RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.09■■□□□ 1.93
ODC1-201ENST00000234111 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
ODC1-201ENST00000234111 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.08■■□□□ 1.93
ODC1-201ENST00000234111 COG6Q9Y2V7 657 aa27.08■■□□□ 1.93
ODC1-201ENST00000234111 SYNJ2O15056 1496 aa27.07■■□□□ 1.92
ODC1-201ENST00000234111 PANK1Q8TE04 598 aa27.06■■□□□ 1.92
ODC1-201ENST00000234111 ERBINQ96RT1 1412 aa27.05■■□□□ 1.92
ODC1-201ENST00000234111 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
ODC1-201ENST00000234111 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.05■■□□□ 1.92
ODC1-201ENST00000234111 CHMP5Q9NZZ3 219 aa27.04■■□□□ 1.92
ODC1-201ENST00000234111 RGL3Q3MIN7 710 aa27.04■■□□□ 1.92
ODC1-201ENST00000234111 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
ODC1-201ENST00000234111 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
ODC1-201ENST00000234111 TPM2P07951 284 aa27.03■■□□□ 1.92
ODC1-201ENST00000234111 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.03■■□□□ 1.92
ODC1-201ENST00000234111 PDCL3Q9H2J4 239 aa27.02■■□□□ 1.92
ODC1-201ENST00000234111 TMF1P82094 1093 aa27.02■■□□□ 1.92
ODC1-201ENST00000234111 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
ODC1-201ENST00000234111 PDE3AQ14432 1141 aa27.01■■□□□ 1.91
ODC1-201ENST00000234111 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
ODC1-201ENST00000234111 APAF1O14727 1248 aa27.01■■□□□ 1.91
ODC1-201ENST00000234111 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27■■□□□ 1.91
ODC1-201ENST00000234111 PODXL2Q9NZ53 605 aa27■■□□□ 1.91
ODC1-201ENST00000234111 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.99■■□□□ 1.91
ODC1-201ENST00000234111 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.98■■□□□ 1.91
ODC1-201ENST00000234111 E9PSI1 815 aa26.97■■□□□ 1.91
ODC1-201ENST00000234111 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.97■■□□□ 1.91
ODC1-201ENST00000234111 JPH4Q96JJ6 628 aa26.96■■□□□ 1.91
ODC1-201ENST00000234111 DISP1Q96F81 1524 aa26.96■■□□□ 1.91
ODC1-201ENST00000234111 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
ODC1-201ENST00000234111 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
ODC1-201ENST00000234111 DDX11L8A8MPP1 907 aa26.95■■□□□ 1.91
ODC1-201ENST00000234111 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.95■■□□□ 1.91
ODC1-201ENST00000234111 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.95■■□□□ 1.91
ODC1-201ENST00000234111 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.94■■□□□ 1.9
ODC1-201ENST00000234111 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
ODC1-201ENST00000234111 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
ODC1-201ENST00000234111 GAS2L3Q86XJ1 694 aa26.94■■□□□ 1.9
ODC1-201ENST00000234111 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa26.93■■□□□ 1.9
ODC1-201ENST00000234111 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
ODC1-201ENST00000234111 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.92■■□□□ 1.9
ODC1-201ENST00000234111 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.91■■□□□ 1.9
ODC1-201ENST00000234111 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.91■■□□□ 1.9
ODC1-201ENST00000234111 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.91■■□□□ 1.9
ODC1-201ENST00000234111 PTPRGP23470 1445 aa26.9■■□□□ 1.9
ODC1-201ENST00000234111 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.9■■□□□ 1.9
ODC1-201ENST00000234111 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
ODC1-201ENST00000234111 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.89■■□□□ 1.9
ODC1-201ENST00000234111 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
