RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeastyeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1YCL028W BBP1Q12365 385 aa9.42□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W YPR108W-AQ3E7B3 70 aa9.42□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W TPI1P00942 248 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W CKS1P20486 150 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W YUH1P35127 236 aa9.41□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W CTR2P38865 189 aa9.41□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W POP2P39008 433 aa9.41□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W PAC2P39937 518 aa9.41□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W GLR1P41921 483 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W HSK3P69852 69 aa9.41□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W RFM1Q12192 310 aa9.41□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W QCR2P07257 368 aa9.4□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W STF2P16965 84 aa9.4□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W IRC24P40580 263 aa9.4□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W PEF1P53238 335 aa9.4□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W TEX1P53851 422 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W DPB4Q04603 196 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W RIM9Q04734 239 aa9.4□□□□□ -0.9
RNQ1YCL028W YPC1P38298 316 aa9.39□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W PRM5P40476 318 aa9.39□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W AIR1P40507 360 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W YIR035CP40579 254 aa9.39□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W YNG1Q08465 219 aa9.39□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W SWT1Q12104 458 aa9.39□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W MAG1P22134 296 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W YCR061WP25639 631 aa9.38□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W GLY1P37303 387 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data9.38□□□□□ -0.91not detected
RNQ1YCL028W PIR5P46999 287 aa9.38□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W ECM27P47144 725 aa9.38□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W XPT1P47165 209 aa9.38□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W SBH2P52871 88 aa9.38□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W MRPL22P53881 309 aa9.38□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W HUG1Q6Q5K6 68 aa9.38□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W TIP1P27654 210 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W SSO2P39926 295 aa9.37□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W SWM2P40342 146 aa9.37□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W GEP7P53171 287 aa9.37□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W COA4Q05809 96 aa9.37□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W YCT1Q12235 531 aa9.37□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W YGL194C-AQ2V2P6 80 aa9.37□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W YMR105W-AQ8TGS8 64 aa9.37□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W MRP20P32387 263 aa9.36□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W CWC25P53854 179 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W ECM18Q04623 453 aa9.36□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W YDL086WQ07505 273 aa9.36□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W YFH1Q07540 174 aa9.36□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W YOR292CQ08743 309 aa9.36□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W YOR029WQ12243 111 aa9.36□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W DGK1Q12382 290 aa9.36□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W TFC7Q12415 435 aa9.36□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa9.36□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W YJR112W-AQ3E743 109 aa9.36□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W YHL044WP38727 235 aa9.35□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W PCL7P40186 285 aa9.35□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W TTI2P47168 421 aa9.35□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W YGL262WP53054 175 aa9.35□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W JAC1P53193 184 aa9.35□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W SMM1P53720 384 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W YNR064CP53750 290 aa9.35□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W VPS28Q02767 242 aa9.35□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W ASM4Q05166 528 aa9.35□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W SNA4Q07549 140 aa9.35□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W YOL029CQ08187 201 aa9.35□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W GDH1P07262 454 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W ERG2P32352 222 aa9.34□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W CPR5P35176 225 aa9.34□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W ERV15P38312 142 aa9.34□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W PHM8P40025 321 aa9.34□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W INN1P53901 409 aa9.34□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W YDL009CQ12210 107 aa9.34□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W SPO24Q3E752 67 aa9.34□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W YBR298C-AQ8TGK4 73 aa9.34□□□□□ -0.91
RNQ1YCL028W ATP10P18496 279 aa9.33□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W LSB5P25369 354 aa9.33□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W COQ2P32378 372 aa9.33□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W ISC10P32645 267 aa9.33□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W GEP4P38812 185 aa9.33□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W RPL13BP40212 199 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W YIL012WP40551 113 aa9.33□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W YJR111CP47148 283 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W RRT7Q07829 113 aa9.33□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W RTR2Q12378 196 aa9.33□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W YLR146W-AQ2V2P1 62 aa9.33□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W APA2P22108 325 aa9.32□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W SEC22P22214 214 aa9.32□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W PDC2P32896 925 aa9.32□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W REC104P33323 182 aa9.32□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W IKI1P38874 309 aa9.32□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W NCA3P46955 337 aa9.32□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W WSC2P53832 503 aa9.32□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W IRC25Q07951 179 aa9.32□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W CUE1P38428 203 aa9.31□□□□□ -0.92
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