RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034876.9

Tspan3-201, Transcript of Tetraspanin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tspan3, Length 1,716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa36.03■■■■□ 3.36
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa35.57■■■■□ 3.28
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 Atp1b4Q99ME6 356 aa35.5■■■■□ 3.27
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Lrrc7Q80TE7 1490 aa35.5■■■■□ 3.27
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa35.47■■■■□ 3.27
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 PalldQ9ET54 1408 aa35.43■■■■□ 3.26
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 IqubQ8CDK3 788 aa35.37■■■■□ 3.25
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Txndc2Q6P902 515 aa35.35■■■■□ 3.25
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Alpk3Q924C5 1678 aa35.35■■■■□ 3.25
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.25
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Psme1P97371 249 aa35.32■■■■□ 3.24
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Sbno1Q689Z5 1390 aa35.31■■■■□ 3.24
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Stk26Q99JT2 416 aa35.31■■■■□ 3.24
Tspan3-201ENSMUST00000034876 PrxO55103 1391 aa35.3■■■■□ 3.24
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 Slc4a1apE9PX68 744 aa35.22■■■■□ 3.23
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cep170bQ80U49 1574 aa35.19■■■■□ 3.22
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 Plekhg1F6S200 1446 aa35.12■■■■□ 3.21
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Zscan10Q3URR7 782 aa35.12■■■■□ 3.21
Tspan3-201ENSMUST00000034876 IghaA0A0A6YXW6 389 aa35.11■■■■□ 3.21
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Slit3Q9WVB4 1523 aa35.11■■■■□ 3.21
Tspan3-201ENSMUST00000034876 InsrP15208 1372 aa35.1■■■■□ 3.21
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa35.1■■■■□ 3.21
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mrs2Q5NCE8 434 aa35.08■■■■□ 3.21
Tspan3-201ENSMUST00000034876 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
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