RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000173357.7

Nelfe-204, Transcript of Negative elongation factor E, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nelfe, Length 1,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ncoa1P70365 1447 aa35.94■■■■□ 3.34
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Rock1P70335 1354 aa35.92■■■■□ 3.34
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Pip4k2bQ80XI4 416 aa35.89■■■■□ 3.34
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Rims2Q9EQZ7 1530 aa35.89■■■■□ 3.34
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Psme1P97371 249 aa35.89■■■■□ 3.34
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 PplQ9R269 1755 aa35.87■■■■□ 3.33
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Washc2Q6PGL7 1334 aa35.83■■■■□ 3.33
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Gm13695A2AK44 830 aa35.82■■■■□ 3.32
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa35.78■■■■□ 3.32
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Rgl3Q3UYI5 709 aa35.75■■■■□ 3.31
Nelfe-204ENSMUST00000173357 PalldQ9ET54 1408 aa35.73■■■■□ 3.31
Nelfe-204ENSMUST00000173357 AU022751B1B0V2 589 aa35.73■■■■□ 3.31
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa35.72■■■■□ 3.31
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Myo3aQ8K3H5 1613 aa35.71■■■■□ 3.31
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa35.69■■■■□ 3.3
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa35.66■■■■□ 3.3
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Setd1aE9PYH6 1716 aa35.61■■■■□ 3.29
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Rims1Q99NE5 1463 aa35.6■■■■□ 3.29
Nelfe-204ENSMUST00000173357 IghaA0A0A6YXW6 389 aa35.6■■■■□ 3.29
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Adamts13Q769J6 1426 aa35.58■■■■□ 3.29
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Med1Q925J9 1575 aa35.58■■■■□ 3.29
Nelfe-204ENSMUST00000173357 NefmP08553 848 aa35.58■■■■□ 3.29
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Slit3Q9WVB4 1523 aa35.58■■■■□ 3.29
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa35.57■■■■□ 3.28
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Shq1Q7TMX5 569 aa35.56■■■■□ 3.28
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Slc52a2Q9D8F3 450 aa35.53■■■■□ 3.28
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Q9D9H8 365 aa35.53■■■■□ 3.28
Nelfe-204ENSMUST00000173357 PzpQ61838 1495 aa35.52■■■■□ 3.28
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Asxl2Q8BZ32 1370 aa35.51■■■■□ 3.28
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Kdm2aP59997 1161 aa35.49■■■■□ 3.27
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Gli3Q61602 1583 aa35.45■■■■□ 3.26
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Pik3r4Q8VD65 1358 aa35.44■■■■□ 3.26
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Os9Q8K2C7 672 aa35.44■■■■□ 3.26
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Neurod1Q60867 357 aa35.43■■■■□ 3.26
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Gm20521D3Z5F7 333 aa35.4■■■■□ 3.26
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa35.4■■■■□ 3.26
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Polr3aB2RXC6 1390 aa35.39■■■■□ 3.26
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Fan1Q69ZT1 1020 aa35.38■■■■□ 3.25
Nelfe-204ENSMUST00000173357 MaddQ80U28 1577 aa35.37■■■■□ 3.25
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa35.34■■■■□ 3.25
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 TonslQ6NZL6 1363 aa35.32■■■■□ 3.25
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Arap3Q8R5G7 1538 aa35.32■■■■□ 3.24
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
Nelfe-204ENSMUST00000173357 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Stk26Q99JT2 416 aa35.24■■■■□ 3.23
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Tns3Q5SSZ5 1440 aa35.24■■■■□ 3.23
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Mbd5B1AYB6 1498 aa35.22■■■■□ 3.23
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Mug2P28666 1451 aa35.2■■■■□ 3.23
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Lrrc7Q80TE7 1490 aa35.2■■■■□ 3.23
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Col18a1P39061 1774 aa35.2■■■■□ 3.22
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa35.18■■■■□ 3.22
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Cps1Q8C196 1500 aa35.18■■■■□ 3.22
Nelfe-204ENSMUST00000173357 IqubQ8CDK3 788 aa35.15■■■■□ 3.22
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ift172Q6VH22 1749 aa35.15■■■■□ 3.22
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa35.12■■■■□ 3.21
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Usp40Q8BWR4 1235 aa35.12■■■■□ 3.21
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Plekhg1F6S200 1446 aa35.11■■■■□ 3.21
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Slain2Q8CI08 581 aa35.1■■■■□ 3.21
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Stard8Q8K031 1019 aa35.1■■■■□ 3.21
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Dapk1Q80YE7 1442 aa35.09■■■■□ 3.21
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Stag3O70576 1240 aa35.06■■■■□ 3.2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Tmem94Q7TSH8 1360 aa35.06■■■■□ 3.2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Rundc1Q0VDN7 615 aa35.05■■■■□ 3.2
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Col14a1Q80X19 1797 aa35.05■■■■□ 3.2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Cep170bQ80U49 1574 aa35.04■■■■□ 3.2
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Evi5lH3BKQ3 813 aa35.01■■■■□ 3.2
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Iqsec2Q5DU25 1478 aa35■■■■□ 3.19
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Card11Q8CIS0 1159 aa35■■■■□ 3.19
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Fbxo41Q6NS60 873 aa34.99■■■■□ 3.19
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Q3UJC8 639 aa34.97■■■■□ 3.19
Nelfe-204ENSMUST00000173357 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa34.96■■■■□ 3.19
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