES4 1674 aa27.25■■□□□ 1.95
VGF-201ENST00000249330 NOS1P29475 1434 aa27.24■■□□□ 1.95
VGF-201ENST00000249330 STAC3Q96MF2 364 aa27.24■■□□□ 1.95
VGF-201ENST00000249330 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
VGF-201ENST00000249330 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.21■■□□□ 1.95
VGF-201ENST00000249330 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.21■■□□□ 1.95
VGF-201ENST00000249330 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.2■■□□□ 1.95
VGF-201ENST00000249330 IDI1Q13907 227 aa27.2■■□□□ 1.94
VGF-201ENST00000249330 SYNMO15061 1565 aa27.19■■□□□ 1.94
VGF-201ENST00000249330 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
VGF-201ENST00000249330 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
VGF-201ENST00000249330 ADGRB3O60242 1522 aa27.19■■□□□ 1.94
VGF-201ENST00000249330 TESK2Q96S53 571 aa27.18■■□□□ 1.94
VGF-201ENST00000249330 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
VGF-201ENST00000249330 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
VGF-201ENST00000249330 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
VGF-201ENST00000249330 REREQ9P2R6 1566 aa27.16■■□□□ 1.94
VGF-201ENST00000249330 LAMC1P11047 1609 aa27.16■■□□□ 1.94
VGF-201ENST00000249330 AGLP35573 1532 aa27.16■■□□□ 1.94
VGF-201ENST00000249330 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
VGF-201ENST00000249330 MYOM2P54296 1465 aa27.14■■□□□ 1.93
VGF-201ENST00000249330 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.13■■□□□ 1.93
VGF-201ENST00000249330 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.12■■□□□ 1.93
VGF-201ENST00000249330 IFT172Q9UG01 1749 aa27.12■■□□□ 1.93
VGF-201ENST00000249330 PIK3C2BO00750 1634 aa27.1■■□□□ 1.93
VGF-201ENST00000249330 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.1■■□□□ 1.93
VGF-201ENST00000249330 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
VGF-201ENST00000249330 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.08■■□□□ 1.93
VGF-201ENST00000249330 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.08■■□□□ 1.93
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VGF-201ENST00000249330 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
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VGF-201ENST00000249330 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.06■■□□□ 1.92
VGF-201ENST00000249330 NUDCQ9Y266 331 aa27.06■■□□□ 1.92
VGF-201ENST00000249330 TMF1P82094 1093 aa27.05■■□□□ 1.92
VGF-201ENST00000249330 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.05■■□□□ 1.92
VGF-201ENST00000249330 IQGAP1P46940 1657 aa27.04■■□□□ 1.92
VGF-201ENST00000249330 PPLO60437 1756 aa27.04■■□□□ 1.92
VGF-201ENST00000249330 ERVK-7P63135 1459 aa27.02■■□□□ 1.92
VGF-201ENST00000249330 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.02■■□□□ 1.92
VGF-201ENST00000249330 PIK3C2GO75747 1445 aa27.02■■□□□ 1.92
VGF-201ENST00000249330 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.01■■□□□ 1.91
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VGF-201ENST00000249330 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
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VGF-201ENST00000249330 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.97■■□□□ 1.91
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VGF-201ENST00000249330 ZMYM3Q14202 1370 aa26.97■■□□□ 1.91
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VGF-201ENST00000249330 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.89■■□□□ 1.89
VGF-201ENST00000249330 ADGRB1O14514 1584 aa26.88■■□□□ 1.89
VGF-201ENST00000249330 NBR1Q14596 966 aa26.87■■□□□ 1.89
VGF-201ENST00000249330 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.87■■□□□ 1.89
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VGF-201ENST00000249330 TMC1Q8TDI8 760 aa26.86■■□□□ 1.89
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VGF-201ENST00000249330 ZFYVE9O95405 1425 aa26.83■■□□□ 1.89
VGF-201ENST00000249330 CDCA8Q53HL2 280 aa26.83■■□□□ 1.89
VGF-201ENST00000249330 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.82■■□□□ 1.88
VGF-201ENST00000249330 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.82■■□□□ 1.88
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VGF-201ENST00000249330 STK26Q9P289 416 aa26.81■■□□□ 1.88
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VGF-201ENST00000249330 TNRQ92752 1358 aa26.75■■□□□ 1.87
VGF-201ENST00000249330 RALBP1Q15311 655 aa26.75■■□□□ 1.87
VGF-201ENST00000249330 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
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VGF-201ENST00000249330 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.74■■□□□ 1.87
VGF-201ENST00000249330 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.74■■□□□ 1.87
VGF-201ENST00000249330 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.73■■□□□ 1.87
VGF-201ENST00000249330 SLC24A1O60721 1099 aa26.73■■□□□ 1.87
VGF-201ENST00000249330 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
VGF-201ENST00000249330 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
VGF-201ENST00000249330 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.72■■□□□ 1.87
VGF-201ENST00000249330 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.7■■□□□ 1.87
VGF-201ENST00000249330 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.7■■□□□ 1.87
VGF-201ENST00000249330 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
VGF-201ENST00000249330 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
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