ODC1-201ENST00000234111 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.89■■□□□ 1.89
ODC1-201ENST00000234111 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.88■■□□□ 1.89
ODC1-201ENST00000234111 A2MP01023 1474 aa26.88■■□□□ 1.89
ODC1-201ENST00000234111 PLEKHG5O94827 1062 aa26.88■■□□□ 1.89
ODC1-201ENST00000234111 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
ODC1-201ENST00000234111 ZMYM3Q14202 1370 aa26.88■■□□□ 1.89
ODC1-201ENST00000234111 NUP160Q12769 1436 aa26.87■■□□□ 1.89
ODC1-201ENST00000234111 KIAA0556O60303 1618 aa26.86■■□□□ 1.89
ODC1-201ENST00000234111 LAMC1P11047 1609 aa26.86■■□□□ 1.89
ODC1-201ENST00000234111 TNNQ9UQP3 1299 aa26.85■■□□□ 1.89
ODC1-201ENST00000234111 PIK3C2GO75747 1445 aa26.85■■□□□ 1.89
ODC1-201ENST00000234111 HSCBQ8IWL3 235 aa26.84■■□□□ 1.89
ODC1-201ENST00000234111 PRDM4Q9UKN5 801 aa26.84■■□□□ 1.89
ODC1-201ENST00000234111 ABCC2Q92887 1545 aa26.83■■□□□ 1.89
ODC1-201ENST00000234111 RBM10P98175 930 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
ODC1-201ENST00000234111 RLBP1P12271 317 aa26.83■■□□□ 1.89
ODC1-201ENST00000234111 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.82■■□□□ 1.88
ODC1-201ENST00000234111 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
ODC1-201ENST00000234111 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.8■■□□□ 1.88
ODC1-201ENST00000234111 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.8■■□□□ 1.88
ODC1-201ENST00000234111 TSPY4P0CV99 314 aa26.8■■□□□ 1.88
ODC1-201ENST00000234111 TSPY10P0CW01 314 aa26.8■■□□□ 1.88
ODC1-201ENST00000234111 RIPK4P57078 832 aa26.79■■□□□ 1.88
ODC1-201ENST00000234111 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.79■■□□□ 1.88
ODC1-201ENST00000234111 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.78■■□□□ 1.88
ODC1-201ENST00000234111 DDIT3P35638 169 aa26.78■■□□□ 1.88
ODC1-201ENST00000234111 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.77■■□□□ 1.88
ODC1-201ENST00000234111 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
ODC1-201ENST00000234111 OFD1O75665 1012 aa26.77■■□□□ 1.88
ODC1-201ENST00000234111 PLXNC1O60486 1568 aa26.77■■□□□ 1.88
ODC1-201ENST00000234111 ZSCAN30Q86W11 494 aa26.76■■□□□ 1.87
ODC1-201ENST00000234111 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.76■■□□□ 1.87
ODC1-201ENST00000234111 CCDC173Q0VFZ6 552 aa26.76■■□□□ 1.87
ODC1-201ENST00000234111 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.76■■□□□ 1.87
ODC1-201ENST00000234111 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.76■■□□□ 1.87
ODC1-201ENST00000234111 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
ODC1-201ENST00000234111 CHD1O14646 1710 aa26.75■■□□□ 1.87
ODC1-201ENST00000234111 WWC1Q8IX03 1113 aa26.75■■□□□ 1.87
ODC1-201ENST00000234111 PLA2R1Q13018 1463 aa26.74■■□□□ 1.87
ODC1-201ENST00000234111 AAMPQ13685 434 aa26.73■■□□□ 1.87
ODC1-201ENST00000234111 GBP4Q96PP9 640 aa26.73■■□□□ 1.87
ODC1-201ENST00000234111 FAM13BQ9NYF5 915 aa26.73■■□□□ 1.87
ODC1-201ENST00000234111 PPP1R9BQ96SB3 815 aa26.72■■□□□ 1.87
ODC1-201ENST00000234111 NASPP49321 788 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
ODC1-201ENST00000234111 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
ODC1-201ENST00000234111 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
ODC1-201ENST00000234111 MSNP26038 577 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
ODC1-201ENST00000234111 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
ODC1-201ENST00000234111 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.69■■□□□ 1.86
ODC1-201ENST00000234111 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.69■■□□□ 1.86
ODC1-201ENST00000234111 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.865e-7■■■■□ 23.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.9 ms