RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000072232.8

Tmod3-201, Transcript of Tropomodulin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tmod3, Length 3,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Disp1Q3TDN0 1521 aa11.29□□□□□ -0.6
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Gm20521D3Z5F7 333 aa11.29□□□□□ -0.6
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Rnf214Q8BFU3 668 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Rsph3aQ3UFY4 516 aa11.27□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 WizO88286 1684 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Tspyl2Q7TQI8 677 aa11.26□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Znf330Q922H9 316 aa11.26□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Inpp5dQ9ES52 1191 aa11.26□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Kank1E9Q238 1360 aa11.26□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Pank3Q8R2W9 370 aa11.26□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Map7O88735 730 aa11.25□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Soga1E1U8D0 1418 aa11.25□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Kif3bQ61771 747 aa11.25□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa11.24□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Magi3Q9EQJ9 1476 aa11.24□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Slc4a1apE9PX68 744 aa11.23□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 AcrbpQ3V140 540 aa11.23□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Tmem132aQ922P8 1018 aa11.23□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Trim30aP15533 496 aa11.23□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Podxl2Q8CAE9 603 aa11.23□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Map3k5O35099 1380 aa11.22□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Kif16bB1AVY7 1312 aa11.22□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Pdlim2Q8R1G6 349 aa11.22□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa11.22□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Pcmtd1P59913 357 aa11.22□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Casc1Q6TDU8 730 aa11.22□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Fam163aQ8CAA5 168 aa11.21□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Gse1Q3U3C9 1213 aa11.21□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Gys2Q8VCB3 704 aa11.21□□□□□ -0.61
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Clcn1Q64347 994 aa11.21□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 MpndQ3TV65 487 aa11.2□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Srcin1Q9QWI6 1250 aa11.2□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Rock1P70335 1354 aa11.2□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Il16O54824 1322 aa11.2□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Rock2P70336 1388 aa11.2□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Fan1Q69ZT1 1020 aa11.19□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Neo1P97798 1493 aa11.19□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Catsper2A2ARP9 588 aa11.19□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa11.19□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Ccdc30Q8BVF4 654 aa11.19□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa11.18□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Pde4cQ3UEI1 686 aa11.18□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Golga2Q921M4 999 aa11.17□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Magi1Q6RHR9 1471 aa11.17□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Fez1Q8K0X8 392 aa11.17□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Chmp4cQ9D7F7 232 aa11.16□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa11.16□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa11.16□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Q4VA45 678 aa11.16□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Tomm22Q9CPQ3 142 aa11.16□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa11.16□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Tmf1B9EKI3 1091 aa11.15□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Erbb4Q61527 1308 aa11.15□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa11.15□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Ccdc146E9Q9F7 977 aa11.15□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Ksr2Q3UVC0 959 aa11.15□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Lemd3Q9WU40 921 aa11.15□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Sall3Q62255 1320 aa11.15□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Nom1Q3UFM5 854 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Stk26Q99JT2 416 aa11.15□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Ripk4Q9ERK0 786 aa11.15□□□□□ -0.62
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Serpina10Q8R121 448 aa11.14□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Pnmal2G3X9N3 661 aa11.14□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Stag3O70576 1240 aa11.14□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa11.14□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Cd109Q8R422 1442 aa11.14□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Casq1O09165 405 aa11.14□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Peg3Q3URU2 1571 aa11.14□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Shroom2A2ALU4 1481 aa11.14□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Plekhh1Q80TI1 1356 aa11.13□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Plekhg5Q66T02 1073 aa11.13□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Lekr1B2RVN1 116 aa11.13□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Adam1bQ8R534 806 aa11.13□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Rfx7F8VPJ6 1459 aa11.13□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Zscan10Q3URR7 782 aa11.12□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Arhgap5P97393 1501 aa11.12□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Map7d2A2AG50 781 aa11.12□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Myom3A2ABU4 1439 aa11.12□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Kcnj4P52189 445 aa11.12□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Pank2Q3U4S0 443 aa11.12□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Trim58Q5NCC9 485 aa11.12□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Terf2O35144 541 aa11.11□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Tmco5bQ80X59 307 aa11.11□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Camsap2Q8C1B1 1461 aa11.11□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 NcapgE9PWG6 1004 aa11.11□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Gzf1Q4VBD9 706 aa11.11□□□□□ -0.63
Tmod3-201ENSMUST00000072232 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.4 ms