RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C ERG2P32352 222 aa2.78□□□□□ -1.96
SUP53tL(CAA)C RAD23P32628 398 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SUP53tL(CAA)C PHD1P36093 366 aa2.78□□□□□ -1.96
SUP53tL(CAA)C YPK3P38070 525 aa2.78□□□□□ -1.96
SUP53tL(CAA)C ERP5P38819 212 aa2.78□□□□□ -1.96
SUP53tL(CAA)C PHM8P40025 321 aa2.78□□□□□ -1.96
SUP53tL(CAA)C RET2P43621 546 aa2.78□□□□□ -1.96
SUP53tL(CAA)C LYS20P48570 428 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SUP53tL(CAA)C USE1P53146 245 aa2.78□□□□□ -1.96
SUP53tL(CAA)C NRK1P53915 240 aa2.78□□□□□ -1.96
SUP53tL(CAA)C YMR102CQ03177 834 aa2.78□□□□□ -1.96
SUP53tL(CAA)C GAL83Q04739 417 aa2.78□□□□□ -1.96
SUP53tL(CAA)C UPS1Q05776 175 aa2.78□□□□□ -1.96
SUP53tL(CAA)C PBP4Q07362 185 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SUP53tL(CAA)C NDE2Q07500 545 aa2.78□□□□□ -1.96
SUP53tL(CAA)C YOL118CQ08259 102 aa2.78□□□□□ -1.96
SUP53tL(CAA)C TRP4P07285 380 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C GRX2P17695 143 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C RFC3P38629 340 aa2.77□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C SBE22P38814 852 aa2.77□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C PAC2P39937 518 aa2.77□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C COX15P40086 486 aa2.77□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C RIO2P40160 425 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C MRX5P47007 382 aa2.77□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C YJL118WP47022 219 aa2.77□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C YGR016WP53209 190 aa2.77□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C HOT1Q03213 719 aa2.77□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C SPC19Q03954 165 aa2.77□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C HEM25Q07534 307 aa2.77□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C IRC23Q08416 157 aa2.77□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C TFC7Q12415 435 aa2.77□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C YGR161W-CQ3E744 92 aa2.77□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C MSS18P08593 268 aa2.76□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C RRP7P25368 297 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C MLF3P32047 452 aa2.76□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C ALK2P32789 676 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C PDC2P32896 925 aa2.76□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C AHP1P38013 176 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C THI2P38141 450 aa2.76□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C MRX1P40050 688 aa2.76□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C ATG18P43601 500 aa2.76□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C TRS85P46944 698 aa2.76□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C RPL9BP51401 191 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C PRM8P53174 237 aa2.76□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C GPI1P53306 609 aa2.76□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C YDR179W-AQ03983 463 aa2.76□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C FSH2Q05015 223 aa2.76□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C RBS1Q05672 457 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C ASA1Q06822 443 aa2.76□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C YOR186WQ08560 144 aa2.76□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C ADK1P07170 222 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C YJL197C-AP0C5P0 93 aa2.75□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C PET122P10355 254 aa2.75□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C PHO80P20052 293 aa2.75□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C PWP1P21304 576 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C YPS1P32329 569 aa2.75□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C REC104P33323 182 aa2.75□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C PDX3P38075 228 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C SWD3P38123 315 aa2.75□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C YBR184WP38299 523 aa2.75□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C TRM5P38793 499 aa2.75□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C NOP16P40007 231 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C AVT6P40074 448 aa2.75□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C DLS1P40366 167 aa2.75□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C YLR152CP54072 576 aa2.75□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C BUD25P85052 153 aa2.75□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C COX12Q01519 83 aa2.75□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C YOS1Q3E834 85 aa2.75□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C AAC1P04710 309 aa2.74□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C ATP7P30902 174 aa2.74□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C PRP21P32524 280 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C YKL075CP36083 450 aa2.74□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C MRPL36P36531 177 aa2.74□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C IMD2P38697 523 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C AGP3P43548 558 aa2.74□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C TRI1Q05024 226 aa2.74□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C MRX9Q07349 420 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C TGS1Q12052 315 aa2.74□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C INP53Q12271 1107 aa2.74□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C WHI5Q12416 295 aa2.74□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C ATG40Q99325 256 aa2.74□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C CUP2P15315 225 aa2.73□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C GAR1P28007 205 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C PEX4P29340 183 aa2.73□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C VMA6P32366 345 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C HYM1P32464 399 aa2.73□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C QDR3P38227 689 aa2.73□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C SSH1P38353 490 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C PRS2P38620 318 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C SIM1P40472 476 aa2.73□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C RPR2P40571 144 aa2.73□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C BUD8P41698 603 aa2.73□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C GNP1P48813 663 aa2.73□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C YGR219WP53307 113 aa2.73□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C FIT1Q04433 528 aa2.73□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C YLR345WQ06137 509 aa2.73□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C MLC2Q06580 163 aa2.73□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C LCL2Q08045 131 aa2.73□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C LYS21Q12122 440 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
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