RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039517.10

Syde2-201, Transcript of Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Syde2, Length 5,495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tdrd9Q14BI7 1383 aa25.44■■□□□ 1.66
Syde2-201ENSMUST00000039517 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
Syde2-201ENSMUST00000039517 Pank1Q8K4K6 548 aa25.44■■□□□ 1.66
Syde2-201ENSMUST00000039517 Vps8Q0P5W1 1427 aa25.44■■□□□ 1.66
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ccdc183A2AJB1 534 aa25.43■■□□□ 1.66
Syde2-201ENSMUST00000039517 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ciz1Q8VEH2 845 aa25.43■■□□□ 1.66
Syde2-201ENSMUST00000039517 AppP12023 770 aa25.43■■□□□ 1.66
Syde2-201ENSMUST00000039517 Phactr2B1AVP0 632 aa25.42■■□□□ 1.66
Syde2-201ENSMUST00000039517 Fbxo2Q80UW2 297 aa25.42■■□□□ 1.66
Syde2-201ENSMUST00000039517 Plekhh1Q80TI1 1356 aa25.42■■□□□ 1.66
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tceal9Q9DD24 104 aa25.41■■□□□ 1.66
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ttll13A4Q9F6 804 aa25.4■■□□□ 1.66
Syde2-201ENSMUST00000039517 ErbinQ80TH2 1402 aa25.4■■□□□ 1.66
Syde2-201ENSMUST00000039517 Polr3gQ6NXY9 223 aa25.4■■□□□ 1.66
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tomm22Q9CPQ3 142 aa25.4■■□□□ 1.66
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ric3Q8BPM6 367 aa25.39■■□□□ 1.66
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tpm1P58771 284 aa25.39■■□□□ 1.66
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gm21969J3QJZ1 289 aa25.38■■□□□ 1.65
Syde2-201ENSMUST00000039517 Usp16Q99LG0 825 aa25.38■■□□□ 1.65
Syde2-201ENSMUST00000039517 Bicd2Q921C5 820 aa25.38■■□□□ 1.65
Syde2-201ENSMUST00000039517 Q9D2X8 372 aa25.38■■□□□ 1.65
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cetn4Q8K4K1 168 aa25.37■■□□□ 1.65
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gnai1B2RSH2 354 aa25.36■■□□□ 1.65
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ddx11Q6AXC6 880 aa25.36■■□□□ 1.65
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gnai3Q9DC51 354 aa25.36■■□□□ 1.65
Syde2-201ENSMUST00000039517 Smc4Q8CG47 1286 aa25.36■■□□□ 1.65
Syde2-201ENSMUST00000039517 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa25.36■■□□□ 1.65
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cplx2P84086 134 aa25.36■■□□□ 1.65
Syde2-201ENSMUST00000039517 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rnf20Q5DTM8 973 aa25.35■■□□□ 1.65
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gabpb2P81069 414 aa25.34■■□□□ 1.65
Syde2-201ENSMUST00000039517 Taf3Q5HZG4 932 aa25.34■■□□□ 1.65
Syde2-201ENSMUST00000039517 BccipQ9CWI3 316 aa25.34■■□□□ 1.65
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
Syde2-201ENSMUST00000039517 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa25.34■■□□□ 1.65
Syde2-201ENSMUST00000039517 Nsd2Q8BVE8 1365 aa25.33■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Drc7Q6V3W6 876 aa25.32■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Evc2Q8K1G2 1220 aa25.32■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Swt1Q9DBQ9 907 aa25.32■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tpm2P58774 284 aa25.31■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa25.31■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Hmgn5Q9JL35 406 aa25.3■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ccdc173A0JLY1 547 aa25.3■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Hmox1P14901 289 aa25.3■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Nek4Q9Z1J2 792 aa25.3■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Nectin2P32507 530 aa25.3■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Chmp4cQ9D7F7 232 aa25.3■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rec8Q8C5S7 591 aa25.29■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tpm4Q6IRU2 248 aa25.29■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Pknox2Q8BG99 474 aa25.29■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa25.29■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 PrkcshO08795 521 aa25.29■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 A0A1L1SQF0 893 aa25.28■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 PogkQ80TC5 607 aa25.28■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Q7TT23 1179 aa25.27■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Nutm1Q8BHP2 1126 aa25.27■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Chmp7Q8R1T1 451 aa25.27■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Shroom4Q1W617 1475 aa25.27■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ipo7Q9EPL8 1038 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ift140E9PY46 1464 aa25.26■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cplx1P63040 134 aa25.26■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gsto1O09131 240 aa25.26■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Krt82Q99M74 516 aa25.26■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Pdcl3Q8BVF2 240 aa25.25■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ftsj3Q9DBE9 838 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Zfp644E9QA22 1323 aa25.25■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ccdc34Q3UI66 367 aa25.25■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Erc2Q6PH08 957 aa25.25■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Dixdc1Q80Y83 711 aa25.24■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Fyb1O35601 819 aa25.23■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 SkilQ60665 675 aa25.23■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa25.23■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa25.23■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Efcab5A0JP43 1406 aa25.23■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Samd1D3YXK1 519 aa25.23■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa25.23■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Vps53Q8CCB4 832 aa25.22■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 EzrP26040 586 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gpatch3Q8BIY1 525 aa25.21■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Plcd4Q8K3R3 807 aa25.21■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa25.21■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cchcr1Q8K2I2 770 aa25.2■■□□□ 1.62
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa25.2■■□□□ 1.62
Syde2-201ENSMUST00000039517 Mcm2P97310 904 aa25.19■■□□□ 1.62
Syde2-201ENSMUST00000039517 Naip1Q9QWK5 1403 aa25.19■■□□□ 1.62
Syde2-201ENSMUST00000039517 Prdm16A2A935 1275 aa25.19■■□□□ 1.62
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rnf214Q8BFU3 668 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
Syde2-201ENSMUST00000039517 Neurod6P48986 337 aa25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.7 ms