Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
Samd1D3YXK1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Samd1D3YXK1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Samd1D3YXK1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Samd1D3YXK1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Samd1D3YXK1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Samd1D3YXK1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Samd1D3YXK1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Samd1D3YXK1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Samd1D3YXK1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Samd1D3YXK1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Samd1D3YXK1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Samd1D3YXK1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Samd1D3YXK1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Samd1D3YXK1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Samd1D3YXK1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Samd1D3YXK1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Samd1D3YXK1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Samd1D3YXK1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Samd1D3YXK1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Samd1D3YXK1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Samd1D3YXK1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Samd1D3YXK1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Samd1D3YXK1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Samd1D3YXK1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Samd1D3YXK1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Samd1D3YXK1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Samd1D3YXK1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Samd1D3YXK1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Samd1D3YXK1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Samd1D3YXK1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Samd1D3YXK1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Samd1D3YXK1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Samd1D3YXK1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Samd1D3YXK1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Samd1D3YXK1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Samd1D3YXK1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Samd1D3YXK1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Samd1D3YXK1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Samd1D3YXK1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Samd1D3YXK1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Samd1D3YXK1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Samd1D3YXK1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Samd1D3YXK1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Samd1D3YXK1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Samd1D3YXK1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Samd1D3YXK1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Samd1D3YXK1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Samd1D3YXK1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Samd1D3YXK1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Samd1D3YXK1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Samd1D3YXK1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Samd1D3YXK1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Samd1D3YXK1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Samd1D3YXK1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Samd1D3YXK1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Samd1D3YXK1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Samd1D3YXK1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Samd1D3YXK1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Samd1D3YXK1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Samd1D3YXK1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Samd1D3YXK1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Samd1D3YXK1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Samd1D3YXK1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Samd1D3YXK1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Samd1D3YXK1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Samd1D3YXK1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Samd1D3YXK1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Samd1D3YXK1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Samd1D3YXK1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Samd1D3YXK1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Samd1D3YXK1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Samd1D3YXK1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Samd1D3YXK1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Samd1D3YXK1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Samd1D3YXK1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Samd1D3YXK1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Samd1D3YXK1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Samd1D3YXK1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Samd1D3YXK1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Samd1D3YXK1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Samd1D3YXK1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Samd1D3YXK1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Samd1D3YXK1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Samd1D3YXK1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Samd1D3YXK1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Samd1D3YXK1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Samd1D3YXK1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Samd1D3YXK1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Samd1D3YXK1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Samd1D3YXK1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Samd1D3YXK1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Samd1D3YXK1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Samd1D3YXK1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Samd1D3YXK1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Samd1D3YXK1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Samd1D3YXK1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Samd1D3YXK1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Samd1D3YXK1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Samd1D3YXK1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms