RNA–Protein interactions for RNA: YKL095W

YJU2, Transcript of Essential protein required for pre-mRNA splicing, yeast

Gene YJU2, Length 837 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJU2	YKL095W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YJU2	YKL095W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YJU2	YKL095W	PHO89	P38361	574 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	YER076C	P40049	302 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	ICE2	P40499	491 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	YFH7	P43591	353 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	MRX11	Q03079	207 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	YDR115W	Q04598	105 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	FDH1	Q08911	376 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	MDM32	Q12171	622 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	TRM10	Q12400	293 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	TRX3	P25372	127 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	YBL059W	P34224	193 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	YKR041W	P36134	250 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	YHI9	P38765	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	PPT2	Q12036	173 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	ERG2	P32352	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	NUF2	P33895	451 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	CLG1	P35190	452 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	GGC1	P38988	300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	REE1	P40893	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	ILM1	P47155	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	YGL034C	P53186	121 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	RMI1	Q02685	241 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	MSA1	Q08471	629 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	EMP46	Q12396	444 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	CUP2	P15315	225 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	ARN2	P38724	620 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	AVT6	P40074	448 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	AIM25	P47140	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	INP1	Q03694	420 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	VHS1	Q03785	461 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	NNT1	Q05874	261 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	COS2	P0CX12	379 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	COS3	P0CX13	379 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	TIP20	P33891	701 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	COS4	P43542	379 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	ERV29	P53337	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	PET191	Q02772	108 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	YML108W	Q03759	105 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	YLR030W	Q07967	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	OM14	P38325	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	YAP3	P38749	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	SPL2	P38839	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	PRM10	P42946	383 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	PRM8	P53174	237 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	API2	Q04413	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	ARO7	P32178	256 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	MIG3	P39943	394 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	RRG9	P40156	214 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	CAT5	P41735	233 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	YGL262W	P53054	175 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	COS6	P53344	381 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	YNL184C	P53876	108 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	RDI1	Q12434	202 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	PEX11	Q12462	236 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJU2	YKL095W	SWI1	P09547	1314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
YJU2	YKL095W	CSG2	P35206	410 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	NVJ1	P38881	321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	RSM25	P40496	264 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	IGD1	P43598	195 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	RPE1	P46969	238 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	UBC12	P52491	188 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YGR042W	P53227	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YPS3	Q12303	508 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29 ms