RNA–Protein interactions for RNA: YJL019W

MPS3, Transcript of Nuclear envelope protein, yeast

Gene MPS3, Length 2,049 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MPS3	YJL019W	MRS4	P23500	304 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	ATG15	P25641	520 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	PPA2	P28239	310 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	AGA2	P32781	87 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	YBR096W	P38256	230 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	OM14	P38325	134 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	PAU13	P38725	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	YHR180W	P38868	163 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	ZIM17	P42844	174 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	ATG27	P46989	271 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	YGR149W	P48236	432 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	MRP51	Q02950	344 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	PAU10	Q03050	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	PIN3	Q06449	215 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	OPI10	Q08202	246 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	PAU20	Q08322	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	MCP1	Q12106	302 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	POM33	Q12164	279 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	YBR197C	P38306	217 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	MED6	P38782	295 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	FMP10	P40098	244 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	YJR012C	P47087	207 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	YNL165W	P53891	406 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	NDE2	Q07500	545 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	IRC13	Q08630	104 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	LAS17	Q12446	633 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	AFG1	P32317	509 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	YKL075C	P36083	450 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	RIP-Chip
MPS3	YJL019W	LRO1	P40345	661 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	TGS1	Q12052	315 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	COA2	Q3E823	68 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MPS3	YJL019W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	ELO2	P25358	347 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	MKK2	P32491	506 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	FIG1	P38224	298 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	CUE1	P38428	203 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	HOL1	P53389	586 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	APS2	Q00381	147 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	CWC27	Q02770	301 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	STD1	Q02794	444 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	YLR030W	Q07967	263 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	MIM1	Q08176	113 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	MDH2	P22133	377 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	SPO13	P23624	291 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	ERG2	P32352	222 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	MNS1	P32906	549 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	GIS1	Q03833	894 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	IRC19	Q07843	230 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	PRR2	Q12310	699 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	YCR025C	P25352	136 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	COQ3	P27680	312 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	AHT1	P29589	182 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	REC114	P32841	428 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	POP2	P39008	433 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	YJL193W	P39542	402 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	MOB1	P40484	314 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	YFR054C	P43622	192 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	MCH4	Q08268	501 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	ERV2	Q12284	196 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	ISA2	Q12425	185 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	HAP3	P13434	144 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	VMA3	P25515	160 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	TCA17	P32613	152 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	ELF1	P36053	145 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	YEL057C	P39983	233 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	DAD3	P69850	94 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MPS3	YJL019W	RCE1	Q03530	315 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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