RNA–Protein interactions for RNA: YGL103W

RPL28, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L28, yeast

Gene RPL28, Length 450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL28	YGL103W	AGC1	Q12482	902 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	MPD2	Q99316	277 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	MET3	P08536	511 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	FUN14	P18411	198 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	ELO2	P25358	347 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	MXR2	P25566	168 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	AFG1	P32317	509 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	SPT23	P35210	1082 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	EDS1	P38073	919 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	SOL3	P38858	249 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	FLO5	P38894	1075 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	SUR2	P38992	349 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	ELO1	P39540	310 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	YER158C	P40095	573 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	AIM24	P47127	394 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	YJR115W	P47152	169 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	BNS1	P50084	137 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	CUZ1	P53899	274 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	YLR460C	P54007	376 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	AGE1	Q04412	482 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	AVO2	Q04749	426 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	CTS2	Q06350	511 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	TDA6	Q06466	467 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	MHR1	Q06630	226 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	MIM1	Q08176	113 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	HMS1	Q12398	434 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	ISA2	Q12425	185 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	IZH2	Q12442	317 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	TMA17	Q12513	150 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	COA6	Q3E846	104 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	CKA1	P15790	372 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	MRS4	P23500	304 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	LSB5	P25369	354 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	ACP1	P32463	125 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	HOG1	P32485	435 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	MKK2	P32491	506 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	AGA2	P32781	87 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	MNS1	P32906	549 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	YBR197C	P38306	217 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	PEX7	P39108	375 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	IRC22	P40006	225 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	SHR5	P41912	237 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	SPG5	P42933	373 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	MOB2	P43563	287 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	YNR061C	P53747	219 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	CYT2	Q00873	224 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	RSM23	Q01163	450 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	TSA2	Q04120	196 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	FSH2	Q05015	223 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	YDR344C	Q05510	147 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	SCEI	P03882	235 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	SPO13	P23624	291 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	STP22	P25604	385 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	REC114	P32841	428 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	UPS2	P35200	230 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	FAT1	P38225	669 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	SLM6	P38343	150 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	WSS1	P38838	269 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	ATF1	P40353	525 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	PHS1	P40857	217 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	YJR012C	P47087	207 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	ERG25	P53045	309 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	PAU4	P53427	120 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	YNR014W	P53719	212 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	ASM4	Q05166	528 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	YFT2	Q06676	274 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	CTR3	Q06686	241 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPL28	YGL103W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
RPL28	YGL103W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.33	□□□□□ -1.72
RPL28	YGL103W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RPL28	YGL103W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RPL28	YGL103W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RPL28	YGL103W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.33	□□□□□ -1.72

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