RNA–Protein interactions for RNA: YLL055W

YCT1, Transcript of High-affinity cysteine-specific transporter, yeast

Gene YCT1, Length 1,596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCT1	YLL055W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		2.05	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	EHD3	P28817	500 aa		2.04	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	2.04	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.04	□□□□□ -2.08	RIP-Chip
YCT1	YLL055W	AVT7	P40501	490 aa		2.04	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	2.04	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	SNZ3	P43545	298 aa		2.04	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	2.04	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	OST3	P48439	350 aa		2.04	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	UFD1	P53044	361 aa		2.04	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	YGL088W	P53151	121 aa		2.04	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	ALG13	P53178	202 aa		2.04	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	PDR17	P53844	350 aa		2.04	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	AAH1	P53909	347 aa		2.04	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	YPL113C	Q02961	396 aa		2.04	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	PRM15	Q03262	622 aa		2.04	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	YDR114C	Q04597	100 aa		2.04	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	SEI1	Q06058	285 aa		2.04	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	TPO4	Q12256	659 aa		2.04	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	PPH21	P23594	369 aa		2.03	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	2.03	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	ATG15	P25641	520 aa		2.03	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	MIG1	P27705	504 aa		2.03	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	CAF4	P36130	643 aa		2.03	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	FES1	P38260	290 aa		2.03	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	PHO89	P38361	574 aa		2.03	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	YHL049C	P38722	271 aa		2.03	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	POG1	P40473	351 aa		2.03	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	YJR056C	P47115	236 aa		2.03	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	ILM1	P47155	203 aa		2.03	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	YGL159W	P53110	370 aa		2.03	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	GOT1	Q03554	138 aa		2.03	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	YDR124W	Q04608	324 aa		2.03	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	2.03	□□□□□ -2.08
YCT1	YLL055W	TUS1	Q06412	1307 aa		2.03	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	MET2	P08465	486 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	ERG2	P32352	222 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	YCR087C-A	P37263	153 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	POP8	P38208	133 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	SRP14	P38985	146 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	AVT6	P40074	448 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	YJR149W	P47177	404 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	MMS2	P53152	137 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	MRH4	P53166	561 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	LOA1	Q06508	300 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	MRX4	Q12467	430 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	SIR4	P11978	1358 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	QCR2	P07257	368 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	GCN3	P14741	305 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	PHO80	P20052	293 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	UTR5	P32630	166 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	HMT1	P38074	348 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.02	□□□□□ -2.09	not detected
YCT1	YLL055W	YIL012W	P40551	113 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	FAR7	P43592	221 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	BXI1	P48558	297 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	YOR186W	Q08560	144 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	YPL150W	Q12152	901 aa		2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	2.02	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	DRS2	P39524	1355 aa		2.01	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	YOL163W	P0CF20	169 aa		2.01	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	ERD2	P18414	219 aa		2.01	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	2.01	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	MRPL28	P36527	147 aa		2.01	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	YHL044W	P38727	235 aa		2.01	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	RPE1	P46969	238 aa		2.01	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	GTR2	P53290	341 aa		2.01	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	RTC4	P53850	401 aa		2.01	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	2.01	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	YMR279C	Q03263	540 aa		2.01	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	NNT1	Q05874	261 aa		2.01	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	YNG1	Q08465	219 aa		2.01	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		2.01	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	COX5A	P00424	153 aa		2	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	2	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	YCR025C	P25352	136 aa		2	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	COG3	P40094	801 aa		2	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	YER189W	P40104	122 aa		2	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	SYS1	P41544	203 aa		2	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	2	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	YIP3	P53633	176 aa		2	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	2	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	YNL046W	P53956	172 aa		2	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	DID2	P69771	204 aa		2	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	2	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	INM2	Q05533	292 aa		2	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	MDM32	Q12171	622 aa		2	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	1.99	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	KRE1	P17260	313 aa		1.99	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	DBF2	P22204	572 aa		1.99	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	MGT1	P26188	188 aa		1.99	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	CSG2	P35206	410 aa		1.99	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	1.99	□□□□□ -2.09
YCT1	YLL055W	YKR032W	P36127	104 aa		1.99	□□□□□ -2.09

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 48.7 ms