RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 TRAK2O60296 914 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXA13-201ENST00000222753 PDE3AQ14432 1141 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXA13-201ENST00000222753 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXA13-201ENST00000222753 HFM1A2PYH4 1435 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXA13-201ENST00000222753 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
HOXA13-201ENST00000222753 ROCK1Q13464 1354 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXA13-201ENST00000222753 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.77■■□□□ 1.23
HOXA13-201ENST00000222753 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXA13-201ENST00000222753 PANK1Q8TE04 598 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXA13-201ENST00000222753 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.76■■□□□ 1.23
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HOXA13-201ENST00000222753 RILPL2Q969X0 211 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXA13-201ENST00000222753 WDR97A6NE52 1622 aa22.76■■□□□ 1.23
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HOXA13-201ENST00000222753 TPM2P07951 284 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXA13-201ENST00000222753 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
HOXA13-201ENST00000222753 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
HOXA13-201ENST00000222753 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
HOXA13-201ENST00000222753 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
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HOXA13-201ENST00000222753 NPHP1O15259 732 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXA13-201ENST00000222753 EID1Q9Y6B2 187 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXA13-201ENST00000222753 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
HOXA13-201ENST00000222753 LNPKQ9C0E8 428 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXA13-201ENST00000222753 BECN2A8MW95 431 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXA13-201ENST00000222753 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXA13-201ENST00000222753 RIPK4P57078 832 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXA13-201ENST00000222753 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
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HOXA13-201ENST00000222753 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
HOXA13-201ENST00000222753 MCTP1Q6DN14 999 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXA13-201ENST00000222753 SYNJ1O43426 1573 aa22.7■■□□□ 1.22
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HOXA13-201ENST00000222753 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXA13-201ENST00000222753 H3BQV1 296 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXA13-201ENST00000222753 IFFO2Q5TF58 517 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXA13-201ENST00000222753 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXA13-201ENST00000222753 PPP2R1AP30153 589 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXA13-201ENST00000222753 TIAM1Q13009 1591 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXA13-201ENST00000222753 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
HOXA13-201ENST00000222753 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
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HOXA13-201ENST00000222753 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC184Q52MB2 194 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXA13-201ENST00000222753 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXA13-201ENST00000222753 GNAI1P63096 354 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXA13-201ENST00000222753 GORABQ5T7V8 394 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXA13-201ENST00000222753 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.66■■□□□ 1.22
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HOXA13-201ENST00000222753 MBD3O95983 291 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
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HOXA13-201ENST00000222753 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.64■■□□□ 1.21
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HOXA13-201ENST00000222753 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXA13-201ENST00000222753 GPS2Q13227 327 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXA13-201ENST00000222753 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.61■■□□□ 1.21
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HOXA13-201ENST00000222753 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXA13-201ENST00000222753 RABEP1Q15276 862 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXA13-201ENST00000222753 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXA13-201ENST00000222753 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXA13-201ENST00000222753 MCM2P49736 904 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF592Q92610 1267 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 NUTM2FA1L443 756 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 RNF20Q5VTR2 975 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 GCC1Q96CN9 775 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 TEX35Q5T0J7 233 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 MCM4P33991 863 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 TOP2BQ02880 1626 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 BICD2Q8TD16 824 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 BCAR3O75815 825 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 MTHFSP49914 203 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXA13-201ENST00000222753 NAIPQ13075 1403 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
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