RNA–Protein interactions for RNA: YOL089C

HAL9, Transcript of Putative transcription factor containing a zinc finger, yeast

Gene HAL9, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HAL9	YOL089C	YGL159W	P53110	370 aa		0.27	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	LSB1	P53281	241 aa		0.27	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.27	□□□□□ -2.37	not detected
HAL9	YOL089C	YLR030W	Q07967	263 aa		0.27	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	AKR2	Q12013	749 aa		0.27	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	CDC8	P00572	216 aa		0.27	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	RSR1	P13856	272 aa		0.27	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	MRX3	P38172	270 aa		0.27	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	ERV15	P38312	142 aa		0.27	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	CUE1	P38428	203 aa		0.27	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YER189W	P40104	122 aa		0.27	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YML096W	Q04489	525 aa		0.27	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	ATG2	P53855	1592 aa		0.26	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	MRPL25	P23369	157 aa		0.26	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	SCM4	P32564	187 aa		0.26	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	RMD6	P39975	231 aa		0.26	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	COX15	P40086	486 aa		0.26	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	COG3	P40094	801 aa		0.26	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	RMR1	P53060	241 aa		0.26	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	GAS3	Q03655	524 aa		0.26	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		0.26	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	ECM13	P38195	257 aa		0.26	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	SNF8	Q12483	233 aa		0.26	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	SPO14	P36126	1683 aa		0.26	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	OAC1	P32332	324 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YBR063C	P38083	404 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	LDB7	P38210	180 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YGL034C	P53186	121 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	GTR2	P53290	341 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	SAY1	P53324	424 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YLR462W	O13556	202 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	TCD1	P38756	429 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YEL075C	P39972	122 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	NUP49	Q02199	472 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	Q0255	P03881	472 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	AYR1	P40471	297 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	TRM9	P49957	279 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	SML1	Q04964	104 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	NEJ1	Q06148	342 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YCT1	Q12235	531 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	MED4	Q12343	284 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	DSE2	P38844	325 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	AIF1	P52923	378 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	PAM18	Q07914	168 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YPL162C	Q12042	273 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	SIR2	P06700	562 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	GPA2	P10823	449 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	FZF1	P32805	299 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	MIC12	P38341	106 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YHR180W	P38868	163 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YKE4	P40544	346 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	MRH4	P53166	561 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	MSH5	Q12175	901 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	STP22	P25604	385 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	PTM1	P32857	523 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	GOS1	P38736	223 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	FCY21	P40039	528 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	CAB4	P53332	305 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	PET117	Q02771	107 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	FAR8	Q05040	523 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	DCR2	Q05924	578 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YLR173W	Q06247	608 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	CSI2	Q08054	341 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	MSA1	Q08471	629 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	DCN1	Q12395	269 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	MSB2	P32334	1306 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	COS2	P0CX12	379 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	COS3	P0CX13	379 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	DBF2	P22204	572 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	PPA2	P28239	310 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YNL217W	P40152	326 aa		0.23	□□□□□ -2.37

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