RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000051221.12

Ankrd40-202, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd40, Length 1,477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Txndc2Q6P902 515 aa44.47■■■■■ 4.71
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa44.46■■■■■ 4.71
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Scn4aQ9ER60 1841 aa44.46■■■■■ 4.71
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Psme1P97371 249 aa44.33■■■■■ 4.69
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa44.13■■■■■ 4.66
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Arhgef28P97433 1693 aa44.12■■■■■ 4.65
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Polr3aB2RXC6 1390 aa44.07■■■■■ 4.65
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Kdm2aP59997 1161 aa44.07■■■■■ 4.65
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Setd1aE9PYH6 1716 aa44.03■■■■■ 4.64
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Mbd5B1AYB6 1498 aa44.02■■■■■ 4.64
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Slc52a2Q9D8F3 450 aa44■■■■■ 4.63
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa43.99■■■■■ 4.63
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa43.75■■■■■ 4.59
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Arap3Q8R5G7 1538 aa43.74■■■■■ 4.59
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa43.72■■■■■ 4.59
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Stk26Q99JT2 416 aa43.72■■■■■ 4.59
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Rundc1Q0VDN7 615 aa43.68■■■■■ 4.58
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa43.66■■■■■ 4.58
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa43.65■■■■■ 4.58
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Cps1Q8C196 1500 aa43.61■■■■■ 4.57
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 IqubQ8CDK3 788 aa43.57■■■■■ 4.56
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Nphp4P59240 1425 aa43.56■■■■■ 4.56
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ift172Q6VH22 1749 aa43.49■■■■■ 4.55
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa43.49■■■■■ 4.55
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Srcin1Q9QWI6 1250 aa43.45■■■■■ 4.55
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Zbtb4Q5F293 982 aa43.39■■■■■ 4.54
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Col18a1P39061 1774 aa43.38■■■■■ 4.53
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Rock2P70336 1388 aa43.37■■■■■ 4.53
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Tmem94Q7TSH8 1360 aa43.36■■■■■ 4.53
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa43.35■■■■■ 4.53
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa43.35■■■■■ 4.53
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Nwd1A6H603 1563 aa43.29■■■■■ 4.52
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Usp32F8VPZ3 1604 aa43.29■■■■■ 4.52
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