RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeastyeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPT53YNL093W MCH1Q07376 486 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W IRC13Q08630 104 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YLR126CQ12288 251 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YLR099W-AQ3E798 87 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YIL177CP40434 1758 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YJL225CP40889 1758 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W MRS1P07266 363 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YHR035WP38769 630 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YPT35P38815 214 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W NDT80P38830 627 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W CTF8P38877 133 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YEA6P39953 335 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W MOB2P43563 287 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W RPA43P46669 326 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W RPS10BP46784 105 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W COQ5P49017 307 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W UBP8P50102 471 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W AVT4P50944 713 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YIP1P53039 248 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W DOC1P53068 250 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W HHT1P61830 136 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W COF1Q03048 143 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W CTL1Q03220 320 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W CGI121Q03705 181 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YET2Q04210 160 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W ERP1Q05359 219 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YPR098CQ06089 161 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YPR114WQ06107 315 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W DIC1Q06143 298 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SFH1Q06168 426 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YOL159CQ08300 171 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W PFA4Q12006 378 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W FCY1Q12178 158 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SME1Q12330 94 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W DGK1Q12382 290 aa3.54□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W COX5AP00424 153 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W VAR1P02381 398 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YER039C-AP0CD97 72 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W CPR1P14832 162 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W PHO85P17157 305 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W KAR4P25583 335 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W COX13P32799 129 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W TIR2P33890 251 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W HES1P35843 434 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SDS24P38314 527 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W ARC40P38328 384 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W DOG1P38774 246 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W TRR2P38816 342 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W PEX22P39718 180 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YEA4P40004 342 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W FIS1P40515 155 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W NSE4P43124 402 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W BUD13P46947 266 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W OST2P46964 130 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W AIM23P47015 356 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W GWT1P47026 490 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W FLC3P53121 802 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W PRM8P53174 237 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W MST27P53176 234 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W FHN1P53279 174 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W HHO1P53551 258 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SMX3P54999 86 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W AIM11P87275 137 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W HPT1Q04178 221 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W MCH4Q08268 501 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SCP1Q08873 200 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W MMT2Q08970 484 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YLR118CQ12354 227 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W GTT2Q12390 233 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W NPC2Q12408 173 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YPL119C-AQ3E751 87 aa3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W HRP1Q99383 534 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YSP2Q06681 1438 aa3.53□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W RSF2P46974 1380 aa3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W YLR415CO13578 112 aa3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W STE7P06784 515 aa3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W SAC1P32368 623 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W SCM4P32564 187 aa3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W BCS1P32839 456 aa3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W PRY2P36110 329 aa3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W ANS1P38832 159 aa3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W BAT1P38891 393 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W FAA2P39518 744 aa3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W XPT1P47165 209 aa3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W BXI1P48558 297 aa3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W SLM2P53955 656 aa3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W GPI15P53961 229 aa3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W YVH1Q02256 364 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W SDC1Q03323 175 aa3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W SUT2Q12286 268 aa3.52□□□□□ -1.85
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