RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000005769.12

Tmod4-201, Transcript of Tropomodulin-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tmod4, Length 1,242 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Dot1lQ6XZL8 1540 aa21.3■■□□□ 1
Tmod4-201ENSMUST00000005769 AatkQ80YE4 1365 aa21.3■■□□□ 1
Tmod4-201ENSMUST00000005769 P3h3Q8CG70 732 aa21.29■■□□□ 1
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa21.29■■□□□ 1
Tmod4-201ENSMUST00000005769 PplQ9R269 1755 aa21.28■■□□□ 1
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Psme1P97371 249 aa21.27■■□□□ 1
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Rapgef3Q8VCC8 918 aa21.27■■□□□ 1
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa21.26■□□□□ 0.99
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa21.26■□□□□ 0.99
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Myo3aQ8K3H5 1613 aa21.26■□□□□ 0.99
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Gm13695A2AK44 830 aa21.25■□□□□ 0.99
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa21.25■□□□□ 0.99
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa21.23■□□□□ 0.99
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Eid3Q3V124 375 aa21.22■□□□□ 0.99
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Gli3Q61602 1583 aa21.21■□□□□ 0.99
Tmod4-201ENSMUST00000005769 PalldQ9ET54 1408 aa21.21■□□□□ 0.99
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Med1Q925J9 1575 aa21.2■□□□□ 0.98
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa21.2■□□□□ 0.98
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Setd1aE9PYH6 1716 aa21.19■□□□□ 0.98
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Washc2Q6PGL7 1334 aa21.18■□□□□ 0.98
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Rock1P70335 1354 aa21.18■□□□□ 0.98
Tmod4-201ENSMUST00000005769 IghaA0A0A6YXW6 389 aa21.17■□□□□ 0.98
Tmod4-201ENSMUST00000005769 AU022751B1B0V2 589 aa21.17■□□□□ 0.98
Tmod4-201ENSMUST00000005769 PzpQ61838 1495 aa21.17■□□□□ 0.98
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Arhgef28P97433 1693 aa21.17■□□□□ 0.98
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa21.17■□□□□ 0.98
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa21.16■□□□□ 0.98
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Usp47Q8BY87 1376 aa21.15■□□□□ 0.98
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Slit3Q9WVB4 1523 aa21.14■□□□□ 0.97
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Atp1b4Q99ME6 356 aa21.13■□□□□ 0.97
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Asxl2Q8BZ32 1370 aa21.12■□□□□ 0.97
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa21.1■□□□□ 0.97
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Rgl3Q3UYI5 709 aa21.09■□□□□ 0.97
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Tulp4Q9JIL5 1547 aa21.09■□□□□ 0.97
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Rims1Q99NE5 1463 aa21.07■□□□□ 0.96
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Q9D9H8 365 aa21.07■□□□□ 0.96
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Adamts13Q769J6 1426 aa21.06■□□□□ 0.96
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Shq1Q7TMX5 569 aa21.06■□□□□ 0.96
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Fbxo41Q6NS60 873 aa21.02■□□□□ 0.96
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa21.01■□□□□ 0.95
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Pik3r4Q8VD65 1358 aa21■□□□□ 0.95
Tmod4-201ENSMUST00000005769 MaddQ80U28 1577 aa20.99■□□□□ 0.95
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Arap3Q8R5G7 1538 aa20.99■□□□□ 0.95
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Slc52a2Q9D8F3 450 aa20.97■□□□□ 0.95
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Tns3Q5SSZ5 1440 aa20.96■□□□□ 0.95
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Kdm2aP59997 1161 aa20.96■□□□□ 0.95
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Col18a1P39061 1774 aa20.95■□□□□ 0.94
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Hspa1lP16627 641 aa20.93■□□□□ 0.94
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Os9Q8K2C7 672 aa20.93■□□□□ 0.94
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Iqsec2Q5DU25 1478 aa20.93■□□□□ 0.94
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Fan1Q69ZT1 1020 aa20.91■□□□□ 0.94
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Amigo3Q8C2S7 508 aa20.91■□□□□ 0.94
Tmod4-201ENSMUST00000005769 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa20.9■□□□□ 0.94
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Mbd5B1AYB6 1498 aa20.89■□□□□ 0.94
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Cps1Q8C196 1500 aa20.88■□□□□ 0.93
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Ift172Q6VH22 1749 aa20.88■□□□□ 0.93
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Gm20521D3Z5F7 333 aa20.88■□□□□ 0.93
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa20.88■□□□□ 0.93
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Neurod1Q60867 357 aa20.87■□□□□ 0.93
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Stk26Q99JT2 416 aa20.87■□□□□ 0.93
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Bcl11bQ99PV8 884 aa20.87■□□□□ 0.93
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Slain2Q8CI08 581 aa20.86■□□□□ 0.93
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Lrrc7Q80TE7 1490 aa20.86■□□□□ 0.93
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Polr3aB2RXC6 1390 aa20.85■□□□□ 0.93
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Evi5lH3BKQ3 813 aa20.85■□□□□ 0.93
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Tmem94Q7TSH8 1360 aa20.84■□□□□ 0.93
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Col14a1Q80X19 1797 aa20.82■□□□□ 0.92
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Brinp3Q499E0 766 aa20.81■□□□□ 0.92
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Ecm2Q5FW85 670 aa20.81■□□□□ 0.92
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa20.81■□□□□ 0.92
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Cep170bQ80U49 1574 aa20.8■□□□□ 0.92
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Nwd1A6H603 1563 aa20.79■□□□□ 0.92
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Tmod4-201ENSMUST00000005769 DnmbpQ6TXD4 1580 aa20.77■□□□□ 0.92
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Mug2P28666 1451 aa20.77■□□□□ 0.92
Tmod4-201ENSMUST00000005769 NalcnQ8BXR5 1738 aa20.77■□□□□ 0.92
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Plekhg1F6S200 1446 aa20.77■□□□□ 0.91
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa20.76■□□□□ 0.91
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Usp40Q8BWR4 1235 aa20.74■□□□□ 0.91
Tmod4-201ENSMUST00000005769 IqubQ8CDK3 788 aa20.74■□□□□ 0.91
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Usp32F8VPZ3 1604 aa20.74■□□□□ 0.91
Tmod4-201ENSMUST00000005769 C3P01027 1663 aa20.73■□□□□ 0.91
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Q3UJC8 639 aa20.72■□□□□ 0.91
Tmod4-201ENSMUST00000005769 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa20.72■□□□□ 0.91
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Stag3O70576 1240 aa20.71■□□□□ 0.91
Tmod4-201ENSMUST00000005769 Atf3Q60765 181 aa20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.3 ms