RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	YKL063C	AIM36	Q03798	255 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	MET5	P47169	1442 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	SRY1	P36007	326 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	YBR063C	P38083	404 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	PGD1	P40356	397 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	AIF1	P52923	378 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	USE1	P53146	245 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	MSH5	Q12175	901 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	ERD2	P18414	219 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	GPI8	P49018	411 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	ANT1	Q06497	328 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	MEP1	P40260	492 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	SEI1	Q06058	285 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL063C	YKL063C	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	DAL82	P21705	255 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	BIG1	P38813	335 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.21	□□□□□ -2.38	not detected
YKL063C	YKL063C	PSF1	Q12488	208 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	PBN1	P25580	416 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	MRPL37	P36532	105 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	YAR1	P46683	200 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	YLR126C	Q12288	251 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	RRF1	P38771	230 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	SOK1	P40317	901 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	DOC1	P53068	250 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	SAY1	P53324	424 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	YML096W	Q04489	525 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	DAL80	P26343	269 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	TVP38	P36164	337 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	RIB1	P38066	345 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	YMR007W	Q03675	126 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	SIR2	P06700	562 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	GAS3	Q03655	524 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	TUS1	Q06412	1307 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	EAF6	P47128	113 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YKL063C	YKL063C	REP2	P03872	296 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	YET1	P35723	206 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	IRC22	P40006	225 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	KNH1	P50112	268 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	YKL075C	P36083	450 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	ILM1	P47155	203 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.14	□□□□□ -2.39	not detected
YKL063C	YKL063C	YOR029W	Q12243	111 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	YDL180W	Q12301	547 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	YLR156W	P0CE96	114 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	YLR159W	P0CE97	114 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	YLR161W	P0CE98	114 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	MRPS28	P21771	286 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	PEX17	P40155	199 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		0.12	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	BTS1	Q12051	335 aa		0.12	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	MSF1	P08425	469 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	ABF2	Q02486	183 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	SNZ1	Q03148	297 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	LPP1	Q04396	274 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	YIL177C	P40434	1758 aa		0.1	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	YJL225C	P40889	1758 aa		0.1	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	TFC1	P32367	649 aa		0.1	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	MRPL17	P36528	281 aa		0.1	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	YFL065C	P43539	102 aa		0.1	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	0.1	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	0.1	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	CSM4	Q08955	156 aa		0.1	□□□□□ -2.39
YKL063C	YKL063C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
YKL063C	YKL063C	ATG22	P25568	528 aa		0.09	□□□□□ -2.4
YKL063C	YKL063C	UMP1	P38293	148 aa		0.09	□□□□□ -2.4
YKL063C	YKL063C	VMA22	P38784	181 aa		0.09	□□□□□ -2.4
YKL063C	YKL063C	RSM25	P40496	264 aa		0.09	□□□□□ -2.4
YKL063C	YKL063C	YMD8	Q03697	442 aa		0.09	□□□□□ -2.4
YKL063C	YKL063C	YOL107W	Q12239	342 aa		0.09	□□□□□ -2.4
YKL063C	YKL063C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
YKL063C	YKL063C	YJR149W	P47177	404 aa		0.08	□□□□□ -2.4
YKL063C	YKL063C	TRM9	P49957	279 aa		0.08	□□□□□ -2.4
YKL063C	YKL063C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
YKL063C	YKL063C	DRS2	P39524	1355 aa		0.07	□□□□□ -2.4
YKL063C	YKL063C	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		0.07	□□□□□ -2.4
YKL063C	YKL063C	TIM9	O74700	87 aa		0.07	□□□□□ -2.4

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