RNA–Protein interactions for RNA: tR(UCU)Q1

tR(UCU)Q1, Transcript of Mitochondrial arginine tRNA (tRNA-Arg), yeastyeast

Gene tR(UCU)Q1, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 ATG22P25568 528 aa0.86□□□□□ -2.27
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 DOG2P38773 246 aa0.86□□□□□ -2.27
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 LCL2Q08045 131 aa0.86□□□□□ -2.27
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YLR156WP0CE96 114 aa0.85□□□□□ -2.27
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YLR159WP0CE97 114 aa0.85□□□□□ -2.27
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YLR161WP0CE98 114 aa0.85□□□□□ -2.27
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 MRPL28P36527 147 aa0.85□□□□□ -2.27
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SNZ1Q03148 297 aa0.85□□□□□ -2.27
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YHR212W-AP0CX91 67 aa0.84□□□□□ -2.27
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YNL247WP53852 767 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TUS1Q06412 1307 aa0.84□□□□□ -2.28
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TCP1P12612 559 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YOR029WQ12243 111 aa0.83□□□□□ -2.28
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RPT5P33297 434 aaKnown RBP0.82□□□□□ -2.28
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 KRE28Q04431 385 aa0.82□□□□□ -2.28
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YLR236CA0A023PZG4 107 aa0.81□□□□□ -2.28
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 OM45P16547 393 aa0.81□□□□□ -2.28
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 GVP36P40531 326 aaKnown RBP0.81□□□□□ -2.28
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SEC11P15367 167 aa0.8□□□□□ -2.28
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 CDC10P25342 322 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SPT3P06844 337 aa0.79□□□□□ -2.28
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TIM9O74700 87 aa0.78□□□□□ -2.28
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 BCY1P07278 416 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 VMA22P38784 181 aa0.78□□□□□ -2.28
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP0.78□□□□□ -2.28
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YHR007C-AQ07074 71 aa0.78□□□□□ -2.28
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SEC17P32602 292 aa0.77□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YBR285WP38354 144 aa0.77□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RTT105P40063 208 aa0.77□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PRM8P53174 237 aa0.77□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SIR2P06700 562 aa0.76□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RPO26P20435 155 aa0.76□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YER034WP40022 185 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YOL160WQ08321 113 aa0.76□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 MCP1Q12106 302 aa0.76□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TRM9P49957 279 aa0.75□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 NTF2P33331 125 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 EAF6P47128 113 aa0.74□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 NUP84P52891 726 aa0.74□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 CUE1P38428 203 aa0.73□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 HYR1P40581 163 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 NSA1P53136 463 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 MRPL50P53724 139 aa0.73□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 KAP95Q06142 861 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PAM18Q07914 168 aa0.73□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 ATG31Q12421 196 aa0.73□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 MRPL25P23369 157 aa0.72□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YMR252CQ04814 134 aa0.72□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RAD28Q12021 506 aa0.72□□□□□ -2.29
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TCA17P32613 152 aa0.71□□□□□ -2.3
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 MDM35O60200 86 aa0.7□□□□□ -2.3
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SKG1P36169 355 aa0.7□□□□□ -2.3
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YFH7P43591 353 aa0.7□□□□□ -2.3
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TDA8Q6B2U8 126 aa0.7□□□□□ -2.3
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 DBF2P22204 572 aa0.69□□□□□ -2.3
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YEA4P40004 342 aa0.69□□□□□ -2.3
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PRE6P40303 254 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YLR173WQ06247 608 aa0.69□□□□□ -2.3
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YOL107WQ12239 342 aa0.69□□□□□ -2.3
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 DRS2P39524 1355 aa0.69□□□□□ -2.3
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 FAR7P43592 221 aa0.68□□□□□ -2.3
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 CDC123Q05791 360 aa0.68□□□□□ -2.3
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 UTP30P36144 274 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 BNA6P43619 295 aa0.66□□□□□ -2.3
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 URA6P15700 204 aa0.65□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 UGX2P32772 223 aa0.65□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 LIA1P47120 325 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YNL134CP53912 376 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SRL4Q03085 281 aa0.65□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YDR249CQ03787 373 aa0.65□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 URA5P13298 226 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 HPA3P39979 161 aa0.64□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YRA1Q12159 226 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 MED4Q12343 284 aa0.64□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 CDC36P06100 191 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 STP22P25604 385 aa0.63□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 APS1P35181 156 aa0.62□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RPC17P47076 161 aa0.62□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data0.61□□□□□ -2.31not detected
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 BRR6P53062 197 aa0.61□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 CDC28P00546 298 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 BET1P22804 142 aa0.6□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RIB7P33312 244 aa0.6□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 FYV6P53913 173 aa0.6□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YDR274CP87283 123 aa0.6□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data0.6□□□□□ -2.31not detected
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 DIG2Q03373 323 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YLR283WQ05867 314 aa0.6□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 ATP15P21306 62 aa0.59□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 LDB7P38210 180 aa0.59□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YEL008WP40001 126 aa0.59□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 MIC26P50087 233 aa0.59□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 COA3Q3E7B2 85 aa0.59□□□□□ -2.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 KSS1P14681 368 aa0.58□□□□□ -2.32
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YCL042WP25572 119 aa0.58□□□□□ -2.32
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YPL073CP40323 161 aa0.58□□□□□ -2.32
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