RNA–Protein interactions for RNA: YKL125W

RRN3, Transcript of Protein required for transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeastyeast

Gene RRN3, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN3YKL125W RIM15P43565 1770 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W CPA1P07258 411 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W YER190C-BP0CX94 160 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W YEL077W-AP0CX95 160 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W YGR296C-BP0CX96 160 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W YPL283W-BP0CX97 160 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W YPR204C-AP0CX98 160 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W MTH1P35198 433 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W MRPS9P38120 278 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W DER1P38307 211 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W TRS20P38334 175 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W SAF1P38352 637 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W PRM5P40476 318 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W IKS1P47042 667 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W YGL235WP53071 178 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W IGO1P53897 168 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W SEI1Q06058 285 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W YDL157CQ12082 118 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W TRM13Q12383 476 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W YOS1Q3E834 85 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W IZH4Q99393 312 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W CDC9P04819 755 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W ANB1P19211 157 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W TY2A-CP25383 438 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W ARO4P32449 370 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W YMC2P38087 329 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W MOH1P38191 138 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W SHE1P38200 338 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W YIL012WP40551 113 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W STE24P47154 453 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W YJR120WP47157 116 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W TGL2P54857 326 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W DAD3P69850 94 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W TY2A-DR2Q03483 438 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W HRI1Q05905 244 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W LDS2Q08218 356 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W RDR1Q08904 546 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W YPR027CQ12079 277 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W UBX3Q12229 455 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W TY2A-BQ12260 438 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W TY2A-OR2Q12293 438 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W TY2A-DR1Q12392 438 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W GEP5Q12393 293 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W TY2A-OR1Q12439 438 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W LAS17Q12446 633 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W ISD11Q6Q560 94 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W DET1Q99288 334 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W TY2A-DR3Q99303 438 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W CUP2P15315 225 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W SPC29P33419 253 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W YBR071WP38243 211 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W YHR127WP38833 243 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W MAF1P41910 395 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W MSY1P48527 492 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W MUP1P50276 574 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W MPP6P53725 186 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W YCT1Q12235 531 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W ATP10P18496 279 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W COX13P32799 129 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W MTR2P34232 184 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W NNK1P36003 928 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W DOG2P38773 246 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W YPT35P38815 214 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W BAT1P38891 393 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W IRC22P40006 225 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W SPC25P40014 221 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W AYR1P40471 297 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W PAU5P43575 122 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W RMD9P53140 646 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W LST7P53237 242 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W COX18P53239 316 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W DIC1Q06143 298 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W LOA1Q06508 300 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W SLM3Q12093 417 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W BSC1Q12140 328 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W VAR1P02381 398 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W GPI12P23797 304 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W OCH1P31755 480 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data4.72□□□□□ -1.65not detected
RRN3YKL125W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W SLC1P33333 303 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W PAN3P36102 679 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W TAE1P38340 232 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W NDT80P38830 627 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W YHR130CP38834 111 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W PSD1P39006 500 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W JHD1P40034 492 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W YNL198CP40166 100 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W RPL13BP40212 199 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W ATF1P40353 525 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W ADD37Q03233 198 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W TMA23Q03525 211 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W UTP15Q04305 513 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W YLR040CQ07988 224 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W ERV2Q12284 196 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3YKL125W PRO1P32264 428 aa4.71□□□□□ -1.66
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