RNA–Protein interactions for RNA: YJL113W

YJL113W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YJL113W, Length 4,647 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL113WYJL113W NHP6BP11633 99 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YCL068CP25593 260 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W MRP49P32388 137 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W UGX2P32772 223 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W MTC2P34246 357 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W EFM1P38732 585 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RFC2P40348 353 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W PRM2P40534 656 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data-0.59□□□□□ -2.5not detected
YJL113WYJL113W YPT32P51996 222 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YLR460CP54007 376 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YMR253CQ04835 414 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W DXO1Q06349 442 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W QCR7P00128 127 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W CDC34P14682 295 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W MDL1P33310 695 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YER135CP40082 130 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RPR2P40571 144 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W PNC1P53184 216 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SSU72P53538 206 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W COX12Q01519 83 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W UPS3Q04006 179 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W AIM6Q07716 390 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W VIK1Q12045 647 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YDL009CQ12210 107 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YOL163WP0CF20 169 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RPN12P32496 274 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YHL044WP38727 235 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W CKB2P38930 258 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W BDH1P39714 382 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W DPB11P47027 764 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W BNA1P47096 177 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W TDA4P47153 279 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W DAN1P47178 298 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W DBP6P53734 629 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W KEI1Q06346 221 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YPR172WQ06608 200 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W ATG29Q12092 213 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YKL023C-AQ2V2P3 75 aa-0.59□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W CAP2P13517 287 aa-0.6□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YCR090CP25654 182 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W MRP20P32387 263 aa-0.6□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YBR096WP38256 230 aa-0.6□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W VPS41P38959 992 aa-0.6□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SEC28P40509 296 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W TDA10P42938 290 aa-0.6□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W MOB2P43563 287 aa-0.6□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W CAK1P43568 368 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YGR050CP53231 118 aa-0.6□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W RRN5Q02983 363 aa-0.6□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W NEJ1Q06148 342 aa-0.6□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W FRQ1Q06389 190 aa-0.6□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YOR214CQ12282 236 aa-0.6□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W SPO24Q3E752 67 aa-0.6□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W YCL012CQ8J0M4 134 aa-0.6□□□□□ -2.5
YJL113WYJL113W PIS1P06197 220 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W PET309P32522 965 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W SCM4P32564 187 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.6□□□□□ -2.51not detected
YJL113WYJL113W YPC1P38298 316 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W COS4P43542 379 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YJL016WP47072 561 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YGR016WP53209 190 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W SML1Q04964 104 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W THI21Q08975 551 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W COA6Q3E846 104 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W ARG4P04076 463 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W PET494P07390 489 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W URA6P15700 204 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W SEC22P22214 214 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YCR016WP25617 290 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W BUB2P26448 306 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W FZF1P32805 299 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W SUR1P33300 382 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YMR134WP40207 237 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W COS10P52924 374 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YET2Q04210 160 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W BRX1Q08235 291 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W TIM18Q08749 192 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W MDY2Q12285 212 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W ATG5Q12380 294 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W MTR10Q99189 972 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W RPL6BP05739 176 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W MF(ALPHA)2P32435 120 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W SUA5P32579 426 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W MTC7P32633 139 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YFR018CP43599 363 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W MRM2P53123 320 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W MRH4P53166 561 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W GET1P53192 235 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W BNA7Q04066 261 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YMR130WQ04223 302 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YLR173WQ06247 608 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W FYV12Q08559 129 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W GET4Q12125 312 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W AYT1Q12226 474 aa-0.6□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa-0.6□□□□□ -2.51
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